FastQCFastQC Report
Thu 11 Oct 2018
HK77CBCX2_l02_n02_MG_8724.tr3.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHK77CBCX2_l02_n02_MG_8724.tr3.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACAATGCGGTTTGACGCGAGTTGCACCTTCATTTGGAACAAGGCAATAAA14.166666666666666No Hit
CACTGATCCGCTCACTCACAGTGAAGACCTTAGATTTAATCATTCATGCC14.166666666666666No Hit
TCCATACTCTGTGTGCACAGTTACATACAAAGACTCGGTCAACAGTGGGT14.166666666666666No Hit
GTGTGGAGAACTTACAGCACTGTTATTCACATGAGTGCATACCCCGATAT14.166666666666666No Hit
GCAGAATTCTATGCTTAATCCAGTTCCTGTAAACTGACTCTCTTAGCATT14.166666666666666No Hit
TATATATATATGCTCAATAGCAACTAAATATATATGCTCTACAGCAACCA14.166666666666666No Hit
GTTGAGACCTTGAAAAGAGAAGATTATGAGATTGTATAAGATTATGAAAA14.166666666666666No Hit
AATGTGCTCCACTCATGACCTCTTCGCAAAATCTACCACCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
GAGCTCGGGGGCGCCGGCCACGAAGGCGGCGCGGTAGCCGGCCAGGTTCG14.166666666666666No Hit
CTATGAAAGACAATGGTGAAAAGGCTTTGTTTCTTTTACAAAAGATTCAA14.166666666666666No Hit
CCTCCACCCCATGCCTCCGGAGGCACTGGCTCTGCCAGGAATGCATATCG14.166666666666666No Hit
GGCTCAGCGCGACCCCCGGGACCTGGGCGCCCGACCCGCCACCCCCGGGC14.166666666666666No Hit
CACTAACTTAATAGTGTCCTATTAAAACAATGGAAAACAAAATGAGACTG14.166666666666666No Hit
GTCTATATACTCTGAATGTGAATATATACTCCCCATCACTTCATTATGCT14.166666666666666No Hit
TCATCATAGTGTTCATGGTGCAGAGGAGTGGGCTGGGAGTCACATTGCCA14.166666666666666No Hit
GTGTTAGATGTAATGGTGAATTTAACCAACCTGTTCCTTACCCTCATAGA14.166666666666666No Hit
TCCCCAAGCCCTGGGCCACAGACAGGTACCGGTCCCTGGCCTTTTAGGAA14.166666666666666No Hit
CAGTAATGGCCACTTGGAGCAGGAATATGATCTTTATATGGAAGACTCAG14.166666666666666No Hit
CTAAGACTCGGCTATGTCTATAAGAGTCAGCAAGGTGAATTCTTGGCCGG14.166666666666666No Hit
GCATGGAAAAGACCTGCCCCCATGATTCAATTACCTCCCACCAGGTCCCT14.166666666666666No Hit
ACCCTGGACAGCACAGCTCTGAAGTGTCTTTCTGCGGCCTCCCAGCAGGC14.166666666666666No Hit
ATTCAAATGTTTTCTACCATTTCAGACTTTACACTAGGTCTTTTGAAATC14.166666666666666No Hit
AGGCCGACTCGCGTCGGCCGAGTCCGTGCAGTTCGCCGAAAGCCGCGAGA14.166666666666666No Hit
GCTCTAGGAAACTATGGAGTTGGGATGGAGATCCCATGTACCAGAGGCAT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)