FastQCFastQC Report
Wed 5 May 2021
HK3CVBGXH_n01_S7_R2_F12_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHK3CVBGXH_n01_S7_R2_F12_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGATTGGGTGATGCCCCATTCCTTGATCGGCTCCGCCGAGATCAAAAGTC22.666666666666667No Hit
TCAATACACAGTTCAAAGCACTAGATAGAGAAGTCAACCACGGGCAAAAA11.3333333333333335No Hit
CGCCCGGCTCTCGCTCAGGCGCAGAGCGCGCCAGTCGGTCGAATAGCCTG11.3333333333333335No Hit
GTATTATACATCTGAAACTAATGTAACATTGTGAGTCCACCTGACTCTTA11.3333333333333335No Hit
CACTAGACCAAACGCAGCTTCTGTGGTCACTGTTCCCATCCGGTTGTATA11.3333333333333335No Hit
GAGCTGAAGGCAGACACTTAACAACTGAGCCACCCAGGTGCCCCCAAATC11.3333333333333335No Hit
TACATGGACTGATTTTGGAGGTGAAGCCCATCAGGCAGGCAGTGTGATCA11.3333333333333335No Hit
ACCCAAGGGACGTGCTGGGAGCAGATGTACACTCCAGGAGGAGAAGTGAG11.3333333333333335No Hit
TTTATGAGGGGAGGGGACAAGGTCAGCAGCTGCTCGAGAGACTCTTTGCT11.3333333333333335No Hit
TACAAGGAGAAGCCAATGTGCCTCACCTGCCGGCTGATGACGCCCGAGGC11.3333333333333335No Hit
GGACAACGGTAATTTGAATGAAAATAAAAAACGTCTCAAGTTCCCTGATA11.3333333333333335No Hit
CAAGCTAGCTTCTGCCTTAGAGCATCTAAGCTAGTTATTGCCTCTGCTAG11.3333333333333335No Hit
TGTCATTACGGATGTCCCTGGCGTCCGCGTTGGCCATGTCGACCTCGTGT11.3333333333333335No Hit
TGAAAAAGAGGTGTATGGGTGTGTGTTTGAGGAAGAGCTGCCCTCTCTAA11.3333333333333335No Hit
CTGGAGGCCAGCCTGATGTCGCCGGATATGCTTCGCAGCGGGATTATGAC11.3333333333333335No Hit
CCTATAAACAGAAAGAAGAATATTGGTTGGCATGGGATGGGGAAATAGTA11.3333333333333335No Hit
ATGTAGAAGCATGTGCGGTGGTGAAGGGTATTCGGTCTAACCAGGACTAT11.3333333333333335No Hit
GCACAAGATGGAATGACAGCCCATCTATATCCTGTAGATCTCTGACTGGA11.3333333333333335No Hit
CTTCCTTCTCTTGGGAAAGGAGAAGGCGGCGAATGTGAAAACAGACTTAA11.3333333333333335No Hit
TCATTGCTCTGCTTATGCTTAGTAACCTTTTGAGGACACTGCTACCCACT11.3333333333333335No Hit
CATTAATGATAAAGGGAAAGAAGTCATCTTGCTATTGGTAATTAACCATC11.3333333333333335No Hit
CCTAAAAAGAGAAAAGAGACAGAAAAGGACAAAAAACCCATTTGAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GGGTGATAACGGGATGGGGTAGAGGAAACCTGACAGTAGTTAGTGGGGGA11.3333333333333335No Hit
GGCTTGGTGTATTTCTTTTCTCCAAGAATCAGTATCGAGACTAACAATAC11.3333333333333335No Hit
GGGGTAAAAACAGTTAAGTCTACACTGATACTATCGGAACCCTCCGCGTT11.3333333333333335No Hit
ACGGTACACACACACCAGGCAGTCAGGAACAGGCTAAACTACAAGTAGAC11.3333333333333335No Hit
GTATCAACTCATACTTGAACAATGTTTGATAATATCATATACATTTATCA11.3333333333333335No Hit
CTAAAGAAGAGAGTTAGAAGATCCTCTCTCTGGGTTTAAGGAAGGCTTCC11.3333333333333335No Hit
GTCCTACATTATGGAAACACCTAGTTCAGCCAATGGAACGTGTTACACAT11.3333333333333335No Hit
TAGTGAAGGTCTACCATTCTCATAACAGTTTCTCCAAGCGAATCTCTGTA11.3333333333333335No Hit
CTCCCGGAGTGTACATCTGCTCCCAGCACGGCCGTTGGGTTTAGTGCAAC11.3333333333333335No Hit
GGGCTACTGAATACATAATGAAGGGAGTGTACATAAATACGGCCTTGCTC11.3333333333333335No Hit
GGGCTAGTGTGTGCCACTTGTGAACAGATTGCTGATTCACAGCATCGGTC11.3333333333333335No Hit
ATATCATTCTGTAAAAGCAAATGAAATTTACCAGCATCGTATAATACAAG11.3333333333333335No Hit
AAATATTAATCAAGACACAAAAACGGAAATTTCTATGACCATCCTTTTTC11.3333333333333335No Hit
CAATTGAAGAGCCATCTGGGCCGTTGCAGGTCCAAGGTCATTGTTTATCA11.3333333333333335No Hit
GGCAAAAGATAATAGGCCCTCTTTGCGTGCGATTGGACCAGGCGATCATG11.3333333333333335No Hit
GATATTTGCTGCAATGACGAGAGGATCAAAAGAATCGCAGCATCTCCACT11.3333333333333335No Hit
TGGTAGAAGTCATTTCCAAGTGCAGACTTCAGTGTTTAGTAGTAATGAAA11.3333333333333335No Hit
CCCCTGCTCTCTACACTTCAAAGATTTCTGCTATTAGAATAAGGTTCTGT11.3333333333333335No Hit
TATGGAGAGCGGTCGTCCGGTTCGATTTTATAGGCGCTGAGATCCAGCCC11.3333333333333335No Hit
GATAAATACTTTCTTTACGAAGTCTATGTTGCTTAATCGTGAAAATGGGG11.3333333333333335No Hit
GATCTAGTGAAACTATTAATGCCTCCATCACCAGAAGCGTACTATATACG11.3333333333333335No Hit
GAACAAATGGAGACTGGTGGGGAGCGCCAGGATGCCACAGAAATCAGAGC11.3333333333333335No Hit
AATGTTCATTTTTTAATACATCAGGCTTTTTTCTCAATGACTTCAGATAG11.3333333333333335No Hit
ATATATGGAGAGCGGTCGTCCGGTTCGATTTTATAGGCGCTGAGATCCAG11.3333333333333335No Hit
CCTCTGCATTGTCTCCGAAGAAATAAGACCCTTCATTTCTCATGTCAAAG11.3333333333333335No Hit
GTATATCTGTTTGGAGAGAGAGGGGGGTGACAAGGATTCAGACCTGAAGA11.3333333333333335No Hit
CTACTTCAAGCAGTAGTTGTAAGGCTTGCATAAATGTTATTTGTTCGAAA11.3333333333333335No Hit
CAACAAGGCAATTCTATTATATTTGATACTGGAAGACAACACTGCTTACT11.3333333333333335No Hit
TCTTATATGTTCTTGATTTTAAGACAAAGGCTGCATGATTTGAGCTAATG11.3333333333333335No Hit
CTAGTGTGCAGAAGCCTCGCTCACTGTCTGTGCGTCACGCTTAAAGTCTG11.3333333333333335No Hit
GTCTGGCCAGGCTGCATGGATGGCAGGCACTTCAGTAACAGATACAACCC11.3333333333333335No Hit
GGCGATAGCTGGCACAGCAGGTGCAGGGTTGGGCATCCGACTGGACTTTT11.3333333333333335No Hit
CCGTTAGCACTATTGGGGCACCAGGGTGGCTCAGTCAGTTAACTGCCTTT11.3333333333333335No Hit
GTGTTCAAGCCGGCAGGTGTTGCATGTGCGGGGTTGTGGGGGCCTTGTGG11.3333333333333335No Hit
GAATGTATCGTGAAAGAGGAATACATAGAGAAACTTAGCATTAAAAGTGC11.3333333333333335No Hit
TCATTCTACTTGTATGAAGTACCTAGAAGTGACCAATTAACAGAGACAGG11.3333333333333335No Hit
CCAAAGTAGAGTACAGTTACATGCATAAAATAAGAAACAAAAACAAGGGG11.3333333333333335No Hit
GCATTCCTCCAAATAGCTAAAAGGTTAATCAACCCAAATGTGCTCTGATG11.3333333333333335No Hit
TTTGAATAAAGATGTTGACAGTAAGTTCCTGCCCAATTTCAACATCTATA11.3333333333333335No Hit
ATCAAAGCGTCATTACTTATGAAAACAACACGTGGTTAAATAAGACATAT11.3333333333333335No Hit
AAATAAGCAGAAACGAGAAAGCTCTTATCTCATGTTATAATTCAACAAGT11.3333333333333335No Hit
CAGTACTATGTTCTTTTCCATGATCGCCTGGTCCAAGCGCACGCAAAGAG11.3333333333333335No Hit
GCGACACCCAAAGGACACGGAAAGTTTAACCTCCTGATTTTCAGGTTAAC11.3333333333333335No Hit
GGCCCCGAGTAGAGCCGGGAGACAAAATCACAGTCGAATCAACTGGAACT11.3333333333333335No Hit
TTCCAAAACACCCTAGAGAGAGGCTAAGTCAAATGAGAACTATAGGGACA11.3333333333333335No Hit
TGCGACCCCCTGGACACAGGACACATCAATACAAAATAAGAGGGCAAGGT11.3333333333333335No Hit
TATTTAATGTCAGTGCTCTTATAAGATACCCTCTCTTATTCAGTCTTAGT11.3333333333333335No Hit
GACAAGTTAAATTCATTATTTTTGCCGTATGAGTTATTCAATGTTTGAAA11.3333333333333335No Hit
GCATATCCTGACCCCTGCTCATTTTGATGGTGATAACCGTACCATCCATC11.3333333333333335No Hit
CAATTGCATCTGTACCTACTTCGCGCTACCTTTCTGACATGACCCTCGAG11.3333333333333335No Hit
GCCAAAGAATGTCTTCATGCATTTGATTGCATCATATAGTGGTATTCCCT11.3333333333333335No Hit
GGGCTCATGACAGACGGCGGTGGCCGGCTGGCAGAAAGGTGATTTGGTCT11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)