FastQCFastQC Report
Mon 16 Mar 2020
HKVH7DRXX_n02_dpr53.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHKVH7DRXX_n02_dpr53.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC51

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGCATAAAAGCGACTGCTGGCGTCAGGCGCATACCACGGCGCACGAAAACGGCTTTGCGCAAATGCGGCGCTGG11.6666666666666667No Hit
GTAATACTCTTTTCTAAACCGGTTCCGACTGCTGTGTTTGTCACCATAATATTGCTTTGTGCTTATTTTAGAGCA11.6666666666666667No Hit
GTTTGCAGCAGAAACGCACACTGGGATCCTTTCTTGCAACAGCTGGGCCGGCTGGGTCTTTTCTCTTGTCTTCGG11.6666666666666667No Hit
TTTTAAAGATCCCCTGCTTGCGGAACTCTTCAAACGTTGGCAGTTCAGGAATCGCTTCCCGCGACTGGGCATACA11.6666666666666667No Hit
TCTTGTAGCCGCCAAAGGCCTTGCCAAACCGAGCCAGTGCTTTCATTGCGTCATCCTCTGTGTTTAGTTTTGCTT11.6666666666666667No Hit
GGCCTAGACTACGTACATAACCTAAACCTACTCCAATGCTAAAACTAATCGTCCCAACAATTATATTACTACCAC11.6666666666666667No Hit
CTTTATAGCCGTCTTCCTCACTCATTTCCGGCAAAGCATAGATTCGGTCACGCTCCTGCTTCACTTCCCACAACT11.6666666666666667No Hit
CACTCAGACACTTTGAGTAAACATTATCCTCAGATAATCCAAAACAAAAGATTCCAGACTACAATTAGCTAATCT11.6666666666666667No Hit
GTGCTGGGGCTGTCAGTGCTGAGGAGGTCAGTGCAGGAGATGTACCTGCTGGGGAGTTCGGTCGTATGGGTGACA11.6666666666666667No Hit
GGCCAGGGGATTAATTAGTACGGGAAGGGTATAACCAACATTTTCGGGGTATGGGCCCGATAGCTTATTTAGCCT11.6666666666666667No Hit
GTGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACACTTCGCCCGTAAACCGTAGGCCTGATAAGA11.6666666666666667No Hit
CTATCAGGGACTATGGCAGGAAAAGAGTTGAAACAGACACGTCCCAGGCCTCCAGCCCCTCACACCACGGAGACT11.6666666666666667No Hit
TCTCAAGGCTCTTCAAAGGACTAAAAGCTAAAAGGATGGATTCATTCGACAAGTCCTAGTCCTGCGCCCTGGTGA11.6666666666666667No Hit
GCGTAAACGCTTTGGCAGCCCGAAATTCCGCGTCTGGGGTGGCAAGCCGATGATTGCGCTGATTCTGGTGTTGGG11.6666666666666667No Hit
CCCACAATCGCAAGAGCGTCAAGCGCTTGTCCACGGGTACCTAGATCCGGGGATCATGGGAGGTTGAACATCAGC11.6666666666666667No Hit
AATCAGGAGTTCCAGCAGCAGGGCACTATAAGCCAGTTCCAGCGTCGCCGGGACTAAAATACGCAACTCTTCCAG11.6666666666666667No Hit
CCTAGAAGCGCTTCCAGCTGGAGCATGTGTGTTGTTGGTGTGCACTGTCTCTTATACACATCTGACTCTGCCTAC11.6666666666666667No Hit
GCCTCAGATGTGTATAAGAGACAGACCATTGATAGCCTGATTACGAAAGATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTC11.6666666666666667No Hit
ACCCAGCAGCTCGCGCAGACGCGCGTTCTCCTGTTTGTATTGTCCAAGCATCAGCAGTTCACTGTTTTTCAGCAA11.6666666666666667No Hit
GCAAATATCTTCCCATAACCACTAGACAGAAACATTCTCAGAAACTCCTTTATGACGTATGCACCTGTCTCTTAT11.6666666666666667No Hit
CCGCTGGGGCGTAACCAAGTGCGTAGCCGCTGCAGTCGGGCGTTTAGCGGCTGGGGGGGGGCGCTCGCGAGGGTG11.6666666666666667No Hit
CGTCCCCGCTGCGCAGCCACCTCCCCACCGCGCAGCCTGCTCCCCACCGGTCGGTGATTCACGTCTGCAGCTGCC11.6666666666666667No Hit
GCTCTTGAATCGGATGCCACCAGCCGTCGCGGGCGGCGCTGCAGCCGGTTTGCGCGAGTGAGCGCTCTCGGGGGG11.6666666666666667No Hit
GCGTTACTCCCTGCGTGTGCGCACCAACGAATTCAACCACGAAAATCTTCAGCTCGGCATCAATGAAGCCCACGC11.6666666666666667No Hit
CCATATACCAATGATGGCGCGATGTAACACGAGAAAGCACATACCAAGGCCACCACACACCACCTGTCCAAAAAG11.6666666666666667No Hit
GTGTGGGGCGTGGGTGACCATCGGCGGGGGTGGGGCCGGGGGGGGCGGGGCGGAGGGTCGGGCGGGGGGGGGGGG11.6666666666666667No Hit
ACCAAACACAGCATAGTCTCACTCATAAATGGGAGTCAAATAATGAGAACACATGGACCTGTCTCTTATACACAT11.6666666666666667No Hit
CGCACGATGAGAGGGGGTGGTTCTCCCCGGTAGCAGAGTGCGCGAGCATTCTTGACAATACTGGCCCCTATCCCG11.6666666666666667No Hit
CACCACCTGTCCGGCAGTGATTTTGAGGTTCATCAGGATGTCTTTGGCGTCGATGTCGCGCCTATGCGATTGCAA11.6666666666666667No Hit
GTCCAGAAGGAGCCCTTGCCGGGCTTGTCGGGCGAGCGGGGCACCTTCAGGAAACAGTCGTTGAAGGAGAGCGAG11.6666666666666667No Hit
GTACCAGATCGATCCCGCGACCTATCAGGCAAATTATGACAGCGCGAAAGGCGAACTGGCGAAAAGTGAAGCCGC11.6666666666666667No Hit
GGGGTATGCTGTTCGAATTCATAAGAACAGGGAGGTTAGAAGTAGGGTCTTGGTGACAAAATATGTTGTGTAGAG11.6666666666666667No Hit
CTCCTGTTATTTTCTCTTTTTTGTAGTAATGCGGTGGTTATCATTTCAAGCCAGCTCCAGACATCCGGCACACCC11.6666666666666667No Hit
AGAAACAACTCCCAGAAGAGAGCCGCCACAAGAACACACACCATGAGTGCTGTCTATTATACAAATCAAAAGCTC11.6666666666666667No Hit
GATACAGCACACGGCAGTCAAATCCAAGACCGTTGTCTTTGCTGTTACTGGCACTTAACGCTTGCTGCTGTCTCT11.6666666666666667No Hit
AAGCAGAGTGAATATGATAACCCCTTTAATATAACTTTAAAGAGCAATACAGATGACAAAACAATTCATGTATAT11.6666666666666667No Hit
GATCCGGATTATCCGCAGGCCAGCCAAGGCACAGCCCAAACAGCGGCAGAACATGCTGCGGTAATTTAAGCAGTT11.6666666666666667No Hit
CCCCCCGTCGTCTCGCCCGGAGCTGGGCTGGCGGCCCGGGCGGGGGGGTTGTGGGGTCGGGGTGGTGGGCTGGGG11.6666666666666667No Hit
CAATAGCCCTGGCCGTACGCCTAACCGCTAACATTACTGCAGGCCACCTACTCATGCACCTAATTGGAAGCGCCA11.6666666666666667No Hit
GCGCGATGTAACACGAGAAAGCACATACCAAGGCCACCACACACCACCTGTCCTGTCTCTTATACACATCTGACG11.6666666666666667No Hit
GCCGTAGCGCTTAGACATTTGTGAATGAGATGCACTGACTAAATCAATTGGCCCCCAACTGGTGTACCCCATAAT11.6666666666666667No Hit
AAGATGTGCTGGTAAATAGCTCCCACATTTGAACATTGTGGGAGCCGCTATTTAGTCATTTTTCTGACAGAAAAC11.6666666666666667No Hit
GCCTTCTCCTTGCAGCAGAACACCACAAAGCATGTGTGCCCTCAGGCTTCATAGCTAAGGTGAAGCAGATGGAAC11.6666666666666667No Hit
GCACGGGGGGGCGGCGGGGGGGGGGGCGCCCGGGGGCCGGGAGGCGTCGGCCCCGCGGGGGGGGGACGGCTGGGG11.6666666666666667No Hit
GTCACTTCCTGTAAGTTATAACATAATTCTAGTCTATAAAAGAAAAAAAGTTTATGGAGAAAGTCTCCACTAATA11.6666666666666667No Hit
TTTTTCTCCTTCTCTTTTAAGTGTCAACATCATGTCTCAGGTGATTAACAGACCTGTATCTGAAGCTCAGGTCTG11.6666666666666667No Hit
GTCTTGGATTTCTTTGTGGCTATTTGGACAGGATGGCCTCAGTGTTGATGATGTCACTTAAAAACATCAGACGCT11.6666666666666667No Hit
AAATAATGTCATAGTCAATTCAAGCTGCCAATGCTAAAACAATATCTATATGACCTCATTTAGTCAATTCAGTTA11.6666666666666667No Hit
CCTCTGCACCCCGGAGGGGACGCAGGACGCCCGGAGCAGACCCAGGCCGGACTCTTATACACCTCAGACGATGCC11.6666666666666667No Hit
CATTAACACTATTCTCACCAGACCTCCTAGGCGACCCAGACAATTATACCCTAGCCAACCCCTTAAACACCCCTC11.6666666666666667No Hit
GTACCTTTCTGCGCTGCATTAACTTCCTCGAAAAACCGAGTGAAGGGTCGATCGTGGTCAATGGCCAGACGATCA11.6666666666666667No Hit
GTTTAATCCTTTCGATCTTTATCTCGGAACATCTGCCGGGGCGCAGAGCCTCTCGGCGTTTTTCTGCGATCAGCC11.6666666666666667No Hit
CCCCCCCAAATGGCGATTCACCGCATCAACATCATATCCTACTGACTATTACCACCATAAAAAATACAACATCTC11.6666666666666667No Hit
GTATACAGTCAAATAAATACCCAAGTGAACAAGGCAAATGGACACAGCAACTCCTACAGACTATTTCCCTAAGAA11.6666666666666667No Hit
ACTGTGTGTTTCAGATAAACCGTTGCATGGCGAGATTAAACTCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGA11.6666666666666667No Hit
ATGCTACAGGGATGAATATTATGGAGAAGTAGTCTAGTTTGAAGCTTAGGGAGAGCTGGGTAGTTTGGGTTGTGG11.6666666666666667No Hit
CCCATATAATGCAGCAAATTTAATCAATAAATGTTATGTGTGTTCTGACTGCCCCACCGATTGTATCTCTGAAAG11.6666666666666667No Hit
CTTTAGGATGGGGTGTGATAGGTGGCACGGAGAATTTTGGATTCTCAGGGATGGGTTCGATTCTCATAGTCCTAG11.6666666666666667No Hit
GAATGGGGGCAATTGAGCCCGTCGCCACCTGGATGATTAACGTAGTGACAAACAGGCTGAGTACCAGTTTCGGGT11.6666666666666667No Hit
CCTTTATGGAGGTTCCTGCAATGTCAAATACATACCAGAAAAGAAAGGCACGTAAAGAGTCTGTCTCTTATACAC11.6666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
GAGCGTC50.069.014
ATGGGAG50.069.056
CGTCAAG50.069.017
CAAGAGC50.069.011
TTGTCCA50.069.027
GTTGAAC50.069.063
GGTTGAA50.069.062
TCAAGCG50.069.019
GCAAGAG50.069.010
GTACCTA50.069.037
TGTCCAC50.069.028
CGGGGAT50.069.048
CACAATC50.069.03
CCACGGG50.069.031
GGGTACC50.069.035
GTCAAGC50.069.018
CGCTTGT50.069.024
AAGAGCG50.069.012
GGATCAT50.069.051
CAATCGC50.069.05