FastQCFastQC Report
Thu 10 Dec 2020
HK7MWAFX2_n01_1975_d04_rep2.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHK7MWAFX2_n01_1975_d04_rep2.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTTTATGAGGCCAGCACGGCCCTTATCGAGACCTCCCAAGTATCTGTGAT14.166666666666666No Hit
GAGTGTGGCGGTTGGAGGGCGGCGGGCAGCCTGGACACCCGCGGGAGCGC14.166666666666666No Hit
GGGGGGGCCGCCCGGGCATGCGGCCAAGCAAAGGGGAAGCCTCAGCCTGC14.166666666666666No Hit
ATGCAGGACTCAATCCCAGGACCTTGAGATCATGACCTGAGCCGAAGGCA14.166666666666666No Hit
GGCTTTAACCCACTGAGCCACACAGACCCCCCCAAATGTTCCCTACTTTA14.166666666666666No Hit
GTTAGAGGCCCTGTCTTGGCACAAGAGTTGGCCAGGATGGGCTCCAGGGG14.166666666666666No Hit
GTCCAGGTGACACACCTGCAGGGAGGAGACACAGGAAGTTACTAGCCTGC14.166666666666666No Hit
CGGCTCAGGTCATGATCCCAGGGTCCTGGGATCGAGCCCCAAGTCAGGCT14.166666666666666No Hit
GCCCAATGCCCATGGGCATAAGGCCCATGGCCCCCCCATGGTAGTGGGAA14.166666666666666No Hit
GTCTCCCTCCCTCGGGGGACTCCACAGAACTGGGGGCACAGTCTGAAAAC14.166666666666666No Hit
GTCCAGGTTCTTATCATTACTCTCCTTTCCCCAGATCCCCACACTCTTAT14.166666666666666No Hit
GTCCAAGGCCAGGTAGTATGTAGGCCCTTTCCCAGTAGTGTGACCCCACT14.166666666666666No Hit
ACCTCATTCAGGCACACCGGGACAGGAGACCGTGCCGAAACGCAGCCCAA14.166666666666666No Hit
CACTTGGGAAGAAGTAGAGCCCAGGGGCGCCTGGGTGGCTCAGTGGGTTA14.166666666666666No Hit
CTCATGGGCTACATGCACAATCTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTT14.166666666666666No Hit
CTGCGCAGGGAGCCTGCTCAGGGGTGCGATCTCAGGAACCTGGGATTATG14.166666666666666No Hit
AAAGCGAAAATTGGGCACAATGTCTACTTGAGATTACAACCGCCTTTTCG14.166666666666666No Hit
GGGTGTCACGGTTCTCTGGAAACCGCAGGCCCCCCCAGCGGCCGTCCCTA14.166666666666666No Hit
CTGGACCTCAGGCTACCTTCCGGTAAGTCTAAATCCGAAATAAAAAGTTA14.166666666666666No Hit
CCCTGCTACTCCACAGCAGTGCCCTTTTTTCCACAACAGCTAACCCTCAC14.166666666666666No Hit
GCTTCCCTTCCTCTCTCTCTGCCTGCCTCTCTGCCTACTTGTGATCTCTG14.166666666666666No Hit
CAGTAAAACAGGTTCTAAAATGGGGCACCGGATTAGTCGATTAGTCTAGT14.166666666666666No Hit
CCATAGGGCAGGACTGTCCCTGGAAGTGCGTGACTTGGTGCACGAACAGG14.166666666666666No Hit
CCCTTATACTGGAGATCCCCCATATAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)