FastQCFastQC Report
Thu 20 May 2021
HHV25BGXJ_n02_S12_R1_A09-FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHV25BGXJ_n02_S12_R1_A09-FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC39

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGTGAACGTCTTTCAATGGTGATTTATATGCCTTCATGGAGGAATATCT13.3333333333333335No Hit
TAACAAAAGAGAAGAAAGAAGAGCAACAGGATACAAAAAATCCTCCAGAG13.3333333333333335No Hit
GGAGACTACCAGTACCAATCAAATGGATACAGTTGAATATATCGACAAAA13.3333333333333335No Hit
GAGGAGGCCATGGAGGTTTCTAATCAGAATAGGCAGATCGTACATGAAAT13.3333333333333335No Hit
GTTAAAAAGAAGGCCTATCTAAACACATGGGATGCACATTAGAGGTTTCG13.3333333333333335No Hit
ATATTAGGGTGACACGTGCCGTTCTGCATTTTTAAAATTAAATTCCTTAG13.3333333333333335No Hit
GCTGTAAATATTTTCTACTGTCTGTCCGTCCGTCTGGATTACAGTTATAA13.3333333333333335No Hit
GTAAAATACAATAACACAAAACTCACACCTTAATCATTCTAAAGTGTACG13.3333333333333335No Hit
GTACATCAAAGACTACACATACACATAAAGGTGCCATACTGGAGACACAA13.3333333333333335No Hit
TCTCCACAGCATGGATGGTCAAAGCGACGTGTATACAACGTTTCATAGCA13.3333333333333335No Hit
ATTTAGATGGATTCGAGCCGAACGGCTGCATTTAGGGCAAGCTTTCCCAA13.3333333333333335No Hit
CAAAAACACTCAATGAGTGACAACGAAGACATGGAGACTCAAGGCACCAA13.3333333333333335No Hit
GTTCGTTGTATGGATAGTTTCTCTCTTCAAGTGCCTTTAGCTAGTCTATT13.3333333333333335No Hit
GTTGTAAGCCTTGCATAAATTTTAATTGTTCGAAACTATTCTATGTCGCT13.3333333333333335No Hit
CAATTGGTGTGGATGGCATGCCCCTCTGCTGCATTGGAAGATTTAAGAGT13.3333333333333335No Hit
ATTGATGANNNNCNNNNTNNCNNNCTTTNNNTNTNNNNNNNNNNNNNNNN13.3333333333333335No Hit
ATATAAAACCTTTCAAATGATGACACTGAGCTCAATTGCTCTCTTAGCTC13.3333333333333335No Hit
AACCAAGGTAACATTTATCAGTCAGTACTCGACTGCTGAATAAACCCCCC13.3333333333333335No Hit
AGTAGACTCATGGACAGGGACTCAGGATAGAGGGTGACGAAGGGGGAGCA13.3333333333333335No Hit
GCAAAACATATCACATTCTTAGAAAAATTCCGGTGATAACAAGCGCAAAT13.3333333333333335No Hit
GCATAAAGGGGGAGGCAAAGTAGGAGTGATATCAGGGAAGACTACTTAGA13.3333333333333335No Hit
CTTCTGGTACATCTGTTCATCCTCAAGAATTCCCCTTTGGCTTGTGTTGA13.3333333333333335No Hit
TTTCCTCCACTCCTGGTCCTTATGGCCCAGTATCTGCTTCTCAGTTCCAG13.3333333333333335No Hit
AACATTAGCTTTCCATTCCCATCAGCACTGTCAGAAGAGTTTTAAAGTTA13.3333333333333335No Hit
TACCCACCCAGCATGGAGCAACTAAATATGTAGAGCATATATGAACAAAC13.3333333333333335No Hit
GCTTTGAATTTTACCACAAATGCGATAACACGTGCATGGAAAGTGTCAAA13.3333333333333335No Hit
TTCCGCTACACACTTAATTCCAACCTAACGTAATATAGACAAAAACCTAG13.3333333333333335No Hit
ATTGATGACGTTCTCGGTGCCATACTTTTCATCTAGAAAACAAAAACCAT13.3333333333333335No Hit
TCACAAGACACAGAGATTTCTTTCACAATCACTGGGGACAACACTAAGTG13.3333333333333335No Hit
CTACCGGAGCCTCGCTCATAACATATGGCACTCACAAAGCTTCTCAGGAG13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)