FastQCFastQC Report
Mon 16 Mar 2020
HKVH7DRXX_n01_dpr8.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHKVH7DRXX_n01_dpr8.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences125
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length20
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGG21.6No Hit
GGGTTTGGCTTTGGGTTGTT10.8No Hit
GTGTTTGTGGTTGTGTTTTT10.8No Hit
GTTGTTTTAGTTGGGGTTTT10.8No Hit
CTTTTTGTCTTTGTTTTTGT10.8No Hit
GTTTGGCGATGTGGGTTGTG10.8No Hit
GTCTTGTTGGGTTTGGGGTT10.8No Hit
TTCCTTGTTGTGTGTGGGGT10.8No Hit
GTTCTTTTGGGTTTGTGGGG10.8No Hit
CTCTTGTGCTGTGGTGGGTT10.8No Hit
CTTCTGGTCGGGGGGTGTGG10.8No Hit
GTTCGGTGGGGTGTGGTGGG10.8No Hit
CCCCTTGGGTGTGGGGGGTG10.8No Hit
GTCCGTGGTGTTTTTGGTTT10.8No Hit
GTTGGTGTGTGTTGTTGTGG10.8No Hit
GGTGTTGGCTTGGGGGGGGG10.8No Hit
GGCCTGTTCTGGGGGTGTTG10.8No Hit
GGCCTGGTGGGTGGTGTGGG10.8No Hit
GTGTGGGTTTGGGGGGTGTG10.8No Hit
TGGTTGGGCGTGTGGTGGGT10.8No Hit
CTTGGTTGTTGGGTGTTGGT10.8No Hit
GGTGTGGGGGGGGGGTGGTG10.8No Hit
GTTTGGGGGGGGGTGGTGTT10.8No Hit
CCTGTGGTCTGTGTTTGTGT10.8No Hit
GGTTTTGTCTTTTTTTTTTT10.8No Hit
GCGTTGGGCGTGGGGTTGTT10.8No Hit
GGTTTGGGGTTTGGGTTGTT10.8No Hit
GGGGTGGTCGTGGTGTGGGT10.8No Hit
GTGTGGTTTGGTGGTTGGTG10.8No Hit
GTTCTTGTCTTTGGTTGTGG10.8No Hit
GGTTTTTGCTGTGTGTGTTG10.8No Hit
GGGTTGTGCTGTTGTGGGGG10.8No Hit
GCCCGGTGCTGGGGTTTTTT10.8No Hit
GGGTTTTTCGTTGGGTTTTG10.8No Hit
CCCTTTGTCTGTGGTTGGTT10.8No Hit
GGGGTGTTGTGGGGTTGGGG10.8No Hit
TTTCGGGTTTGTGGTGGTTG10.8No Hit
AGTTTTTGCGTTGGTTGGGT10.8No Hit
TGGGTTTTCTGGGTGTTTTT10.8No Hit
GTCTGTTTCTTTGTTTGGTG10.8No Hit
AGGGGGTTGTGTTGGTGTGG10.8No Hit
TGGGTTTGATGCGTATTGTT10.8No Hit
GTGTTTGTCTGTGTTTTTGT10.8No Hit
GGTGTTGTTGTGTGTTTGTT10.8No Hit
GGTGTGGTGGTTTTGGTGGT10.8No Hit
GTGTTGGGCTGTTTTGTGGG10.8No Hit
GTGTTTTGGTTGTGATGTGT10.8No Hit
GTGTGGTTGGTGTGGTGTTG10.8No Hit
GTGTTTGTAGGGGTTGGGGG10.8No Hit
CCTTTTTTGTGTGTGTTGTT10.8No Hit
GTTGTTGTCGTGTTGTTGTT10.8No Hit
CCTTTGGTCGGGTTTTTGTG10.8No Hit
CTGTGTGTGGTGGTGGTTTT10.8No Hit
GTGTTGTTCTTTGGTTTGTG10.8No Hit
GTTTGGTTCGTGTGGTTGGT10.8No Hit
TGGGGTTTTGTGTGTTTGTT10.8No Hit
GTTTTGTGCTTTGGGGTGGG10.8No Hit
CTGTTGTTGTGTGGTTTGTT10.8No Hit
GGGTTGTGGTGTGGGTTGTT10.8No Hit
TTGCTTGTGGGGTTTGTGTG10.8No Hit
GGGTGTTTGGTGTGTTGTTG10.8No Hit
GTGGTGTGGGGTGGGTGTGT10.8No Hit
GTGGGTTGCGGGGTTTTGTG10.8No Hit
GCTCTTGGGGTTTGGGGTTG10.8No Hit
TTTTTTTGGTTGTGTGGGGT10.8No Hit
GCCCTTTGCTGTGGGTGTTG10.8No Hit
GTGCGTTTCGGTTGGTGTGT10.8No Hit
GGTTTTTGCGGGGTTGGTGG10.8No Hit
TTCCGGTGCTGTTTGTTGGG10.8No Hit
GGTGTGGGCTGGGGGGGGTG10.8No Hit
CGGTGTTTCTGGGCGTGGGG10.8No Hit
CTCTTGGGCTGTGGGGTTGT10.8No Hit
CCCTTTTTATGGTGTTTGGT10.8No Hit
GTTCTTGTGGGTGGTTTGGG10.8No Hit
CTGGGTGGCTGTGTGTTTTG10.8No Hit
GTTTTGGTCTGGGTGGTGTT10.8No Hit
GGTTGTTGCTGTGTGGTGGT10.8No Hit
GGTTTTTGGGTGGTGTTTTT10.8No Hit
TTGTGTTGCTGTGGTGTTTT10.8No Hit
CCTTTGTTGGTGTGGTGGTG10.8No Hit
TTCTTTGGCTTGGTTGTTTT10.8No Hit
GCCTTGGTGGTGTGGGGTGG10.8No Hit
GGGTTGTGGGTGGTTTGGGG10.8No Hit
GCTTGTTGGGTGGGTTTGTT10.8No Hit
TGGTTGTGGTGGGTGGGTTT10.8No Hit
TGTTTTTGTTGTGGTGGTGG10.8No Hit
TTGCTGGTTTGGTTGTGGTG10.8No Hit
GTTTTTGGCTTTTTTGTTTT10.8No Hit
CGTCTTTGCGTGTTGTTTTG10.8No Hit
CTGGGTTTGTGTGGTGTGTT10.8No Hit
GGTCTGGTCGGGTGTGGGTG10.8No Hit
GGTCGTGGTGTTTGTGGTTT10.8No Hit
GTTTGTTGTTTTGTGTGTTG10.8No Hit
TCGCGGTGCTGGGGGTTGTT10.8No Hit
TCTTTGTGCTGTTGGGTGTT10.8No Hit
TTTGTGGGCTGGGGGTTTTT10.8No Hit
GTTGTGTTCTTGGGGGGGTT10.8No Hit
TGGTGGGTCGGGGGTGGTGT10.8No Hit
GGGGTGGGATTGGGGGGGTG10.8No Hit
GGTGGTTTCTGTGGTGGGGG10.8No Hit
GTGGTTGGGGGGGTGTGTGG10.8No Hit
GGTTTTTGTGTTTTGTGTGT10.8No Hit
TGGTGGGTGTGTGGTGGTGT10.8No Hit
GTTTGTGTCTTGTGGTTTGT10.8No Hit
TTCCTGTGGTGTGTTGGGTT10.8No Hit
CCCCTGTGTGGTTGGTGTTG10.8No Hit
GGTGGTTTTGTGGGGGTTGG10.8No Hit
GGTTTTTTATGTGGTGGGTG10.8No Hit
GCTTGTGGGTGTTTTTTTTG10.8No Hit
GGGTTGTTATTGTTGGTGGG10.8No Hit
GGGTTTGGATTGTGTTGTTT10.8No Hit
GGGGTGTGGGTTGGGGTGGT10.8No Hit
TTTGTTTTCGGGTGGTGTGG10.8No Hit
GTCTTTTGTGGTGGGGTTGG10.8No Hit
TCCTTTTGTGGTTGGGGTGT10.8No Hit
GTGGTGTGGTGTGGTGGGGT10.8No Hit
GCGTTTTTATTGTTTTTGTT10.8No Hit
CAGAGTCACGTTGTGGTGTG10.8No Hit
GTGTTGGGTGTTGGTTGTGG10.8No Hit
GGCTTTGGCTGGTGGGGTGG10.8No Hit
GCTGTGTTTTGTTTTGTGTT10.8No Hit
GCGGGTGGTGTGTTTGTGGT10.8No Hit
GTTTGTTTCTTTGGTGTGTT10.8No Hit
CTTGTTTGTTTTGGTGGGTG10.8No Hit

[WARN]Adapter Content

Can't analyse adapters as read length is too short

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers