FastQCFastQC Report
Tue 23 Aug 2022
HNCMMDSX3_n02_chi_051.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCMMDSX3_n02_chi_051.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC38

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TACTTCGGTAGATTAGTTGGAACGATTGATGATTTTGAGTTAATTGAACG28.333333333333332No Hit
ACATAAAGTATCATATACAAATCTTTCATTTAGAATTATGAATTCATGAT14.166666666666666No Hit
CTTTAAGAAATTAATCATAAAAAAAAATAATACATAAAAAAAATAACTCT14.166666666666666No Hit
ATCCAAAAACTGCTCAGCAACAGTCGGACAAGTGGGAAATGTTGGGGTAA14.166666666666666No Hit
AGTTCAAACATTTCTTTTTCTAATGGGCGGCGGCGGGCCCGCTTGACCTC14.166666666666666No Hit
GATTTTATACTATCAAGTGGTACCGTCGCAGATATTGAAAATTCACATAA14.166666666666666No Hit
CTTTAGAATATTATTTTCGGGCATTAGAACGAAACCCCTTTTTACCACAA14.166666666666666No Hit
TTACCCAGCTATCCAAAAAAAAAAAAGTTGAGAGAAAAAACCTAATAAGT14.166666666666666No Hit
GCGGTGTACGGCACGGTCGTCCATAAAGAGCTTCAAACAGTGGCATGCCT14.166666666666666No Hit
GAAACAATACTTTACCTTTCGTGATCTGGTTGAGGTTCTAGTTTTATATT14.166666666666666No Hit
GATACGGATTCTCGAAGATGATCTTAACTTGATTACATCCGATGTGGTTA14.166666666666666No Hit
GCGCAGGAGCAATCATCGCAGCATTCNCCGGAGTTATTNTAATNCTCCTC14.166666666666666No Hit
AGATTGACATTCTACGCTCTCATATATCTGAACTCTCATCTCCATCGGCC14.166666666666666No Hit
ATATAATATATTGAGCAATAATAAAATTTATATGTGATATTGTATTATAA14.166666666666666No Hit
AAATTGTACCATATATATTTTTTATTTGCTCAAAAAATCTTTTTTTATTA14.166666666666666No Hit
CTATAAAACAATCAAACTTGACATCTAAAAAAATGTGGAGCTCCAAGTCA14.166666666666666No Hit
ATGAACGGTGGAGTAAGCACTAAGCAATTTGCATGTCTATGCATTTTCAT14.166666666666666No Hit
TAACAAAACAATGTGTAGCCCCAGAATCAAATAGAGTGTGCGTTACTACG14.166666666666666No Hit
TGTCAATAGTGTTTGTTTATGAAGGAATTTATGATGAGATTATTCGAGAA14.166666666666666No Hit
GTATATGAGGTGAGAAAAAGATCTCCTTTACATATCAAGAATTCGTTTAG14.166666666666666No Hit
ATGCTAGAGAGCAAATACTGCAGTTCTTGTGGTTTCATCCATTTGTTGAG14.166666666666666No Hit
GCCTTAAGGAGATATCCCGACGATATCTCCCGGACATCATATGCTTATCA14.166666666666666No Hit
GTTTCTTTGCCTGACCACTTCGATGGGAACAACTTTTTCTTCAGCAACAT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)