FastQCFastQC Report
Mon 16 Mar 2020
HKVH7DRXX_n01_dpr39.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHKVH7DRXX_n01_dpr39.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences842
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length20
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[OK]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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