FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_A01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n01_FD_S3_R1_A01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCACTGACATTAAATACGATGACCAAAGATGCTGAGAGAGGCAAGTTAAA14.166666666666666No Hit
TACTGGGAGCCCAGACTGTTCAAGCTTTTCGCAAATGCTCCTAGCTAAAG14.166666666666666No Hit
GAGGCGAAGAGACAATTGAAGAAAAATTTGAGATTACAGGAACTATGCGC14.166666666666666No Hit
CATGAAAACAGAATGGTGCTGGCTAGCACTACGGCAAAGGCTATGGAACA14.166666666666666No Hit
AGATTCTACAGGACCTGCAAGTTAGTGGGAATCAACATGAGCAAAAAGAA14.166666666666666No Hit
GGGTGGTCTGAAATTAAGTATTGAAGACCCGAGTCACGAGGGGGAGGGAA14.166666666666666No Hit
GGACAAGTTAAATTCATTATTTTTGCCGTCTGAGTTCTTCAATGGTGGAA14.166666666666666No Hit
CCTCAAAGGAAAATTTCAAACAGCTGCCCAGAGGGCAATGATGGATCAAG14.166666666666666No Hit
GAGCCACACAAATGGGAAAACTACTGTGTTCTTGAAATAGGAGACATGCT14.166666666666666No Hit
GGCAGGATTTATTTGCAACTGATACCCTCAGAATGAGTTCTGACCGTGCC14.166666666666666No Hit
TCTTTCTTCTCTTTTGTTATTGCCAGCTGTGACTCGGATGTCAGTATTGT14.166666666666666No Hit
TGCTGGGAGAAGATGAACACTCCAGTATGAGAAGTCAGAAATCATGATGT14.166666666666666No Hit
ACATAATGGACTCCAACACCATGTCAAGCAATAAGGTAGACAGTTTCCTA14.166666666666666No Hit
GCCACTCTTGTTGGGAAACAAATCGGGGAATGGATCTTGAAAGAGGAATC14.166666666666666No Hit
GTGTTGGCCCCAGTGATTGTGACAGATATCTCTGTGTCTACTCAATTAGA14.166666666666666No Hit
GTATAACATTGTGGGAACTTGTGACAAATGAATTTAAACAATTTCCCAAT14.166666666666666No Hit
GTGTTGACTAGCACTGACTCAGGGCCATTGATCTCCCACATCATTGATGA14.166666666666666No Hit
AACAAATGGAGACTGGTGGGGAGCGCCAGGATGCCACAGAAATCAGAGCA14.166666666666666No Hit
AAACAGAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAAAGTCTACGACAAACACAG14.166666666666666No Hit
GGGTCAGCAGCCCCATTAGCATCTCGCTTGGAAATGTGCCACAGCGCAAA14.166666666666666No Hit
GGGTTATAGAGGCTATGGCTTTCCTTGAAGAATCCCACCCAGGAATATTT14.166666666666666No Hit
AGAGACAATTGAAGAAAATTTTGAGATTACAGGAACTATGCGCAAGCTTG14.166666666666666No Hit
CTCTTCGCCTATTTCATCAGGTGCTATCAATCTTTGTTGTGGCACTATCC14.166666666666666No Hit
GGATCACTTGAATCGCTGCATCTGCACTCCCATTCGCTTCTGGTAGGCCT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)