FastQCFastQC Report
Thu 20 May 2021
HHV25BGXJ_n01_S12_R1_A08-FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHV25BGXJ_n01_S12_R1_A08-FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGAAGGATCTTTCCAGAAGTCTTCCCTGTACTGAATTTGCTCTACCAGCT14.166666666666666No Hit
CTTGTATAGTTTAACTGCTCTATCCATGTTGTTCGGGTCCCCATTCCCAT14.166666666666666No Hit
CTACGTCCCCTTGCCCAATTAGCACATTAGCCTTCTCTCCTTTTGCAAGA14.166666666666666No Hit
GTGTATACATACAATGGCATATTACTTGGTCTTCAGATGGATGGAAATCC14.166666666666666No Hit
TTCCTCCACTCCCCTGGGTGACTCTCCCATTTGCGATGTTTACGATTTGT14.166666666666666No Hit
GAGTTAATTATCCGATGTAAAGACAAGTGGGTAGCGTATAACACAGCTTA14.166666666666666No Hit
CAGGTGGTGCTGGCCACGGCCACGGCCCCCAAGCCCACTGTGTGCATCAG14.166666666666666No Hit
GTATGAGGCAAATCACCTCTCACATCGATGTGGTCTGTGTTTAGCTCTGA14.166666666666666No Hit
TTCCTCGGCAAAGAGAAACGTGAACAAAGGGACCAGGTCATATTCTGCTC14.166666666666666No Hit
TGTCTAATCACTGTATTATACATCTGAAACTAATGTAACATTGTGTGTCC14.166666666666666No Hit
TTCTGAACCACTCGGGTTGATTTCTGGTGATATATGTAATCATCGCCAGG14.166666666666666No Hit
CTCAGTGAAAGCCCTTAGTATTATCAAGGTCTCTAATCGGTTAAAGATTA14.166666666666666No Hit
CTACAGGACCTGCAAGTTAGTGGGAATCAACATGAGCAAAAAGAAGTCAT14.166666666666666No Hit
CGATTAGAGACCTTGATACTACTAAGGGCTTTCACTGAGGAGGGAGCAAT14.166666666666666No Hit
GAGGAGGAGTCCAACACGGTGAGAACGTGGTCTCTTAAGGACTAGCTTCC14.166666666666666No Hit
AAACAAGGGTATTTTTCCTCAACTGTCATACTCCTCTGCATTGTCTCCGA14.166666666666666No Hit
GTGGCATACACTAAATGCAGAGGAAGCAGGTTACAAATTAGAAGGTACTG14.166666666666666No Hit
CTCTGCCTGCCTCTCTGCCTACTTTGTGATCTCTCCCTCTCTGTCAAATA14.166666666666666No Hit
CAGTATTCTTGCCCCCACTTCATTTGGGAAAACAACTTCCATAATCACAT14.166666666666666No Hit
GATCGGGTTCGTTGCCTTTTCGTCCGAGAGCTCGAAGACTCCCCGCCCCT14.166666666666666No Hit
ATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGAAGGCAAGAGAAGAACCCC14.166666666666666No Hit
CAATAGAACCAACAGTTCGGCATTGTAAGTCCAAATGTCCAGGAAACCAT14.166666666666666No Hit
CAACAGGTTGCTGGAAACATAGGAAACCAGAAAATGGGTATCAATATCCA14.166666666666666No Hit
GTTAAACTATACAAGAAGCTCAAAAGAGAAATAACGTTCCATTGGTACAA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)