FastQCFastQC Report
Thu 20 May 2021
HHV25BGXJ_n02_S12_R1_A08-FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHV25BGXJ_n02_S12_R1_A08-FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACCTGGGCTTACAGACGCACCCCAAGGCACGTCCACGTGGACCAGGGAT14.166666666666666No Hit
AGCGAAAGCAGGGTGACAAAAACATAATGGACTCCAACACAATGTCAAGC14.166666666666666No Hit
GCCCATGTTCCTATATGTGAGAACCAATGGCACCTCAAAGATCAAGATGA14.166666666666666No Hit
CCACAATATATTCAACTGTCTCTCCTTTGACCGATGTTCGAATTATGTTT14.166666666666666No Hit
AAAGCAGGGGGAGTAGGAGAGGGCTCGCCAAGCAGGGAGCCTGATGAGGG14.166666666666666No Hit
AAGATGCTCCATGAGCTGTGGTGGGAACTCTGACTTCCCCTGGGAAGCCC14.166666666666666No Hit
CTTTCACTCAAATAAATAAATAAAATCTTAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGG14.166666666666666No Hit
CTATTATACTCTGTGTTTCTAGGAATCTGATTACTCTAAGTACCATATGT14.166666666666666No Hit
TCCCTACCCAGGACCTATTATTTAGTGGGAAAAATGAAGTGCAAAATAAA14.166666666666666No Hit
GGATGATGGCAATGAGCTAGGCGATGACCGCGGCCATGAGATGTGTGGAC14.166666666666666No Hit
ATCTTGGTGTCCTTGGTTTTCATTAACTTGATACAGTAATTTTAAAAAAA14.166666666666666No Hit
AGTTAAAAAGAAGGGCTATCGCAACACCTGGGATGCAGATTAGAGGTTTC14.166666666666666No Hit
TTAACACTGTTACTCCAATACACATGTCAGCTGAATCAATTACTCCAGAC14.166666666666666No Hit
CTGCTGCATTTGGAGTTTTAGGAGTAGCAAGGGGCAGAAGGGGTTGGGTG14.166666666666666No Hit
CTCAAAGCCGAGATCGCGCAGAGACTGGAAAGTGTCTTTGCAGGAAAGAA14.166666666666666No Hit
GAGCAAAAGCAGGAGGCATTAAATACCATACGGAGCACAGGATGAGATTT14.166666666666666No Hit
ACACCTTGTCAAACACCCAAGGGTGCTATAAACACCAGCCTCCCATTTCA14.166666666666666No Hit
GAGCAAAACAAACGATGCTGGATCAGACCGAGTGATGGTATCACCTCTGG14.166666666666666No Hit
GCTTCCAAGGGGAATGCAGTCTCCTGCTAGTGCTGTGGTCCCTAACATGG14.166666666666666No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG14.166666666666666No Hit
CATTTCTTCAATTAACCACCTTATTTCCTCAAATTTCTGTCCCAATTGCT14.166666666666666No Hit
GTGACTGGCTGGGTCAGAGCTGAGCTCCGGATCCTCGACAGGGAGGGAAC14.166666666666666No Hit
GCATGCCACTCTGCTGCATTTGAAGATTTAAGAGTATCAAGTTTCATAAG14.166666666666666No Hit
TGCATGTACCATCTGCCTAGTCTGATTAGCAAACTCCATGGACTCCGCTG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)