FastQCFastQC Report
Thu 10 Sep 2020
HHH35BGXF_n02_1793_d12.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHH35BGXF_n02_1793_d12.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTACCCAGCTGTCCTGGCAAAGGGGTGGGCTGTCGAAATAAAAGCTGTGG13.3333333333333335No Hit
TCCCTACCCATGTTCCTATCGCAGTTTCCATTAAAGATGAAAAGTTGCCG13.3333333333333335No Hit
ACCCGGCCGAGCGGGAGGCAGAGGGAGAAGCATTTTCACCACCGCGCAAG13.3333333333333335No Hit
GGCAGAAGCAGATTCCCCATTGAGGAGGGAGCCGGACATGGGGCTCGAAC13.3333333333333335No Hit
CCTAGAGAGTGTAGAAATGCCTTCTAATATTTGTCCTTTTCTGCAAGAAG13.3333333333333335No Hit
CTTGTGTCCTGCTGCTTCGGAGACCGCAGGCCACCGATACTTGTCATGTG13.3333333333333335No Hit
GTGTTAACTATATACTTTATGACTTTCACTCCACCCATATTCCTGTATAA13.3333333333333335No Hit
AGGAATCAGTCAGTGCATATGTATGCTTGATTTAATTATCTATATTACTC13.3333333333333335No Hit
GATTATGAGAATATATCAAACATGCCTAACTCTTCTCCCCTCTGAAACTT13.3333333333333335No Hit
ACGCCGAGAGATGGCATTGTGAGCAGAGTGCCATCCTAGGCCACGCACGC13.3333333333333335No Hit
GTCAGGCCCAGTCTTTGGCCTGGCGTTGTGGATCTAGTGCTCATTCAGTC13.3333333333333335No Hit
CTCCCAGCTATGAGGCCTGTTTGGTGCCTGTAGCCCTGTCATCCAGTTGG13.3333333333333335No Hit
CTCCCAAGTCTCCATAAAGCAAGAAGCTGTCTCACTAGAGAAAGACTACA13.3333333333333335No Hit
GGCTAATCTCTGCCAACAAGATAGGTAGAAAGACTAAGGAAAGAGCATTC13.3333333333333335No Hit
GATAAAGCATGACAACGGCCCCTAAATTGACATGGCTAAAATTACAATAC13.3333333333333335No Hit
TCACTGGAGCGCTCACTAGGCAGGGAGCACTTGCTTAGTGACTGACAAGA13.3333333333333335No Hit
TAAGGAAGGACATCCAAAGAATCAAACGTCAAGGAGAATTGCAATAAAGA13.3333333333333335No Hit
GGGAAGAGGGAAGAGTCCAGATGGACTTGGAACAAAGGGTAGGATCTGGA13.3333333333333335No Hit
GATCTCGAGTGTGTGTCCGTGGTTGACAGGTTAGCATGCCATACCACCCC13.3333333333333335No Hit
GTAAACCACGGGGTTGGGCAGGACACAAACAGATAAGATTCAAATGAAAA13.3333333333333335No Hit
GTGTTGACTGTGCAAAGAGAAGGAGAGTTTTGAATGGGACTTTTGTTAGA13.3333333333333335No Hit
ATGTTATACTACATGGCTTTTCTTTCTCCATGAGGGGTGATAGTTGGAAA13.3333333333333335No Hit
CCATGGCTCACAATGAAGGGAGATAATAGAAGCTCATTCAGATGAAAATA13.3333333333333335No Hit
CCCCAAAACATCTGGCTCTAAGATAAGGAATGAGGAACCATAACAAACAA13.3333333333333335No Hit
CCTCAGAGCAGTCTGAAAATCAAGTGCAGGCCACTCAGCATCATACATCT13.3333333333333335No Hit
ATATTAAAAAAAACATTTAACTACGCCAAAGAGATAATGCAAAGCGGCAC13.3333333333333335No Hit
AGCATATGCTAGAGAAGGCAGGGTCATAGGGAGAGAGGGTATCCTACAGC13.3333333333333335No Hit
AAACTAAGCCATTCATTGAAATATTAATGAAGTAAGAAGAAAGGATGATA13.3333333333333335No Hit
GCACTGTAATTGGCACCCACCCGGCTACTTGCACCTCCACCAGCAAATTA13.3333333333333335No Hit
GGCCTGAGCTGGTTTCCCAAAGAACTTGTAAAATTTGACAATTCAGCGGC13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)