Sample	FastQC_percent_duplicates	FastQC_percent_gc	FastQC_avg_sequence_length	FastQC_total_sequences	FastQC_percent_fails
HK3TCAFX2_n01_Federica.A7	5.40314786825	39.0	151.0	502401.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_Federica.CSS_parent	17.5387018999	42.0	151.0	6562032.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_Federica.F1	9.34686095059	38.0	151.0	530256.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_Federica.Oak	2.47626720607	39.0	151.0	201941.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_Federica.Wine	3.41420762779	40.0	151.0	264121.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A12	10.8519548988	39.0	151.0	869402.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A13	10.5668184747	40.0	151.0	874886.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A14	17.6917340673	39.0	151.0	965375.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A15	12.0881844533	40.0	151.0	613094.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A16	21.3621253456	38.0	151.0	3057656.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A18	16.3978354748	36.0	151.0	1319263.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A19	17.8289993478	38.0	151.0	1684595.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A20	19.0437588289	37.0	151.0	1727853.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A21	11.2852186538	39.0	151.0	947918.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A22	13.2916170868	39.0	151.0	805431.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A23	13.3148319091	38.0	151.0	853087.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A24	11.9650644034	40.0	151.0	693304.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A25	19.9521584301	38.0	151.0	3295251.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A26	15.1172944828	37.0	151.0	1077783.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A27	17.996127702	37.0	151.0	1545259.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A28	12.6602842981	39.0	151.0	772969.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A29	13.8477222073	37.0	151.0	1142564.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A30	15.8483749012	37.0	151.0	641427.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A31	14.6483189326	38.0	151.0	1304908.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A32	15.39112221	38.0	151.0	585667.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A33	21.0330989187	37.0	151.0	2477208.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A34	13.1688465727	38.0	151.0	1408771.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A35	18.7834332606	36.0	151.0	1399939.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_A36	16.8906842221	38.0	151.0	1773658.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_C3	11.5355307545	39.0	151.0	530633.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_C4	14.1129995068	38.0	151.0	566521.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_C5	16.830255959	37.0	151.0	1086313.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_s.060.3	10.3018688363	39.0	151.0	415258.0	25.0
HK3TCAFX2_n01_msh3_MA_strain_s.061.2	18.5726878678	36.0	151.0	1770027.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n01_undetermined	5.8248253547	40.0	151.0	9469791.0	25.0
HK3TCAFX2_n02_Federica.A7	5.18888872644	37.0	151.0	502401.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_Federica.CSS_parent	18.4342533369	38.0	151.0	6562032.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_Federica.F1	10.1955506164	36.0	151.0	530256.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_Federica.Oak	2.51664380692	37.0	151.0	201941.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_Federica.Wine	3.22611485777	37.0	151.0	264121.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A12	11.6312532197	36.0	151.0	869402.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A13	10.7071649395	38.0	151.0	874886.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A14	17.6775834243	37.0	151.0	965375.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A15	13.0882720016	37.0	151.0	613094.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A16	21.8338646429	36.0	151.0	3057656.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A18	17.3401711427	35.0	151.0	1319263.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A19	18.9196886305	36.0	151.0	1684595.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A20	19.4098320799	35.0	151.0	1727853.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A21	12.5902507802	36.0	151.0	947918.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A22	14.332799434	37.0	151.0	805431.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A23	14.0690984757	36.0	151.0	853087.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A24	13.5609890828	37.0	151.0	693304.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A25	21.2360314154	36.0	151.0	3295251.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A26	16.9802206445	35.0	151.0	1077783.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A27	20.3377048171	35.0	151.0	1545259.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A28	16.4563320093	36.0	151.0	772969.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A29	16.0526218725	35.0	151.0	1142564.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A30	17.518540984	35.0	151.0	641427.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A31	16.2664716775	36.0	151.0	1304908.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A32	17.8716482375	35.0	151.0	585667.0	33.3333333333
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A33	24.2820124024	35.0	151.0	2477208.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A34	15.1620353754	36.0	151.0	1408771.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A35	21.6009153306	35.0	151.0	1399939.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_A36	19.2395863853	36.0	151.0	1773658.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_C3	11.3991539474	36.0	151.0	530633.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_C4	13.7270006822	36.0	151.0	566521.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_C5	15.9425136081	35.0	151.0	1086313.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_s.060.3	10.2481929332	36.0	151.0	415258.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_msh3_MA_strain_s.061.2	18.4332053806	34.0	151.0	1770027.0	41.6666666667
HK3TCAFX2_n02_undetermined	5.47332267181	38.0	151.0	9469791.0	41.6666666667