FastQCFastQC Report
Tue 23 Aug 2022
HNCMMDSX3_n02_chi_032.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCMMDSX3_n02_chi_032.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences264
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC35

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[WARN]Per base N content

N content graph

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Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTTGATGTCATGTGTATGATTGAGTATAACAACATAAACCGCAACCCGA10.3787878787878788No Hit
GAGAAGGACAGGGGCCGTTAGGTCAGAAAAGCGATAACTAACAAATCTCC10.3787878787878788No Hit
AAATAACATAGATACATACACTTAGCATATAGTAGAAAATACAAAAAAAA10.3787878787878788No Hit
CTTCCGAAGACAGCGACTTAGAGATGCTTGGCGGAGTAAAAGAGTGCAGG10.3787878787878788No Hit
TCCAACTACATTGTGATCGCTACTGTTCCAAGGCATCATCATGTTCCTGT10.3787878787878788No Hit
GCCTCGGCCTGTCCAAATGATGTTCAGCGGTCTCTACCCAAGTAGCTGTG10.3787878787878788No Hit
ACGGGGGGGGTGGTAGGAATGGATCAGGGGATGTATGGTGCGGTTTGTTC10.3787878787878788No Hit
TCTGGAGCTTGGTCGGGTCTGGCGTGTCCGCCATGGGTGGGTACCTGTCT10.3787878787878788No Hit
GCTATAAATATATGTATAATTCCGCAAAAGAAAATAATAGAGAAAAAGAA10.3787878787878788No Hit
GAATAAAAATAATACAAAACGAAATAAAATAGAACCACAGAATAAATATA10.3787878787878788No Hit
ATGCATGCAAGACAAGAAACATTATTGGGTTGTATATTTCCTAAAATTTT10.3787878787878788No Hit
ATTAAATATTTAAAGTTGATAATTTTAAAGAAATAAAAAATAAAAATTTT10.3787878787878788No Hit
TAAATGGAGTGCTCATACAAAGACGGGCTACGTTGATATTACAACTTCAA10.3787878787878788No Hit
GTATAGAAGTTATTTACTAATAAAATATAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAC10.3787878787878788No Hit
ATTTCATACTTATTGAAATAACTACGAATTAAAAAATTTTTTAAAAAATC10.3787878787878788No Hit
GTCAACGATTGCGTGAGTTACTGAAACAATCCCAATCAGCCCCCCTCACA10.3787878787878788No Hit
ATTTAAACAAAAGAAAAAATAAATAAACAAACAAAATATTTTAACAATAT10.3787878787878788No Hit
GAACCATCATCGAGACTTACTGAACCAAATTGAGGAAGAGCTTCGATGCC10.3787878787878788No Hit
GGCCTAACCAATCCTCTTCCTTAGCCGCTGAACAAGATAATCATAACGAA10.3787878787878788No Hit
ATCTATAACAATGCCAAGAATAACAATATCTATACTTATCAATAAAATTC10.3787878787878788No Hit
GGTTTACACCTTTGCCCGCGGCTTCTCCTTCGTGGGGAAGTCGTGGGCAC10.3787878787878788No Hit
CAATCATACACATGACATCAAGTCATATTCGACTCCAAAACACTAACCAA10.3787878787878788No Hit
ATATTATGTAAACCTTATAATTCAAGTGTTTATCTACGTTAATTATGGAA10.3787878787878788No Hit
GGAATAAAGTATCCGAAAAATAATTAATAATTCAAAATGAAAACATAAAA10.3787878787878788No Hit
GCTGCTTTATTTTTTGTCCCAACAATTAAGAATTGTTTTCCCCTACTTGC10.3787878787878788No Hit
CGAGTTCTCTCCTAAATGTGCATCTCTGTGATGTACTGGTTTGCTCTAAG10.3787878787878788No Hit
CAATATTCTAAAATAAAAAAAAATAAAAAACATATTTTCAACTAAAATTT10.3787878787878788No Hit
CTACAGAATTCTGGCGTAAACATTTAGAATTCTCCAGACATGTGGAATGC10.3787878787878788No Hit
GGAACACACCTTCAACGTAATTCCCTCCTATCTTCTTCCTCTAATATTGA10.3787878787878788No Hit
ATATTAAAGAAGCCAAAAACACAGAAGCAATGAGAGAGCGCAATATATTT10.3787878787878788No Hit
TTTTAAAATATTAAATAAAAATTATTATTATATAAAAAATACTAAAAATA10.3787878787878788No Hit
GACTACTGGAGTGTTATCCTAGACCAATATTATGAAACAAAGAAACACAA10.3787878787878788No Hit
ACATTAAAATTGGCAAAGAGGGGGATTACAGCTACATGAACAAGTAATTA10.3787878787878788No Hit
CAGATAACAAGGGAATAGCCCGGTCAGGCAACTTCTCCCTCTGTGCAGCA10.3787878787878788No Hit
ATTCAACCCTTTTCAAACATTTCTTCTTCCACAAGAAACAACAACGAAGC10.3787878787878788No Hit
ATTAATACCGATAAAACATACATATTGTCATCTAATTCGAACAAGACTAT10.3787878787878788No Hit
CTTATGGATCAGGACCACCCTGGATTTCCCACTTCCATGACTAACACCAA10.3787878787878788No Hit
ATGGTGTAGCCAAATTCCGTATTAGTAATTTCCTATGAATCTTATAAAAA10.3787878787878788No Hit
ACTTGCAAGGGCATTAGGCTCAATGCCAGGAGTCTATCGTGTTGATTTGT10.3787878787878788No Hit
ATATAAAGAAAATGGTTTGGATTTATATGTTGATTACCATCAACTAATCA10.3787878787878788No Hit
AGACTAGAGTAGTTTCTAGTAGGTAACCATTCCTGAAATGGTCTGCCCAA10.3787878787878788No Hit
GTTAAGATTAAATAGGATCTAATAAACCTGTCTAGATTACACTTTTCCAA10.3787878787878788No Hit
CCTGTGACTGGTTTAGCAACAGACCCATTCTCAGCAACCTTAACATCACT10.3787878787878788No Hit
ACAAATACAAACATTATTAAGCGTTTACTTAATTAAACAAGAACACTAGC10.3787878787878788No Hit
GAACTGCGGAACCTAATAAGATAGCAATTACAACCCAAGAAGTAATAAGA10.3787878787878788No Hit
CCTAGATGCAGTCGACCGAACACCACACGCTCCAGAGCGGCTATAACTTG10.3787878787878788No Hit
CCATAAAATATCAAGTACTAGCCTTGTGCCAACCCCTAGGAAGAGAATTC10.3787878787878788No Hit
GGTGTGTGGGCGGTTGGTGGGCCGGTTTGTCCGTGGGCGCGGGGCGGGGG10.3787878787878788No Hit
GTACTTGCATAAACACCTATCTAAAAAGCTGTACCTATATTACAATCTTA10.3787878787878788No Hit
AAGTAATAACATGTTTTGGTGTGTTCTAGCAGTCCTAAGTGAACATGCAG10.3787878787878788No Hit
ACAAGCAATTATTTCGCCACTTCTAGATGCCAAGCGTCCAAGTCCTTCTC10.3787878787878788No Hit
GATAGGACTAGACTAAATCGAATCAACAAATTTAAACGTAGTTAAGCACG10.3787878787878788No Hit
AAGAAAANAAGATTACAAGACATCTTCAATTACCTTAAAAAAAAAAGCAA10.3787878787878788No Hit
GTTTACAATTTAGAAAATACAAATCAAAATAAACATACTTACTTTGTCTA10.3787878787878788No Hit
CTGTATGTACTTAGATTTGATCAATTAATCAACATTTACAACAAAATAAG10.3787878787878788No Hit
CTAAAAAACAAAACAACGAAAACATAAAACTACATCAAAATCAAATCACC10.3787878787878788No Hit
CTACTTAGGCTTATAAGATCTTGTTGCGGTTTAAGTTCTTATACTCAATC10.3787878787878788No Hit
AAAGAAATTTTTGTCGTTAGAATTAGAAAACAGCGGAAATAATCAGCTCT10.3787878787878788No Hit
ATCTAAAACTATCCTAAAATAACCTAAATATCCAAAGCAAAATAACAAAA10.3787878787878788No Hit
CTTATATATCTAACAACTGACATTAGCTCAAATCAAAAACTTCTAGAACA10.3787878787878788No Hit
GTCATATTCGACTCCAAAACACTATCCAACCTTCATCTTGCTTCTCAAAG10.3787878787878788No Hit
AGAGTCTAATTCAAAAACCGGCTTTTGACATATCGCATAATAATAGTGCA10.3787878787878788No Hit
CTAGATTAGAAATCGACAAATACAAAAGCAAATTTAATTGTAAATAAACA10.3787878787878788No Hit
ATACATACAAATAAAAATCCATATCGGAGATTTTCTATGTCAAAAAAATA10.3787878787878788No Hit
ATGATATATTTTTCTCTACCTGAAAACATTTCAAGCTAGATTTACCTTGC10.3787878787878788No Hit
CAAAATAAAATAAAAAATCAAAGATCAAAAAATCAATAAAAAGAATGTTA10.3787878787878788No Hit
GTCCGGCGCCGGGGCGGGGGGGGGCGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.3787878787878788No Hit
AGTGGGTTTTGTTTAAATATAATGTAGAGTTGTAGGTAATAAAGGTAAAT10.3787878787878788No Hit
CGATTCATATCCTAAAATTATTGGCTTTTATGCAAGTTTCTTTTTGTTGT10.3787878787878788No Hit
ATGTAACTTATTATTGAGGTAATTAAATAATATTCCTGTTTATCTGTGTG10.3787878787878788No Hit
ATATATAATAATTAGATAAATGAAAATTCATAATTCTGAATATATACCTG10.3787878787878788No Hit
TATACAAAACGTCACTTACCTTTAAAACACCATCTGTTGCNTCTCGCCCA10.3787878787878788No Hit
CACATCATTAAATCCATATTATAGATATAGAAATACTGCAAAGTAAAAAG10.3787878787878788No Hit
ATATTGTATTATCCACATAAAAAAAAACAAAATTCCCAATATAAAAAGAA10.3787878787878788No Hit
GGAGAGGAGTGACTCTTAACTGTGCTCTAGCAACAAGCCAGCTAGCCCTT10.3787878787878788No Hit
TAAATAAATAATTACAAGTTAAAAATTTAACATAAGCACTAAATCAAATC10.3787878787878788No Hit
CAATATACTACATGAAAATGATAAAGAGAATGCTTGGTAAGATAATCAAA10.3787878787878788No Hit
ACTACCATCAGTGCCTTATCCACACTGTAAAGGATTTCATAGCAAAAACG10.3787878787878788No Hit
CTCCCATGAATAAGGGCAAGTGATCAGAACTTCGATCACTTCTTAGCTGT10.3787878787878788No Hit
AATATATCNTATATGCCTCCATGGCCTCTCAGCGAGGCTCACACAATCAC10.3787878787878788No Hit
ATAATCCCCTTATCTGGAATCTCACTTGGTTTAAACCCTTGTCACNCAAC10.3787878787878788No Hit
CCTGTGCTCAAGGAACATTAGGTGATTTAGATCCAGAGTACTATCTTAAC10.3787878787878788No Hit
ACAAAATGCTGCACTCCTTGCTGCACCAACGCATAATGCTGCACAGCATC10.3787878787878788No Hit
ACCCTAAACTCCATAACCTGTTTCACCGATAAAGTGCCTTTGCTTCTATC10.3787878787878788No Hit
ACATTCAAATTTATTATAACATATTTAATTATATATAATAAATACAAATA10.3787878787878788No Hit
TCGGGGGTGGCGGGGGGGCCCGGTGCCTGGGGGGCAGCGAGGGTGCGGGG10.3787878787878788No Hit
ACATTGAAGATACACAAATATCTAAAATTAAACATCATCAATAAACAAAC10.3787878787878788No Hit
ATATAGCTTTATAGCCCTTTTCCCTCTTGGCACCAACATACATTGAAATG10.3787878787878788No Hit
ATGTCATGTGTATGATTGAGTATAAGAACTTAAACCGCAACCGGATCTTA10.3787878787878788No Hit
TCATAAGCCTTTGGTCCATAGCAACGTCACGTTCGTGCTCCATGAAGCTT10.3787878787878788No Hit
GATTATTTCTAACTAATCTTCCATTTTTCTCAGCTCAAACCTGTAACACT10.3787878787878788No Hit
ACAAAATATAATTAGTAATAAGAAATAACTAAATCAATACATAAATAATA10.3787878787878788No Hit
ATGAACATGTATTGAACAAATCTCAAAGAAGAGAAAAAGCTAAAAAGAGT10.3787878787878788No Hit
CCTCAAGCAGTTCCACTTTCTCGGTCCGAAAAGTGCATTGTTGGAACTGG10.3787878787878788No Hit
ATATATTAGAATACATATAGTAAAATATATCTAGTGTTGAGAAAAAGTTA10.3787878787878788No Hit
CAAAATATATATATTAGGTCACTTGTCTAACATGTCACCTTTTAAGAAAT10.3787878787878788No Hit
ATGTCATTGTTAATCATTATATTGAAAATATGCGTAGGATGGTATTACTT10.3787878787878788No Hit
GACATAAATAAACAGTATTGTGACAAAATCACGGAAAATAAGCATGTTGA10.3787878787878788No Hit
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CGCATGTCTAGTACACCGGGAGCGAGACATATCAGTGTCTTAGGCTAGGT10.3787878787878788No Hit
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TTTCAGAGGAGTCCATCACGCAATCAAACTAATTGATTGATCTTATTAAG10.3787878787878788No Hit
GAAAAGTAAAAGAACCCTAAAAAAAAAATAAAGTACTCAACAAACCTGAC10.3787878787878788No Hit
GGAGAGGGGGGTGGGGTTGCGGGGGGGGCTGGGTGGGGTGTTCGGTGTGG10.3787878787878788No Hit
GGTTAGAGTAGTGTAGAATTCTCAGTATGCTAGGTGGTTGAGTATTGATT10.3787878787878788No Hit
CCACTGTAGTGTCCGAGTAGATACTTTGACTTTCTCTCGAACCATAGTAA10.3787878787878788No Hit
CGATTCAAGGATAAATATATGAGTTGTGGACCAAAACAAATCCTCCAAAT10.3787878787878788No Hit
GGTAAAATTTATTACTACATCAAAAATGATCTTAATAATAATGCAATTAA10.3787878787878788No Hit
GTTATGGACCTCTTTTCAATTTCTAATCATTGTTTCTCTATTGAAATAAC10.3787878787878788No Hit
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GTTTATTTTAACGTGTTAGCATTAGAACCCTAAGGTTCGATATATTACAG10.3787878787878788No Hit
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ATATGAAAGATATCCCTCCAAAACGTACAAACTACATTCATCAAATACGG10.3787878787878788No Hit
GATAATGAAGCTAAAGAACAATATGAACGTGATTTTAATTAAAAATGACA10.3787878787878788No Hit
AACATATATTGNAAATAAGCTTTATAAATAGATATCAAATAAATACAACT10.3787878787878788No Hit
CCCATATATATAATGGATGGAAAATCACATAGTAACATCTTATAAACGCA10.3787878787878788No Hit
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GTGTAAAAACATTACAACATATCAAAATAATAAAATCCAAAAAAGAGCAA10.3787878787878788No Hit
TTATAATTCCTCTTCTTTTTGTTCATAGCTTTGTAATTATAGTCTTATTT10.3787878787878788No Hit
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GTGTATCATTGAGTATAAGAACTTAAACTGCAACCAGATCTTAAAGGCGT10.3787878787878788No Hit
TTTTTAAAAGCTCTGTTCGCTTCAGGTTTCCCAATCTAGTCTTCTGTTGA10.3787878787878788No Hit
GGGAACCGTATCATGGGGGGGGGTACGTCAAATACTTGTGCCGCCGCAAG10.3787878787878788No Hit
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GTCTTTCATGTTGGACCAATAGGTAGTAGAAGGATGTTAGGTAGAATCTT10.3787878787878788No Hit
CCTTCATAATTGCTTCCAGCGGATAAGCCTTGGCACTTGGTACAATTTTC10.3787878787878788No Hit
GGTCTGGTGGAGGGGCGGGGATTGCGGACGACTCGTGCCTCCGTCGGGAT10.3787878787878788No Hit
GATCCATACATCTCGATCCGAAAAGAATCAATAGAAAAAGAAAAAATCGG10.3787878787878788No Hit
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GTACAATACTAAAATCTAACAACAAAACCTTGATAGACCGAAAAAACAAC10.3787878787878788No Hit
AATGTCACAGCTTATTGTTAATTGGTCACTTACTACTGTAAGTTATCCTT10.3787878787878788No Hit
ACATTATACCTAAAAAAAAAACTATAAAACACACACATACAAAATATTTT10.3787878787878788No Hit
ATATATCTGTGTTAGTGTGTGTAGTAGATAAAGCTACATATTTNCAACCT10.3787878787878788No Hit
AGATACAACAGGAGATTGATCTCCCATTTCTGTCATCCTTAATTTCCCAA10.3787878787878788No Hit
GGAAACAACTCGTGTATGCTTCTTCCCCAATATCCACTCTTTTGAAGTAA10.3787878787878788No Hit
ATCCAACAGAATAAAACTCATTAGAAAAACAAACAAAAAAAAAACCAAAA10.3787878787878788No Hit
GTTTATGAATCATTGTTTAAATATTTTGTAACTTTGTAGTAATTAACTGT10.3787878787878788No Hit
ACCATGAAAGCTTTGAAAAGCAAGAAGAAGGTTGGTTAGTGTTTTGGAGA10.3787878787878788No Hit
CCTCCATCCGCCACAAATTAAATATAAAAAACCAACACACGAAGTACGCA10.3787878787878788No Hit
CATAAAACTAATCAAAAAAACAAATAAATATGAAACGAAAAAAACAAACT10.3787878787878788No Hit
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ATTCGCATCATTATGTTCGATAAAAGGAATTAGAGAAGCTCCAATGGAAA10.3787878787878788No Hit
GATATAACCCAAGGTCTTCCAAAAGTAGAACAAGTTTTAGAAGTCCGCTC10.3787878787878788No Hit
GATGAAACATGATTATTACCAGTCAACATAGCTGAGATTGCTGTGCATCA10.3787878787878788No Hit
GTTGTTATATTATTGAATGAAAGGTTACAAGTTATATAAACATATAAACA10.3787878787878788No Hit
GGAGTATCGAAAAGGCAAGATACATACCAGAGAGAACTGGTTGAATACTG10.3787878787878788No Hit
CATAACCAAAAACTTCAAATCTTCATCGGTAATATTCCAATAACANAAAA10.3787878787878788No Hit
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ATAAAGAAGTGAATCAAAAACATAAAAAAACACTAATTCAATATACTATA10.3787878787878788No Hit
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TTTATGTTCCTTAGTTAATATCCATCTATATATTATATTGTTTTTCAAAA10.3787878787878788No Hit
CCGTAACACCTCTACTTTAGTCACGCTCAAAACACTTATTTTAGTGAAAT10.3787878787878788No Hit
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