FastQCFastQC Report
Thu 10 Dec 2020
HK7MWAFX2_n02_1975_d04_rep2.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHK7MWAFX2_n02_1975_d04_rep2.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCTGATATGTGTGCGCGGGGGTATCTGCGCTAGGGAGGACGGGCGGCGGG14.166666666666666No Hit
CCAGAGCTCTGGGGGCACAGTCTGAAAACAACTGAATTGTGGGATGTCTA14.166666666666666No Hit
GAAACAGGTGGGTAGGAACATACACCTACAGTGCGTCCAACAATGCCTTG14.166666666666666No Hit
GTAGTAGGGTGCTGCTATCACCATGTTCCAGTTCCTTAGGAATTTCTGGG14.166666666666666No Hit
GTTAGAAGGGTAAGGGTTCCTGGCGCCTGGCAGCCTCAGACAGGAGGACC14.166666666666666No Hit
GGCAGCTCCTGCTCGAGCAGAGGCAAGCACACCGCCATCGGAGGGCTCGA14.166666666666666No Hit
ATTGTTACTATCTGAAATTTGAACATCTTAAAATTATTCCCTCATGTAGA14.166666666666666No Hit
CTGGGAAAGATCCATAGAATCCAGTTCACTTTGTGACCCCAGCTCATGCA14.166666666666666No Hit
GGTAGAGCGAGTATCCTCCAGCAGCATCACTGCTGAGTGTGGAGCCTGGT14.166666666666666No Hit
CTGCAGGGCAGTGCACCCCTGACGCCAACACTGGGGACAGCGGGAAGGAA14.166666666666666No Hit
GTTGAGGCAGCAGAACGAGACAATTCAAGCTGCCAGCCTGCCAGTGAAAC14.166666666666666No Hit
GTTAAATAGGACCTACGAATAGGTAAGCTTCCTGAAACAAGTAAAACGAT14.166666666666666No Hit
GTGTGGCTGGTGTCCTTATAAAAAAGGAGCAATCAGGATGCAGAGACACA14.166666666666666No Hit
GCTGAGAAGAAGCCACTGGCGTCTGGCGCCCCCCATGGAGGCGATGGTGG14.166666666666666No Hit
GTGGTGCGCATGGCGGCGTGTTGCAGGGGGCGGGGGTCGGGGAGGGGCGG14.166666666666666No Hit
AGCGGGGGGTGTGGCCGGGCCGCCCGCGCGGGGTGCCTCGCGCGGGGGGC14.166666666666666No Hit
GGCTCTAAGGGCTGCCGGTGTGGCTTGGTCTGTTAGGTGTTGGGCTTTGG14.166666666666666No Hit
GGTTGGGAGGGACTAGTGGTGCAGCAGCCACATGGCAATGGCACAGCATG14.166666666666666No Hit
AGTAGAAACAAGGGAAGCCCCATTACAAAGAGGTAAATACATTAAGATGG14.166666666666666No Hit
GTGGGTGGGCGCGGCGGCGGGGGCGGCGGGGGGGGGCGCCCGCCCCCCAA14.166666666666666No Hit
GTCTTGGCACAAGAGTTGGCCAGGATGGGCTCCAGGGGGGCCGTGGGAGA14.166666666666666No Hit
AGTAGAAACAAGGCATTTTTTCATGAAGGACAAGCCAAATTCACTTCCCT14.166666666666666No Hit
GATTTGGTAGCGGCGCTATCAAATGCTTTTTCTGCATCTGTTGACATGGT14.166666666666666No Hit
TTTGTATCCTTCTTACCACTTTTGTTACGAGCGGTAATCAGTTTACTGAT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)