FastQCFastQC Report
Thu 20 May 2021
HHV25BGXJ_n01_S12_R1_A09-FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHV25BGXJ_n01_S12_R1_A09-FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGAGAAGAATATAAAAAATCCGACCACAAGAGGAGAAACAAAAATATGAA13.3333333333333335No Hit
AGGTAGTTTTTTACTCTAGCTCTATGTTGACAAAATGAACATCTTCAACA13.3333333333333335No Hit
CTGTTGCTCTTCTCCCAACCATTGTGAAATCTTAATACCCTTCATGTACT13.3333333333333335No Hit
CCCCCAGGGAGACTACCAGTACCAATGAACTGGCGACAGTTGAATAGATC13.3333333333333335No Hit
ATTTGAAAGAGTGAACACAGCAAATACATTCACTACTCTGAGCCTGAATG13.3333333333333335No Hit
GTCCTACTCCTCTGCATTGTCTCCGAAGAAATAAGCCCCTTCAATACTCA13.3333333333333335No Hit
GAAAATATACAGAGATTCGCTTGGAGAAACTGTGATGAGAATGGGAGACC13.3333333333333335No Hit
ACTTCAGATAGGTAAGTCTCCATGAATGATGTCCAAGTCAGTAGTTCAAA13.3333333333333335No Hit
CTTGTATACCCATGTTCATAGCAGCATTCCTCCAAATAGCTAAAAGGTTA13.3333333333333335No Hit
CCCAAAAGTGACAAATAGGGAATTAGTAGACAATAACTTTAAAACACATA13.3333333333333335No Hit
TTATAGGTGCCATGCTCAGGATGTTTCTGAACCACTCGGGTTGATTTCTG13.3333333333333335No Hit
GTTGCATCTTCGCCATTGTTTGCTTGGCGACAAAATCTCGTTATTTCGTC13.3333333333333335No Hit
TCCTCGGGATCTTCTCTTCATTTTCAAGGTCCTGTATCTCTGCTAGCACC13.3333333333333335No Hit
TTGAGAGAAGTGTGAGGTATTAAAGTTCCCTATGGTATTGGTGCTGATTG13.3333333333333335No Hit
GTGCGAGGGCCACTGCCGACGAGGCTTCAAACAGTGCGCGAAACACCCCT13.3333333333333335No Hit
ATACTAATAGCCCTACCTTTGATTGGGTTTGATCCAACATCTTCTTTAAC13.3333333333333335No Hit
GGAGTGTACATAAATACGGCATTTCAGAATGCATCCTGTGCAGCCATGTA13.3333333333333335No Hit
GAAATCCAGAGTGTGAATCACTCTCCAAAGCAAGCTAATGGTCATACATT13.3333333333333335No Hit
CCACTACCTGAGGATAATGAACAAAGTGGGTATGCACAAACAGACTGTGT13.3333333333333335No Hit
GCAAAAGCAGGGGGAGTAGGAGAGGGAGAAGCAGGCCCTGATGCAGGGCT13.3333333333333335No Hit
TTACAATGCCGAACTGTTGGTTCTATTGGAAAATGAAAGAACTTTGGACT13.3333333333333335No Hit
CACTCATTCTGAGGGGATCAGTTGCACATAAATCCTGCCTGCCTGCTTGT13.3333333333333335No Hit
TCCCAGTGCTGGGAAGGACCCTAAGAAAACAGGAGGACCCATATATAGAA13.3333333333333335No Hit
ATCTGCTACGGTGTGTTTCGCTGAATATGCTTAATCGCCGTACCTGATGT13.3333333333333335No Hit
GTAAGTCTCAAATGGCTGCATCCCACAGCAGTAAAATGCCAACAACATTC13.3333333333333335No Hit
TCTTCATTCTTTTACTCTCGAACATGTACACTTTACCTAGTCTTGCCTTT13.3333333333333335No Hit
ATCAAGAACATATAAGAAGAGGAAGAAAAAGCAGGGTTTTTCCCCCTTCT13.3333333333333335No Hit
AAACAAGTCTTTGGGCTCTGGATCTGAGCTCACAGAACAATCATTGCTGC13.3333333333333335No Hit
AAACAAGTCTTTGGGCTCTGGATCNGAGCTCACAGAACNNNNATTGCTGN13.3333333333333335No Hit
CTATTAGGTTTTGCCGGTGTATAGATGTTGCGTAAGAATTAGTCTTTCAA13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)