FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_C07.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_C07.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1500
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCCAGGGAAAGTGGCCGGAGCGGGGGTAGGGCTGGTGGCCACCATGGTT80.5333333333333333No Hit
CTTATAAAGTTTGTTGAATAAATGACCAAATTAGGCATGAAAAGATGATC60.4No Hit
CATCTACCTTTGGACAGAACACTCGAAGTTGTGCAGAGAAATGAAAAGCA40.26666666666666666No Hit
CCTGAAATATGTGCATTGTGGAATGCCAATTACACCCCAATAAAGTTATT40.26666666666666666No Hit
ACCCAGACCTGCACGGGCAGCAGCCTTTCTCCCCGCTAAGATCGGCCACC40.26666666666666666No Hit
CTCCAATAGAAATGTCAACTATTCTTGTGGCAGCCAGTTCTTCAATAAGC40.26666666666666666No Hit
ATGGGAGACTGGGCCTTGGAGATTCTAATAATCAGTCCACTTTAAAAAAG30.2No Hit
GTAAGAAAGGAGTGGGAGAGAGAGATGGTAAGGAAAGAGAACAAAGGTGA30.2No Hit
ATTAAATACCATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGC30.2No Hit
TATATAGAGAGAGATGGATCGATCAAAACACATCAAGTTATCCACCTGAA30.2No Hit
GTATGGAAGTGATGAATCACTAAATTGTACACCTGAAACTAACATTACAT30.2No Hit
GTTGTGTATCTTCCCTTCTATTAAGTCTGTTTTCACATTCGCCGCCTTCT30.2No Hit
TACTAACAGAGTGTATAAACCTAAAGTTGTTGAAGCTTTACAAGGAATGT30.2No Hit
GAGCCCACACTGCTCACCTCTGGAAAGAGAAAAGAGGCCGTGAGCCCAGC30.2No Hit
CCTACATATATGCACACACATAAATCCCAAAATAAAATGCTAATGGCAAC30.2No Hit
GTCTTTAATTGGGAAATGAAATATTGTTGTTAACTGCCCAACAACAGGTC30.2No Hit
CTTCTGTTCCTAATATATGTGTTTTCCTCTGGTTACTTTTAAGATTTTAT30.2No Hit
ATGCAAATGTCTGTTATCTTGTGGTGATGGTTTCAGGGATATATATAGAG30.2No Hit
AAGCAGGACATCGAGGACCAGCTCTACAAGCTTGAGTCAGACAAGCGCCT30.2No Hit
ATATATGTGTTTTCCTCTGGTTACTTTTAAGATTTTATCACTGGTTTTCA30.2No Hit
GGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTCCGTGCTATAGTCGGA30.2No Hit
TCTTTATCCAGTGTGTTGAAGTTCTACCTCAGACCCTCACGAACATTTGT30.2No Hit
ACCATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTC30.2No Hit
TACTGGGGGAGCATGGGCTGCTGGGTGGCGGAGCCATTGGGATACTGTGA30.2No Hit
GAGCCACCCAGGCACCCTTTTATATCTGCACTCTTCTGTTCCTAATATAT20.13333333333333333No Hit
GTGGCTACCTGTTCCAAATACCAGAATTACATCATGGAAGGTGTGAAGGC20.13333333333333333No Hit
GTTTCCAGCAACCTGTTGTGTATCTTCCCTTCTATTAAGTCTGTTTTCAC20.13333333333333333No Hit
TATAAAGACTGTGACATGATCAGACTTGCGCTTTAGAAAGCCGACCTTTA20.13333333333333333No Hit
GTGCTGGCTTTGTCGTGTCTCGTCATTTTTGATTAGAGGTTGGACATCAT20.13333333333333333No Hit
CCCAGGCACCCCTACCCTCTTCCTTTAAAGAGCTGCCACCACCTCTCTTT20.13333333333333333No Hit
GATATATATAGAGAGAGATGGATCGATCAAAACACATCAAGTTATCCACC20.13333333333333333No Hit
CTCCAAGAGTTCTCAGTTCCTCCCTCCCTTGTCTCTGCTCCTGGGACTCC20.13333333333333333No Hit
GTGGAATGCCAATTACACCCCAATAAAGTTATTTTTAAAAAGCTTAGGAT20.13333333333333333No Hit
CTGCTCCAGTCCGTGCTATAGTCGGAACCACTGTGCAATCCTGCCAGCAA20.13333333333333333No Hit
GTTGTTAACTGCCCAACAACAGGTCGTAAGGTCTCCACTGAGGCTCTCCC20.13333333333333333No Hit
GGAGAGAAGACTGGTGTTGGGGCCACCCTTAATTAAAGAAGGAACTGAGC20.13333333333333333No Hit
TCCCTAGGAAGAGCAGTCCATGCTAGACTATGTGATGTTCCAGCAGAGAT20.13333333333333333No Hit
TTCTAGTACTGAACAAATCTTGACTTTCTTTGGAAAAGCTGAACAAAAGA20.13333333333333333No Hit
GGCAGAGAGGCAGGCAGAGAGAGAGAGGAGAAGCAGACTCTTTGCTGAGC20.13333333333333333No Hit
AAGCAATAGTATGTGAACTGCCACAAGAAACCTCTCCAACATTGCTAATG20.13333333333333333No Hit
CCATAAAACATTCTTTTTTCACATACCACGGGCCTGAAGGCTCCTGAAAA20.13333333333333333No Hit
GGTGTGAGTACTCCTGCGAGGGCACTGTCCAGGGAAAGTGGCCGGAGCGG20.13333333333333333No Hit
GTAGTAAGATGTTTGGCATGAAACTTTGGCAGCTAAAATAGTTGTGTGCT20.13333333333333333No Hit
CTGTTAGTATCTCCATGGCCAAGTTTGCCATTGTCTCCTCCTCCAAAAGA20.13333333333333333No Hit
CCGGTGCCCTTCCTGCAGAGCGTCCCCCTCTACCCTTGTGGCGTGAGCAG20.13333333333333333No Hit
TGGGAGAACTGTATGGTCTTTTGGAGGAGGAGACAATGGCAAACTTGGCC20.13333333333333333No Hit
GTCTGGAGGAGAACCTTCAGGCTGCTACTACAAATGTTCGTGAGGGTCTG20.13333333333333333No Hit
GGGGATGTGGGGGTAAAAGACAGAAGGTAGAAGGAAAAAAGGAGAAAAAA20.13333333333333333No Hit
GCCGCCATACTGGGGGAGCATGGGCTGCTGGGTGGCGGAGCCATTGGGAT20.13333333333333333No Hit
GCCCAGGAGACTCCACAGGAGAATGGAATGGAGATCATGCTGTCTCTGTC20.13333333333333333No Hit
CCAATAAAGTTATTTTTAAAAAGCTTAGGATGTGACTTCGGGCACCCAGA20.13333333333333333No Hit
AGCTTATTCAGGGCCCTCTGCAGGGAAAGGTAGTTGTTTGTGTGTCTGCT20.13333333333333333No Hit
ACCCAGGGAGGTCAATAAAGTTTGAAGATTCTTAATTGACTTGATAAGGT20.13333333333333333No Hit
CCTTCCTTCTCTTGGGAAAGGAGAAGGCGGCGAATGTGAAAACAGACTTA20.13333333333333333No Hit
CTACTATAAATGTTTAGTGCTGTAAAATTTCCCCTAAGTACTGCTTTAGT20.13333333333333333No Hit
CAAGAGATGTGAGAAAGGCCACCCATGAGTAAAAGCTCCTCTAACCTCAC20.13333333333333333No Hit
TCAGGGAAGGCCGTTGAGTGCTTGCGCTTTTCCGCCCCAGAGCTGCTCAC20.13333333333333333No Hit
GAATATAAGAGAATACAAATAGGCTAGGTCATAAACGATCTTGTAAGTTA20.13333333333333333No Hit
GATTATTATTACTGGAGTCCAAATTGGAAGCCAAAACACTTTATTTCCTC20.13333333333333333No Hit
TCAACACACTGGATAAAGAAAAGGATACGCAAAAGAAGCGAACGGAAATT20.13333333333333333No Hit
GATGATCAAAGTCACTAATGAAATTCAACTTGAATCCATGTCCTCTTGGG20.13333333333333333No Hit
GAACATGACAGAACCATTGCATAGATTGGAATCTTTGTTTGTTGTATTTT20.13333333333333333No Hit
GGATGTGACTTCGGGCACCCAGAGCAACATCCTGGTTTGGGAGCTACAGA20.13333333333333333No Hit
GTGCAGGAGCAGGTGCAGGAGCAGTGGCAGCAGCAGGAGCAGCAGCAGGA20.13333333333333333No Hit
GCTCAAGGTTCATCACTTGCTCTAGTAACAGTGGACCTGTGCCCATCTGC20.13333333333333333No Hit
GTGCTATAGTCGGAACCACTGTGCAATCCTGCCAGCAAATGGGGGTCAAG20.13333333333333333No Hit
CGCGTATGCTTGCCCACCTACATGCACACGGGCAACTCAGCCCTGAAAGT20.13333333333333333No Hit
GTGGATTCCATTGGGATGTGTTTTCGCACTTGGGAGTATTCTGGTCCTTA20.13333333333333333No Hit
ATATAAGAGAATACAAATAGGCTAGGTCATAAACGATCTTGTAAGTTAAG20.13333333333333333No Hit
CTCACAGCTGGGGCAGGAGATTGTGGCCATCTTGGAGTCTAGTCGTTTTC20.13333333333333333No Hit
GGTGAGGAGTGGTTAGGTTCACCCTCGGAAGGAGGAATGGCCTTGGCGAG20.13333333333333333No Hit
ATTTGGTTCTAAAATGTGACTTGTCTTTAATTGGGAAATGAAATATTGTT20.13333333333333333No Hit
GAACAGACGAGAATCTTGCGGCCGCCATACTGGGGGAGCATGGGCTGCTG20.13333333333333333No Hit
GATACTAACAGAGTGTATAAACCTAAAGTTGTTGAAGCTTTACAAGGAAT20.13333333333333333No Hit
CCCCTACCCTCTTCCTTTAAAGAGCTGCCACCACCTCTCTTTACTTAAAC20.13333333333333333No Hit
ATGCTAGAAGGCCCCTTCAGCACACCGGTGCCCTTCCTGCAGAGCGTCCC20.13333333333333333No Hit
ACACCAAGTCTGTGAAAATCCTGATGGACAGGACCCAGACCTGCACGGGC20.13333333333333333No Hit
CTATTGAAGCTGGACAATACTGCACTTTTGTTATTTCTACGGATGGCTCT20.13333333333333333No Hit
ATATTGGACTGGGTTGCAAAATGAGTTGAGGAAGTAGAAACAGTGATCAT20.13333333333333333No Hit
ATACTGGGGGAGCATGGGCTGCTGGGTGGCGGAGCCATTGGGATACTGTG20.13333333333333333No Hit
CCTTTAAAGAGCTGCCACCACCTCTCTTTACTTAAACCCAAAACCCTCAA20.13333333333333333No Hit
CCGTATGTCTTTCCTTCTTTACTTTTTAGTTTGCAGCTGGTGCTTTTTGA20.13333333333333333No Hit
GTGTACCTGTTAAAAAAGCTTTCAGGGGTGCCTGGGTGGCTCGGCTGGTT20.13333333333333333No Hit
GCTCTACAAGCTTGAGTCAGACAAGCGCCTGGTGGAGAACACCAAGTCTG20.13333333333333333No Hit
CACTTGGGAGTATTCTGGTCCTTACTTCCTCCAAGAGTTCTCAGTTCCTC20.13333333333333333No Hit
GTCTCAGCTCTCCTGGCTGGAAAAAGCTCAGAGCTCTCGATTCTGTGCAA20.13333333333333333No Hit
GAAATATATTGGACTGGGTTGCAAAATGAGTTGAGGAAGTAGAAACAGTG20.13333333333333333No Hit
ATTATACACATGGGGTGAAGGAGACTTTGGAAGATTAGGTCATGGAGATA20.13333333333333333No Hit
GAAGTGGACCCAGAAGGAAGATTTCTGGGTCACGTAATAGTTCTATTTTT20.13333333333333333No Hit
CCTTTTTCCCTCCTTCCTTCTCTTGGGAAAGGAGAAGGCGGCGAATGTGA20.13333333333333333No Hit
CCCATTGACAGGGAGAGGCATGGCCTTTATGAAGCCTCACCAGTCAGAAG20.13333333333333333No Hit
GTGCCCTCGCAGGAGTACTCACACCCGCTCCCGCCCACACCCTCCGTCCC20.13333333333333333No Hit
ACACAGATCGAGGTGAACGAGTCACTGAAAGCAGGTTTCACCACCTCCTT20.13333333333333333No Hit
CTTCTAAAGGATCTGATGGTCACACCTTAGCTTTTACAACAGAAGGAGAA20.13333333333333333No Hit
CAACAGGTTGCTGGAAACATAGGAAACCAGAAAATGGGTATCAATATCCA20.13333333333333333No Hit
GTGTTTTCCTCTGGTTACTTTTAAGATTTTATCACTGGTTTTCAGTTCTT20.13333333333333333No Hit
GTAGTAATCCATGCAAGAGATGATGGAAGGAAATGGAAGCGCTGGAGGTA20.13333333333333333No Hit
GTACAATCTGTTTCAGGAAGAAGGACAAAGAAATATATTGGACTGGGTTG20.13333333333333333No Hit
CTGTTAGAGCTTGTGGTAAAGGCAGCTATGGGAGACTGGGCCTTGGAGAT20.13333333333333333No Hit
GCCCTGACCTGGCCCAGAGGGCCGGCAGAGCGGGGTCTGTGTGTTCCCTG20.13333333333333333No Hit
GCTCCAGTCCGTGCTATAGTCGGAACCACTGTGCAATCCTGCCAGCAAAT20.13333333333333333No Hit
GTGCAATCCTGCCAGCAAATGGGGGTCAAGGGGATGTGGGGGTAAAAGAC20.13333333333333333No Hit
CTGTAGGGTGATACCAAAGGTCTATGTGATAATTTTTGTTACGATAAGTA20.13333333333333333No Hit
GCAGGTAAGAGGGGGACGCAGAGAGGGAGAGGCAGACTCCCGGCTGAGCA20.13333333333333333No Hit
GTTTGTACTTATCTCTTCTCTTGGTTGTGGGCCACGTGTGCTGGCTTTGT20.13333333333333333No Hit
CTTCAGATGGCTCCTTTTAAATTTCCAGTTGAACCACCCACATATTTTTT20.13333333333333333No Hit
GAGATTGATTATTGATTAGTTACAGCTTTGCCATCTGCCATAAAAATACA20.13333333333333333No Hit
GTATGGGGCAGCGGGCACAGCCAGCGGCGAGGGCCAGTCAGGGCAGCCCC20.13333333333333333No Hit
GTTACTATCTCCATGACCTAATCTTCCAAAGTCTCCTTCACCCCATGTGT20.13333333333333333No Hit
GTAATAATACTGACCACCTCCCATTCTTGGGACAAGACTGCTAACCTCTT20.13333333333333333No Hit
CTATTGCTTTGTCTAAAGATGGGAGAACTGTATGGTCTTTTGGAGGAGGA20.13333333333333333No Hit
TTGATACCCATTTTCTGGTTTCCTATGTTTCCAGCAACCTGTTGTGTATC20.13333333333333333No Hit
TCCTGAATGAGGTGGCCAAGAAGGAGAAGCAGCTGCGGAAGATGCTAGAA20.13333333333333333No Hit
GGCCACCATGGTTGGCCACGGAAGAACAGTAACAGTTGTCCACAGAACAG20.13333333333333333No Hit
ATAATGCTCCTGCCAGCACTGCTAGCTGATGCACATACTCACAGAATGCT20.13333333333333333No Hit
AGTTGAACCACCCACATATTTTTTCACATTTTACTGGACTTGTTTTTCTC20.13333333333333333No Hit
ACTTGAATCCATGTCCTCTTGGGTTTTTTCAGTAGCGTTTGCAAGTGCAT20.13333333333333333No Hit
GTACCCCACATTCTACTCCGTAGAAGCATATCCAGTTTGCGGGAATGTAA20.13333333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)