FastQCFastQC Report
Wed 5 May 2021
HK3CVBGXH_n02_S7_R2_F12_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHK3CVBGXH_n02_S7_R2_F12_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCCTATTATCTTTTGCCTAGGCATGAGCATGAACCAGTCTCGTGACATTT22.666666666666667No Hit
GTGAAAGGGGTGAAATAACTGAAAATAACATAAATGACTGAAACGGGTGA11.3333333333333335No Hit
GATCCCTTGAATCGCTGCATCTGCACTCCAATTCGCTGCTGGTAGGCCTG11.3333333333333335No Hit
AATTAGTAGTCCACGTCGTCGTTGTGGTAGGAAGACTTAAACTGTTGTAA11.3333333333333335No Hit
GGAGTAACCAAAAGAGTGTTAATGGTTAATTACAAAATGATTGGGTGGTG11.3333333333333335No Hit
GCAAATGGGGGTCAAGGGGATGTGGGGGTAAAAGACAGAAGGTAGAAGGA11.3333333333333335No Hit
ACATTGCGAATGAATATCTCTGTACCAATAGATTTAAATTTGCTTAGAAT11.3333333333333335No Hit
AACCAATCTACGGTGCAATCTCCACCTGCGATTTGATTCAATGACTATCG11.3333333333333335No Hit
GTTGTGTAATCCCCAGCACTATCTATACTCAAAATTTTTTTGTTATTCCC11.3333333333333335No Hit
GTTGGATTCTGTCTAAGGATGTCCACCATCCTTACTCCTCCAATCTGTGT11.3333333333333335No Hit
CCACTACTGCTTAAATCTGTCCTTTTTTGTCTACATGATGGGACTGGACC11.3333333333333335No Hit
GTCCTCATCGGAGGACTTGAATGGAATGGTAACACGGTTCGAGTCTCTGA11.3333333333333335No Hit
TCCCAGCACTGGGATGCTCTTCTAGGTATTTATTTCTTCTCTCATCAAAA11.3333333333333335No Hit
CCCGAGCTAACCACGGCTTACCAGGACCCATCCTTACCGGCTGCCGACCG11.3333333333333335No Hit
ATAAAAATAGATTAACCAGCGCAACTAGGTGGCTCAGTCGATTTTATGCC11.3333333333333335No Hit
CACCAAACCATGAGGGAATACAAGCAGGAGTGGACAGATTCTACAGGACC11.3333333333333335No Hit
GTTTAGTAAAGAAGGTTATGATATCCTGCATGAAGATAATGTCATTCTCT11.3333333333333335No Hit
TCACAGTTTCTCCAAGCGAATCTCTGTATATTTTCAGAGACTAGATCCGT11.3333333333333335No Hit
TATTTTGGCCATGTTACACTTGTTATCTGATGGAGCTGCGGCACTGTTCG11.3333333333333335No Hit
TTTCCCATTTGTGTGGCTCCAGTCTCGGGTCAGTGAGTGAGAACTCCATA11.3333333333333335No Hit
GGGGATGTCGGTAAAAAGATAGTGTCAATCCCAGAGAGTTGTTTATTGAC11.3333333333333335No Hit
CGCCACTTTTCATTTCTGCTCTGGAGGTAGTGAAGGTCTCCCATTCTCAT11.3333333333333335No Hit
GAACGGATAACTGGTTGTATTTGTGCTGCGCACACCAAAAGCTGCCGACC11.3333333333333335No Hit
GGGAGAAGCAGGCTCCCCACTGAGCAACGAGCACATCGTGGAACTCTATC11.3333333333333335No Hit
GGCAACACCATTGTCCTCGATATCTAATCAGCCTCTCTTGTTGGGAAACA11.3333333333333335No Hit
GGTCCAAGCTGAATGATAATCATGATGAAATTTTTCAAAGTTAACCCAAT11.3333333333333335No Hit
CACTTAAGACATCAAGTGAAAATAAGGAGGAGGGTTGAGAAAAACCCTGG11.3333333333333335No Hit
AAACAATACTCACCCCTTAAAAATTCTAAATTTTTCTGTTAAGTAATGTT11.3333333333333335No Hit
GGAAACGAGGTGAACAAAATCACTCATGTCAGATGAAGTCCCATGTTCAA11.3333333333333335No Hit
GTGTTGTAGAGGCTATGGCTTTCCTTGAAGCATCCCTCCCAGGAATATTT11.3333333333333335No Hit
TTAATAAGAAGATGTGAATTCAAAAATATCCAGCAAGAATTTCAAGCCGA11.3333333333333335No Hit
ATTTTATTCTTCCTTTTCAGAATTGCCCCTTGTTTTTGTTTCTTATTTTA11.3333333333333335No Hit
ATAATGATCTCAAACAAAATGGCAAGAATAGGGAAATCGTACATTTTAGC11.3333333333333335No Hit
AAAGCAGGCCGACCGTTTCCAGGATAATGAAACCCTGGAGGCCAGCCTGA11.3333333333333335No Hit
ACTAAGTGCTGACAATGAGGAGGAAGCAATAGTTCGAGAAATATAAACAA11.3333333333333335No Hit
GACTCCAAAACACTGGAACTGAGAAGCATATACTGGGCCATAATGACCCG11.3333333333333335No Hit
GTCCATCCATCCATTTATCCATTTCTAGCCATCCATCCATCCATCCATCC11.3333333333333335No Hit
TTATTTAAAAAAGGCCTTTGGTCTAATAATATTATTACTTGAAGTTAATT11.3333333333333335No Hit
CCACACGGGCATCCGCCTCTGTGACGGCCCTGGCCCGAATATCGCTGATT11.3333333333333335No Hit
AAATTGCCCCAGGCTATTCGACCGACTGGCGCGCTCTGCGCCTGAGCGAG11.3333333333333335No Hit
NTGTGGACAAGTCGAGTTCAAACCCCAGTGGTATCGCCGCCTACAGGGCG11.3333333333333335No Hit
GTTGTAAGGCTTGCATATATGTTATGTGTTCGAAACTATGCGCTGGCGCT11.3333333333333335No Hit
GAAGAAGCAGGCTCTCTGCTGAGCAGGGAGCTGCTTGATGTGGGGCTTGA11.3333333333333335No Hit
TTGCTGATTCTCAGCATCGGTCACACAGACAGAAGGCTGCTACCACAAAA11.3333333333333335No Hit
CTGAAAAACAACGAAACATGTAGTAAAACCATCCAGTAAAGATATTCAAC11.3333333333333335No Hit
ACACCATGTCAAGCTTTCAGGTAGACTGGTTCCTTTGGCTTATCCGCAAG11.3333333333333335No Hit
TTACTGGATACTGGAAAACTGGTATCAGGATGGAAAGGTGACAGCGAGCA11.3333333333333335No Hit
GTCATGTGAAATTAAACTCAAAAGCTTAGAGAACCTACAAAATGAACATC11.3333333333333335No Hit
CTCCCTTCAAGCACCAACTATATTGTTATTATTGATAATTCCGGCATGAA11.3333333333333335No Hit
GACAAGAACTTGCTTACAAAGCGACTGACTCAAATATTGATTTTTATGGA11.3333333333333335No Hit
GGTTCTGATTTAAGACCAGGTTCCAGGGAGGCAAGAGGGGAAGCTAGAAG11.3333333333333335No Hit
AGACAAACATAAGATTCCTTAATACACTTACCCCAAGAGCCCCACCTGAG11.3333333333333335No Hit
GTATTGTGAGGTGCTATGGTAAATAATGGCAAAGCATTTGCAACTTAACA11.3333333333333335No Hit
CAATATATTCTGACACTCTCAACTGGCCTATAAAGAAACTGCTGAAAAAT11.3333333333333335No Hit
GCCTGATGGGCCTCTTTGCCATCAGCGGTCAAAGTTCCTGCTGATGGATG11.3333333333333335No Hit
CTTATGAACATATGAAACCAGGAAGTCAATAGTGGTTTAATTATCGGCTA11.3333333333333335No Hit
AGCGAAAGCAGGGGGAGTGGAGAGCCGAGCAGGGAGCCTAATGCCGGACT11.3333333333333335No Hit
GGCTAACGACAAGACCAATCGTGTCCCCTCTGACTAAGGGAATTTTAGGA11.3333333333333335No Hit
GGCTTGGGACTTCCAGTGTGGCACTAGCCCGTTGCCGCGCTGCGGGCCGG11.3333333333333335No Hit
CTAGGAGTCTTTCGGTTTGGTTTCGTCACTCGGGTTCTGGGCTTGACCCT11.3333333333333335No Hit
CTGAGTGACCCCGCAGGCCCCGACTATAGGGTTTATAGGTATTCTGATAA11.3333333333333335No Hit
GGCGCGCTCTGCGCCTGAGCGAGAGCCGGGCGAAGGGTTTGCTCGACGGG11.3333333333333335No Hit
GAATGTGTTATAGATTATATTGATTTACTTGAAGAATACACCACAGTAAT11.3333333333333335No Hit
TGTCTGCGGTGCTGGCTGAGCTCTCCAGGGAGCTGCTGCTGGAGCTGGGG11.3333333333333335No Hit
AGATGGATTCATACACGTACAGAAATTAAATATACAGAATTGGATAAAAA11.3333333333333335No Hit
GGTAACATAAGGACTCATCTTATCTTGAATTAGTGAGCAAACCACAGTTT11.3333333333333335No Hit
GTATTTAGGCTTGACGGGTGGTCCCGCCAGATTCACGCGAAATTCCACGA11.3333333333333335No Hit
GTATGTATACACCATGTTTTGTTTATCCATTCATCATCAGAGCACATTTG11.3333333333333335No Hit
CAAATTGCCCCAGGCTATTCGACCGACTGGCGCGCTCTGCGCCTGAGCGA11.3333333333333335No Hit
GGATAAGTTAATACATCATTTCACAGCCCTGCTGATAAGACCAGATGAGG11.3333333333333335No Hit
AATTTCTATCTCGATCACTAGATTGTCAGAGTAAGTTGGCCCTTGAACTA11.3333333333333335No Hit
GAGTTACCAGATTCATTAACAGCATAGCGAATGGGCTTTAATCACAGAAA11.3333333333333335No Hit
TAAAACACAAGAGACATATGAAGGTAATGTTTTGAACATGATCTAAAATA11.3333333333333335No Hit
GTGGACACACAATGTTACATTAGTTTCAGATGTATAATACCTGTCTCTTA11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)