FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_A09.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_A09.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences120
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTGTATAAGTTTGGTCCTCCATCTGATACTAATAGCCCTACCTTTGATTG21.6666666666666667No Hit
TTTAATGTCAGTGCTCTTATTAGATAGCCTCTCTTATTCAGTCTTTGTTT10.8333333333333334No Hit
GTGGGAGACTGTGGTCGGCACGCTGGCGCATAGTTCCTGTAAGCTCACAT10.8333333333333334No Hit
GAGCAGGCCTCGTCTTGCCCTCGCTACCTCCTTCAGACATTCCCAGACTC10.8333333333333334No Hit
GTGGTATTCGTTTTCATGTTAGCAACGCCACCTACCTGGAGGATTTAACT10.8333333333333334No Hit
GTACTTTTCCTCAGAAAGCTCCCAGGAGAAAAACAAGTCCAGTAAAATGT10.8333333333333334No Hit
GTGTCGAGGCCCATGTTCCTATATGTGAGAACCAATGGAGACTCCAAGAT10.8333333333333334No Hit
AAATAAGACAGGGACATTTGAATTCACAAGCTTTTTTTATCGCTATGGAT10.8333333333333334No Hit
ACGGAAAACAAACCTGTATGGGTTCATTATAAAAGGAAGGTCTCATTTGA10.8333333333333334No Hit
AGGCAAGTTAAAAAGAAGGGCTATAGCAACACCTGGGATGCAGATTAGAG10.8333333333333334No Hit
CTTTATATCATCCCGTCAGGCCCCCTCAAAGCCGAGATCGCGCAGAGACT10.8333333333333334No Hit
GCGGAAACGGCAATGAAAGAATATGGGTAAGATCCTCAACTCTACCCTAC10.8333333333333334No Hit
GTGCTAACGGGCAACCTCCAAACACTGAAAATAAGAGTACATGAAGGGTA10.8333333333333334No Hit
CTTCATGTTCTTTGTCCTTGGGATCTTCTCTTCATTTTCAATGTCCTGTA10.8333333333333334No Hit
AGGTTTGTAAAATTGCTCCCTTGATGGTGGCGTACATGCTAGAAAGAGAA10.8333333333333334No Hit
CCTGTATGGGTTCATTATAAAAGGAAGGTCTCATTTGAGAAATGATACTG10.8333333333333334No Hit
CTAAGACCACTGTGGACCATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGA10.8333333333333334No Hit
GTATTACATCAAATATGTAGATTTTGGGTTGTATAGACGTCTTAACAATA10.8333333333333334No Hit
ATGCTAGAAATTCCAACCGGTCTCCTATATGAACTGCTAGGGAAAAATTT10.8333333333333334No Hit
ACAATATACGGAATCTTCACATTCCTGAAGTCTGCTTAAAATGGGAGCTA10.8333333333333334No Hit
CCTATGAGGTCACCTTTACAATGTTTTATTATATTTGCCATATATTTGAA10.8333333333333334No Hit
CCCCTGGAAGGACAAATCTTCTGGCTTTGCACTTTCCATCATTCTTATAA10.8333333333333334No Hit
CTACAAGACTCTCCATGACCTTGAGAGCCCTTCTCAGTCATTCTCTACTA10.8333333333333334No Hit
CGGTATTCTCTTCTAGTGACCACATACCTCAGCGATGCTGGAAACATGAG10.8333333333333334No Hit
ATCTGTGGGGGCGTGGTGTCGTCCTCAAGAATGGTTGAATTTTGCCGTTC10.8333333333333334No Hit
GCACTGACTCAGGGCCATTGATCTCCCACATCATTGATGACGATTAAGTT10.8333333333333334No Hit
TCCCTAGTCTTGCCATTTTGTTTGAGAACATTATGGGTGCCATGCTCAGG10.8333333333333334No Hit
CATCTACATAGGCTCTAAAGGTTTCAAGGCTGGTGAAGTTCGGTGGGAGC10.8333333333333334No Hit
TAAAAAAAGCTTGTGAATTCAAATGTCCCTGTCTTATTTATATAGGACGT10.8333333333333334No Hit
ATCCTGAGCATTGCACCTATAATGTTCTCAAACAAAATGGCAAGACTAGG10.8333333333333334No Hit
CCAATCATCCGACGATTTTGCTCTCATAGTGAATGCACCAAACCATGAGG10.8333333333333334No Hit
TTCTTGCCCTGCTCTCTTCGTCAAGGGTGTAGTCCGCTTTGGTGGCCATC10.8333333333333334No Hit
CAACTGATCCCCTCAGAATGAGTGCTGACCGTGCCAGGAAAATGAGGTCT10.8333333333333334No Hit
CCTTTATCTCATGAGTTTCATGAGTTTCAATCCACTAAACATCTCCTGTC10.8333333333333334No Hit
GTCCCAGGTTAGAGAGCCCAGCTTTGAAGGCCAAGTTCCAGCAGTTTTCG10.8333333333333334No Hit
CTTTGATTAACTTCGATATACATAATTCTATGGTTTGTTCAAAGGCCGTT10.8333333333333334No Hit
TTCCTCTTGGAATCACTTTCTTTCCTCTTATGAAACTTGATACTCTTAAA10.8333333333333334No Hit
GTATTTATGTACACTCCCTTCATTATGTATTCAGTAGCCCTTCAGTGGGA10.8333333333333334No Hit
GATCTCTAGCAAGCTGGGTCCAAAATGAATTCAATAAGGCATGTGAATTG10.8333333333333334No Hit
GGATTATAAAGTGAGCATCTTTTTGTTCTCTTATATGCCCATCACAGACT10.8333333333333334No Hit
CACCAGAACTGTGGGAACACCTGTGCAGGGACCCACAGTCAGCCATGGTG10.8333333333333334No Hit
ATCATATTCCATGCTTTTGGCTGGACCATGGGCTGGCATTACCACAGCAT10.8333333333333334No Hit
GGCCCAGGGCAGGAGGCAGGGCTGAGAGGGGAGCAGCGGACCACGGGGCC10.8333333333333334No Hit
GAATCAACATGAGCAAAAAGAAGTCCTATATAAATAAGACAGGGACATTT10.8333333333333334No Hit
ACAACAGTCAGTGTGCAAATCAGTGTTCTGGTCTGTTCTGGTTTTGCATG10.8333333333333334No Hit
CCCCTTTGGCTTGTGTTGAGAATAGAACGATTCCTCTTGGGAATCCAGGA10.8333333333333334No Hit
ACTGACATCAGAGTCACAGCTGGCAATAACAAAAGAGAAGAAAGAAGAGC10.8333333333333334No Hit
AAACAAGGACTGAATAAGAGAGGCTATCTAATAAGAGCACTGACATTAAA10.8333333333333334No Hit
GACCCATTAGCATCTCTCTTGGAAATGTGCCACAGCACACAGAGTGGAGG10.8333333333333334No Hit
GGGCTACTGTTTAAGGTCTCCAACATCTTTGCCGTCATCAAAGTGTACGT10.8333333333333334No Hit
ATTCCCCAGTTCTGGAAAAGCACTTTTGCATCTTTTTGGAAATGCCTCAA10.8333333333333334No Hit
ATGTATTCAGTAGCCCTGCAGTGGGACACTTCTGCTGTAAAATAGTTCCT10.8333333333333334No Hit
GTTTCAGCCTTGCTTTCACCTGGCAAGCTTGCCCGGCCCTGGAGCTCTGC10.8333333333333334No Hit
AATCCATAGCGATAAAAAAAGCTTGTGAATTCAAATGTCCCTGTCTTATT10.8333333333333334No Hit
GGAGCATGGCCACCAGCAGGATGGCATTCCACAGCTGCTGCAGGGGCTTC10.8333333333333334No Hit
GCTTCACATAGCCCCCCAAGATCGAAGGTTCCAGGTTCCAGGTTGTCCCT10.8333333333333334No Hit
GTCTTATAGTGAAAAGCCTAGTTTTGATTCTTCCCCTGCTCTCTTCGTCA10.8333333333333334No Hit
ATCTTCTGGCTTTGCACTTTCCATCATTCTTATAACTTCTGTTCGCATGT10.8333333333333334No Hit
CCCATTCCTTGATCGGCTCCGCCGAGATCAAAAGTCCTTAAAAGGAAGAG10.8333333333333334No Hit
GTTGTATAACATTGTGGGATCTTGTGACCATTGAATTTTCACAATTTCCC10.8333333333333334No Hit
GAACATAGTACTGAAAGCGAACTTCAGTGTAATCTTTAACCGATTAGAGA10.8333333333333334No Hit
GCCTTGGTCATGCAATCCTCCTGTGAGAATACCATGGCCACAATTATTGC10.8333333333333334No Hit
GCGCCGGCGCTCGCCAGGGCTCGGACACGGTCCGCACACAGGCAGGCTGT10.8333333333333334No Hit
TATTTGGACAGTGTCAAATGTCCCAAGCACATCCCGCATTTGCTGGAACA10.8333333333333334No Hit
AAACAAGGGTAGATAAACTAACTCAAGGTCGCCAGACTTATGATTGGACA10.8333333333333334No Hit
GTTCCCATCCTGTTGTATATGAGGCCCATGCAACTGGCAAGTGCACCAGT10.8333333333333334No Hit
GGGGGGATGATGGGCATGTTCACCATGCTTAGTACGGGCTGGGGAGTCTC10.8333333333333334No Hit
GTAGCAGGCCAGGGACTAGAATCTGGGTCTCCTGCCTTTCAAGCATCCCA10.8333333333333334No Hit
TTGGCACAGAGGGGGAGGGGACCACAGCCAGAGACTCCCCCACAGCCACC10.8333333333333334No Hit
CATCGAATAACAGAGATCCATTCCATCCTCCTTCATCTTGAACATAAGCC10.8333333333333334No Hit
ACCAAGAAGATGGTCACGCAAAGAACAATAGGGAAGAAAAAACAAAGACT10.8333333333333334No Hit
ACTCGAAGTCGACCCTGGCATCAATCCGGGCCCTAGACACCATGGCCTCC10.8333333333333334No Hit
ATATTTGTATTTTTGTCGGTATCAAGCAGTTTTTTGATTTCTCTTTCAAT10.8333333333333334No Hit
CCACATTCCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACA10.8333333333333334No Hit
CGTATTTATGTACACTCCCTTCATTATGTATTCAGTAGCCCTGCAGTGGG10.8333333333333334No Hit
GGCTAAAGACAAGACCAATCTTGTCACCGCGGACAAAGGGAAGTTTAGCA10.8333333333333334No Hit
GTTTAGAATCCAGATGCTCGCCTCCCTTCTCCTGCATGGTGGCATCGTCG10.8333333333333334No Hit
CAACAATAGAGAGGATGGTGCTTTCTGCTTTTGATGAGAGAAGAAATAAA10.8333333333333334No Hit
ATACAAGCAGGAGTGGACAGATTCTACAGGACCTGCAAGTTAGTGGGAAT10.8333333333333334No Hit
CTCTAGAGCTCCTGGGAGCTACATTTGCGGACAAAAAGAGAGATCTGCTT10.8333333333333334No Hit
ATCAAGTTCTATCCAGCTTGAATCAGTCAATTCACATGCCTTATTGAATT10.8333333333333334No Hit
CCCATAATGTTCTCAAACAAAATGGCAAGACTAGGGAAAGGGTACATGTT10.8333333333333334No Hit
TTTCCAGAACTGGGGAATTGAATCCATCGACAATGTGATGGGAATGATCG10.8333333333333334No Hit
CACCAAACCATGAGGGAATACAAGCAGGAGTGGACAGATTCTACAGGACC10.8333333333333334No Hit
GGATAAGAGTCAGCAAAATGGGAGTAGATGAATACTCCAGCACGGAGAGA10.8333333333333334No Hit
ATTATTGCCTCAGCAATTGACTGCTCGTCTCTCCCGCTTAATATCAACTG10.8333333333333334No Hit
GTCTGAAATTAAGTATTGAAGACCCGAGTCCCGAGGGGGAGGGAATACCA10.8333333333333334No Hit
CAGTGATGCTGTGCCATCTATTAGAAGAGGCCTTATTTTCTCAATATTCT10.8333333333333334No Hit
TTGAAGAATCCCACCCAGGAATATTTGAGAATTCATGCCTTGAAACAATG10.8333333333333334No Hit
CCTATATGAACTGCTAGGGAAAAATTTCTCGAATAGATTGCAGCACTTCT10.8333333333333334No Hit
GATCTTCATGATCTCAGAGAACTCTTCTTTCTTGATCCGTCCAGACTCGA10.8333333333333334No Hit
GGGTAGGTCTGCGCATGCTGAGCGGACAGCAATTGCATTAGCGTCCCCCT10.8333333333333334No Hit
ATGTCAATCCGACTCTACTTTTCCTAAAAATTCCAGCGCAAAATGCCATA10.8333333333333334No Hit
CCACGTCAGTATCATTTCTCAAATGAGCCCTTCCTTTTATAATGAACCCA10.8333333333333334No Hit
GGTCGAAAGGTTGAAACATGGTACCTTCGGCCCTGTCCACTTCAGAAATC10.8333333333333334No Hit
CTTCGTAAGAGAAGAGGAAGCTGATTACAGGGAGGTTACTTTAGAAGGGA10.8333333333333334No Hit
GGGTAATGAACTGTACTTGTTGTTGGGCCATTCCTATTCCACCATGTTAC10.8333333333333334No Hit
GTATCCTCAACCCTGATCCTCTCACATTCACAGTCAATGAGGAAAATTGC10.8333333333333334No Hit
CAGTAAGTGAGAACTCCATACTTACAAAGTTCACCACATCAGTATCATTT10.8333333333333334No Hit
CCGCATAAGTATGTCCTGGAAGAGAAGGAAATGCTGAAATTTCTCCAACA10.8333333333333334No Hit
GCTTAAGGCAAACACTTAATCAACTGAGCACCCAGGTGCTCTGACTAATT10.8333333333333334No Hit
TTTCTTGACTGATGATCCGCTTGTCCTTTAGAAAGTGAACCCACCAAAAC10.8333333333333334No Hit
CATTAAACAGAAATCAACCGGCAGCAGCTGCATTGGACATCACCATAGAA10.8333333333333334No Hit
ATTCGACACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCT10.8333333333333334No Hit
CCCTTGATGGTGGCGTACATGCTAGAAAGAGAATTGGTCCGTAAAACAAG10.8333333333333334No Hit
ACTGAGGAGAAGGAGAAGGAAGACTAGTATGAAGAGTTTAGAAATTAGGA10.8333333333333334No Hit
GGTAGGTCCATTCCATATGAGCTACAACTCCTCGCATGATTGTAGACAAT10.8333333333333334No Hit
GGGTGACTCTCCGATTGGCCATGTTTCCGATTTGTTTTCAAAGAATTCCT10.8333333333333334No Hit
CTCTTCGCCTCTTTCGGACTGACGAAAGGAATCCCATAGACTCCTACTGG10.8333333333333334No Hit
GCAATGAGATACCCAATTACAGCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCC10.8333333333333334No Hit
CTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGTCCTGCACACTTTCCCAATAGA10.8333333333333334No Hit
GTTTATTTTCTGAGACTCGAACCGTGTTACCATTCCATTCAAGTCCTGCG10.8333333333333334No Hit
CACTAGTAGAGCCGGGAGACAAAATAACATTCGAAGCAACTGGAAATCTA10.8333333333333334No Hit
ACAAACAAGGGTAGATAAACTAACTCAAGGTCGCCAGACTTATGATTGGA10.8333333333333334No Hit
TTCCTCCTCCAATCTGTGTGATGTGGCAGATTTCCAAGAGAGATGCGAAT10.8333333333333334No Hit
ATTGAGAGCCTGATTGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.8333333333333334No Hit
CTGTAGAGACCCATTAGAGCACATCCAGAAACTGATTGCCCCCAGGGAGA10.8333333333333334No Hit
GAGAGTGGTAGTGAGTATTGACCGATTTTTAAGGGTTAGAGATCAAAGAG10.8333333333333334No Hit
CTTCAGGAATGTGAAGATTCCGTATATTGTATAAGTTTGGTCCTCCATCT10.8333333333333334No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers