FastQCFastQC Report
Thu 10 Sep 2020
HHH35BGXF_n02_1787eye_d08.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHH35BGXF_n02_1787eye_d08.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
NNATAATTGCGATTTATCTTTTGCATCATCTCCCATTCTCAGTATGGAAA12.083333333333333No Hit
CCTTTTATTGCTTGTGGACCAACGGAATGCAAACACTTTGCTCTAACCCA12.083333333333333No Hit
GAGTGGAAGACTTGTTGCTAAACTTGTTGCTACTGATGATCTTACAGTGG12.083333333333333No Hit
TCATTGGATGAGGAAGGGACAGGGCGAGTGCTACGACGACTAACAGAACT12.083333333333333No Hit
GTTCCTAGTTTTACTTGCATTGAATAATTTCCAGGATTCAGGTACATGAC12.083333333333333No Hit
TACTAGGATCGCTCTGTGCTTTGTGCGAGAAACAAGCATCACATTCTCAC12.083333333333333No Hit
GTTTCGGGAAGGACAGAGTGTAGTACGGGCCCGAACCGAGGGTTCTACAT12.083333333333333No Hit
GGGGCAAACTAAAAAGAAGCTCGATGGCAACCGCTGGAATACAAATCAGA12.083333333333333No Hit
TGGTATGTGTAAGTATATGCTTCTCCATATTTTATTTTGAGCAATGCATT12.083333333333333No Hit
CCCATAGAGTAATTCAGTATGTATACAGCGAGCATTTATGTCTTGTTCTA12.083333333333333No Hit
ACATTCGAGAGGGCAGAATAATAAAAGAAATATATCAAACAGGAAGAGTA12.083333333333333No Hit
CCTCCATGTTGTCAGAGAGTACTTCCTTAATTGCTTCTTTAGCCTGAATT12.083333333333333No Hit
GTCCGGGAGCAACCAATGCCACCATAAACTTTGAAGCAGGAATTCTGGAG12.083333333333333No Hit
GGTCTGGAAGCATTTGTGTTTGGTTTCGAAGCATCCATTTCCTATGTCTA12.083333333333333No Hit
TATCGGGTCTCTGTGAGGAATCGTCGTGGTCGTGAAGGGTCTTGTGGGGG12.083333333333333No Hit
TCTATCTGCTTTTTAACACCCAAAGCCCAGGAAAGAAAAAGAAGATTACT12.083333333333333No Hit
TATTTGGCCCCTTTATTCGTATTTTCATGTTTACTCCTCTTTTAATTTGA12.083333333333333No Hit
TCCATCCTCTTTGGCTCTAAAAAATTCTAGCGTAGTGAACTTAGGCGGGT12.083333333333333No Hit
GAAGCAGAGCCAATGCTGTCAGGGAATTAGAATCCAAAGACCAGCGAATG12.083333333333333No Hit
CATCAAAGCATATAGATTTACCTGCTTTACAATCATAGCCTGCGTACCCG12.083333333333333No Hit
ACACAGTACTTCTACCATTTATCTGAATAAAGTCATTGCTCAGTTAGATC12.083333333333333No Hit
AAATGAGCCCTGTGTGCATGTGATGGTTGTTTCTCGCCCAAAGCAAAGAG12.083333333333333No Hit
GAAGAACAACAGGATTGGACGATGATTCCTTTTGGAACAAGAAAGAAAAG12.083333333333333No Hit
CTGATATACAGCAAGCACTAAGTGGTGCATCTATCTGCTGTTTCCCACCC12.083333333333333No Hit
TTCTACTACTAATGGTAGTAACATCCAATGCAGATCGAATCTGCACTGGG12.083333333333333No Hit
GATTTATAGAACTTGGAATAACAAAAGGATTGGCCGATGATTACTTTTGG12.083333333333333No Hit
GTAGTAACAAGAGCATTTTTCAGAAACAATTAATCTAAGTAAGGAAAATT12.083333333333333No Hit
GGATGTCTCTTGACGAGAGAAACGCAATTGGAGTAAAAAGGCTTAAAGTA12.083333333333333No Hit
CAAGAAAGTGCCTGCAATTGCATCGGGGGAGATTGTTATCTTATGATAAC12.083333333333333No Hit
GTAGAAACACGAGCCTTTTTTCATTTTAATCATTTGTTTGTCACATGTAT12.083333333333333No Hit
AATGAGAGACCAAGAGGTCATGAAAACTGACCAGTTCATAAAGTTGTTGC12.083333333333333No Hit
AATATACTGTGTTTAGGATTTGCTCCCTATTTGTGAGTGGGAGGGAAAAA12.083333333333333No Hit
GAGACACAATTGCCTACCTGCTTTCATTGACAGAAGATGGAGAAGGCAAA12.083333333333333No Hit
CTAGAAAATCATAAGAAACTTCCATAAATCAAGACTTGAAAAGCCCCAGT12.083333333333333No Hit
GTATGATCATCAGAAGCAACAACTTTAGCAACAATTCTTCCACTCTGGTA12.083333333333333No Hit
ATCAAGGGGACTGACACATTGTAAGCATTCTGTGATCCATTTTCGTATGG12.083333333333333No Hit
TCTGTGTGCTGTGGCACATCTCCAATTAAGATGCTAGTGGATCTGCTGAT12.083333333333333No Hit
ATCCATAGCAAAAAACATAACCATACGAATTTGAATTTCCCTTTAGTCAG12.083333333333333No Hit
CCTCCGTGTTCTGTTTGATCTGGGGAGCCGCCAATCTGAGATAGATTATG12.083333333333333No Hit
TAAGAGCGAATAGTTAATTGAGGATAAGATGGCCAGCGTCTTCCGACTCC12.083333333333333No Hit
GTAAGATCATCAGTAGCAACAAGTTTAGCAACAAGTCTTCCACTCTGGTC12.083333333333333No Hit
TCACAGAACCGGAATGGACATAGCATCGTTTCTCTTGACCGGGATCAACC12.083333333333333No Hit
TATGCATTCAATCTATGCAGAGTTGATAAGGACTTGTATCCATTGGGGTG12.083333333333333No Hit
ATATTACTCGTAGTGCTTTTACAAATGATCCTTTTACGAGTTTTCCTTCT12.083333333333333No Hit
GTCATTGGATAAAGCACTATATCTTTTCCTTATACCTACTGTACCGGGCT12.083333333333333No Hit
AAGTTAACAGAATTAGCTACACTACAGGCGCTGACATCCCTAACTTAGAA12.083333333333333No Hit
AACCTGACCCGATATTAATAATGATAAGCGAAAAAGCTAACGAAAATTTC12.083333333333333No Hit
GTAGTAACAAGAGCATTTTTCAATAACGTTTCTTTGTAATGATGACAAGC12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)