FastQCFastQC Report
Mon 16 Mar 2020
HKVH7DRXX_n02_dpr35.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHKVH7DRXX_n02_dpr35.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATACAATAGACTAAAATAGGAACTATGGCAAGGGCACGAAGCCCTTGACCCTGGCTTCTAAGATTAAGTGAATCT23.3333333333333335No Hit
TCCATTGGCCGCGCAGCCTGTCAGTCAGGGGCGGGGCGGCGCGCGCGCCGCCGCGGGCGGGGAGCCCGCTGCAGC11.6666666666666667No Hit
GCACTGACGAGGGAGAGGCGGGTGGATCTCTGGGAGTTCATGAAATTTGGCCAGGGCTAGCTACATAGGGAGCTG11.6666666666666667No Hit
CCTCTGAGCATGGCAGACCAACACTGCACACCCACTCCCTATGCCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGA11.6666666666666667No Hit
GTTCAAGACCAGCCTGGAAAACTTAATGAGACCCTTTCTCAAAGTCCAAAGTATAAATGTGTGGGCTGCATCTCT11.6666666666666667No Hit
GTGTAATGGGTTCTGCTTCTGTAAAACAAAGCCCGACCTCCCTGCATGACCTGTCTCTTATACACATCTGACGCT11.6666666666666667No Hit
AAAGTGGACCACCCAGCGGAGTGCTGCGGGAGCTCTGTTAGCTTGCACCTGCTGATGTCCAGACCTGTCTCTTAT11.6666666666666667No Hit
CCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCGTAACCCTAACCCTAACCCTAACCATAACCATAAGCA11.6666666666666667No Hit
CTCACTCACTCCTCAGCACACCCAGCCCCCCTTCCCCCAGTATCCTGGTAATACAGAACTGAATGAATCAGTCAC11.6666666666666667No Hit
CCTCAGGGTTCCGCCCTCCCTTTCTCCTCCCTGACACACCCAGTCTAAACTCATGGGTTCAAGTCACAGACCTGT11.6666666666666667No Hit
AGCTAGGGAAGGGTCTGGAAGCCTCGCGCTTCTCATCGGCGCCCCCTGCTGGAGGCGTGAAGACCCTATACCTGT11.6666666666666667No Hit
GTATGGGGCTTGAGGCATAGAGGACTCTATAGGACTCGGCATATAGGACTCTATAGGACTCTGTACTTTTTATTC11.6666666666666667No Hit
GTCCATGCCCCTAGAAACATGGCGTGTAGTAGTGACCCCCAAGTTAAGAGCCTGTCCTCGGCTGTCTCTTATACA11.6666666666666667No Hit
GTCCAGGGTGCTGCGGAGAATGGAAGATGTTTTGCTGAGGCACTCACAGAAGGCTACCAGAGCTGTCTCTTATAC11.6666666666666667No Hit
CACCAATATCTAGAACGTAACACGCGCTATAAACAACGCCATTGTCACGCTAAAACCACGAACAAAATCACCCTG11.6666666666666667No Hit
ATTACAAACTGTCCATGCATATACTCACAAACAAAAGAAAATAAACACAAAGTCACACTACACATACACAGACTC11.6666666666666667No Hit
ATTATATATTGCATCCACAGTATTCTGTGAATGACAGTTTGATCAATCAATGACGTACCATGCACCTGTCTCTTA11.6666666666666667No Hit
ATATTGGCCTGCGTCCTGCCCGGCACCGTCAGGATTTCGGTGGCTTTTGGATCCTCCTGTCACAGGGCGCACGCA11.6666666666666667No Hit
CAGTATGAGCTTAGCACCAGGTCACACTGAGAGGGAGACTTGCCGCTTCTCAAATTACTTTCTTATAAAAGATGC11.6666666666666667No Hit
CTGTAGGATCTGGAATATGGCGAGAAAACTGAAAATCACGAAAATTGAGAAATACAGACTTTAGGCTGTCTCTTA11.6666666666666667No Hit
GAACTCAGCATCTCCTATCCCTGTACCAGATTGCCAACCATCCCCCAAAGTCTCCTTAAAGGGGCAAACTTGTGT11.6666666666666667No Hit
CTTCTTCCCCAGGGTGCCTCAGAAGTCTGGCGCCTGGTCTGATCTCAGTGTTCTTAGGTAAGATAAAAATAGCAA11.6666666666666667No Hit
GGTTATCTGAGCTGCGCCCCCCAACACCCCCCCCCCCACCCCCCACCCCTTAAACCGGTTTTTAAAGGGGAGTGA11.6666666666666667No Hit
GAGTTGCAGACAGAGCACCTCATCTATCTGGAGCAGCAGAAGCAGCTGTGGAGCAGGAGGAGGCAGACGGGGCAG11.6666666666666667No Hit
GCTGTGAACCTGGAAGCTCACTTCGTGTTCGCCAGTGGTACGCAGAACGCCGTTCGGCAGACGAACTTCGCTCTT11.6666666666666667No Hit
GCTGCACCCTCAACTTACGTTATCCCAACTTGTGACTGTTATTCGGCGCTCCACGGCTGTCTCTTATACACATCT11.6666666666666667No Hit
AGCTGATATAGTTCAAATTCTTCTCCAAGATGACTGATTCAGTCTGGCTTCTCTCAGCTTTTCCAGAATTTTTCT11.6666666666666667No Hit
TATAGACCCCTCCCACCCGGCTGGCTCCGCCCCGGGCAGCGCTGCGGCTGGGCTCGGGCGCGCGCTCCAGCGCTG11.6666666666666667No Hit
GTGTTTTCAGTTGCTGAATGCTGATCAACATGACGCAAGGCTGCCGAGAAGGTCTTCCCTGCCTGGACCTACAAG11.6666666666666667No Hit
AGACTGTCTTAGAAGAAAGCGAAGGGAAGGGGAGGGGAGGGGAGGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGA11.6666666666666667No Hit
GATCTAACTGCCCTTCCAGCTTGCGTCACTGCCTGAGCGAGAGAGGAGCTGTCTCTTATAAACATCTGACGCTGC11.6666666666666667No Hit
CCGTCTCCGCCTCAGATTTGTATAAGAGACAGGTGACAGGAGAAGCTTATGGTGGGAGTGTGTAGTTGACTTGTA11.6666666666666667No Hit
ATCATACACCACGATATTCTCGTTTTTGTCAGGAGATGGCGCTGCAGGTTTTAAATCTGTCTCTTATACACATCT11.6666666666666667No Hit
CTGCTATGCTTGCTAAGGGATGAGGGTGGGGGTGGGGTGTGAGACTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGAC11.6666666666666667No Hit
GTACTAAACAGAGCTCCATGTCCAGGGTCAATCCTCTGGACCCCTATTGGCTCAACGTTCAAAGAACTGCATCCA11.6666666666666667No Hit
CTCCTGCACAGCTGCACCGCCGGGCTGCGAGCGGCTGCAAGCAAGAAAGCCCTAGAGCTGTCTCTTATACACATC11.6666666666666667No Hit
CTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAAACACCAGGGTCAAGAAGTGGGAGGAGGAGGGTCAGGTAGCAG11.6666666666666667No Hit
CCCCAAGGGGAGTCCCTGCTGACCCCTGTTCCCGCTGGCTTCAGTCCAGCCAGTCCCAGCCGGAGGGGCCCCTCC11.6666666666666667No Hit
CCTGAAGGAAGGGGACAAGGTGACATGGTATGCAAAGGAAGTCACCTCAATTCCCCCATGGGAACCTGTCTCTTA11.6666666666666667No Hit
GCCAGGAAGAGATCAAGGACAACATTCCCTGGAAGGGCGTGCCCCCACTGGCCTCCATCTCTAACTCGGCCCCAT11.6666666666666667No Hit
GTCTCTAAAGAACTGGCTGTTGAATGCAAGTGGACTTATGACCCTGAGTTTGGTGTTACAAACATCATAAGCATG11.6666666666666667No Hit
CACATAGGCTGACAGAGGCTGGCTTTGAACTCCCAATTGCTGTGATTATAGGCATGCCCCACCTCATATTTTTGC11.6666666666666667No Hit
GATCCAAGGGCTCTGGCACTGCTGGCATCTTGGGAAGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGCGAT11.6666666666666667No Hit
GGGCTTGACTCAGGTATTTAATGACGTACACAAATACAACCCCAAAACCAATAGTTGGTTTAAATTGATTTCGCA11.6666666666666667No Hit
CACAGTTCCTGGCCGCATGCTCACATGGAGCTGACTAGAGGATAATGTAGTGAAAGTGTCACTAATAGCCAACAG11.6666666666666667No Hit
ACCCATATGCGTGACATATTTTGACACGTATGCCAGTTAACCTTGTCATGGGCATGTCTCAGATTCACAGCCATG11.6666666666666667No Hit
GGCTTACCTGCTCCCAGAACAATAAAGCAATTCCAGGAGTTCTTCAAGCCACTCCAAAGCCACTCCAGAGCAGTC11.6666666666666667No Hit
GTTCCCAGGCCAGATTCGTCGAAACCTGACGGATCGCTGCCGGACCGTGGCGACCACCCGCACGACCAGAAGTGG11.6666666666666667No Hit
TGCCTTAACTTGGCAATGAAGCACGTAACGCAATGCGAGTGATCCTGTGAGAAAGAAAATTGATGCAACTTGGAA11.6666666666666667No Hit
TCCATAAAAAAAAAAACAATAATAAATAATAAAATAATAATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAACATAAA11.6666666666666667No Hit
CGTGTGTATGCAGGTGCACATGCGGGTGTGCCTGTGGAAGCCAGAAGGGGGCGCTGAGTATTCTGCCTGTCTCTT11.6666666666666667No Hit
GGCAAGAAGTCCAGGCTGCGCTGCAGCAGAAAGCCTCTGCACGTGAATTTTAAGGAGTTAGGCTGGGACGACTGG11.6666666666666667No Hit
GCTAAGGACAGACCCCAAAGCTTATGAAAACCCCAAAATCTAATAAACATCACAACCTCCCCACTACACAACAAG11.6666666666666667No Hit
GCTCTATTGCTTACATCTTTAGGAGCCAGAGCGCAAGAGCGCAAGAGAGCAAGAGCCAGAGCAAGAGAGCAAGAG11.6666666666666667No Hit
GGAGACAGGATAGAAGTCCTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACAGGCAACCTCAGGGAGTAGGAGCTGTCTCT11.6666666666666667No Hit
GTCTTAAGTAGTGAACCGCAAGGATGGTGCAGACTAAGATTGGGTCTACCTATAATATCAGGAGGGGCTGTCTCT11.6666666666666667No Hit
CAATAAAGACTAACCAAAACTTCGCAGAAGTATCAAAAACCAGATGACATGAGACTGTGTAACAAGAACATTAAT11.6666666666666667No Hit
GTATAAGACCTGCTTAGGCCAGAAGGTACAACTAGAGGCCTGTTGAATAAAGATGCTACTATAGAGACCCTATGT11.6666666666666667No Hit
CATCTGCAGACAAAGCTAACCACACCTTCAGAGGACAGTGTTCTGAGATAAGAATTCATACTGACCTTCAGCATT11.6666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
ACAGTAT50.069.017
TGTGAAT50.069.026
TTGCATC50.069.09
TGCACCT50.069.061
CAGTTTG50.069.035
TGCATCC50.069.010
CAATGAC50.069.048
GTTTGAT50.069.037
TATATTG50.069.05
TATATAT50.069.03
ATCCACA50.069.013
GACAGTT50.069.033
ATGACGT50.069.050
CAGTATT50.069.018
TGTCTCT50.069.067
ATGACAG50.069.031
ACCATGC50.069.057
CCTGTCT50.069.065
GTACCAT50.069.055
AATCAAT50.069.045