FastQCFastQC Report
Thu 10 Sep 2020
HHH35BGXF_n01_1787eye_d08.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHHH35BGXF_n01_1787eye_d08.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAGTGATCGTAGAGAAAGGCCCAACCCAGTGACTCAACGGTACGTCTTTT12.083333333333333No Hit
GAGTAAAAGCAACAACTAAAACAAAAAAATCACAAGACCAGTCATAATCG12.083333333333333No Hit
CTTCAACCCCAGGGAGGTGCCTTGATGACAGATCAGCAGACCCAGCGGAT12.083333333333333No Hit
TCTTTTTGGTAATTGTGTCTCAAAATTGATACATCTCTGTTTATCGTCGC12.083333333333333No Hit
CTTTTTGCTGTGTAACGGTTATCTCTACAAGCACATACTATGGTTTTGTT12.083333333333333No Hit
CCGTTAAGGCTTGAATCAACAGTAGAAGTCTCCTAGACTCGGCACTAAAC12.083333333333333No Hit
CCTGTGCTCCTCCTCCCGTCAATACACTCCTCAGGCTCGGCTCAGGATCC12.083333333333333No Hit
TACTATTTCAGTTGGGCCATCAACATCATCTGGTTCTTCTTCTATGTCAT12.083333333333333No Hit
ACCTTTCAGAAAGCACTCCTAATTAGCCCCCATAGATTCGGAGAACTAAA12.083333333333333No Hit
CTGCTTTAGCACTTCCATTACATCCTTTGCTCTTCCTTCCCCAGTCTTTT12.083333333333333No Hit
GCTTGCCCTCATTGTAGCCGATGGGAACCCATCGTACCACATTGCCTCAA12.083333333333333No Hit
TTGCTAGACCTTCTTTGGCTAATGTCTTCTGTTGTTTGAACTTTCCCTCA12.083333333333333No Hit
GTTGTCATTTAGTATCTCCATAACCGGAATAATATTAAATGAGAGTATTC12.083333333333333No Hit
AGCACGCACTTTCTTAAAATGTCGCTGTTTGGAGACACAATTGCCTACCT12.083333333333333No Hit
TCATTGGATAAAGCACTATATCTTTTCCTTTTAACTACTTTAACGGGCTT12.083333333333333No Hit
GGGTGTAACAGGTCTGACTTCGTGAAGTATTGAGGCTTTCGCCGAAGGTG12.083333333333333No Hit
CTGTGTGAATGTGATGCTTGTTTCTCGCACAAAGCACAGAGCGTTCCTAG12.083333333333333No Hit
CAATGTTTCTAATAATGATTATGATACAACCATGTCAGCTATTATGGAGC12.083333333333333No Hit
CTCCATGGTTGGGTACGAAGCCATGGCTCTTTACAATATGGCAACACCTG12.083333333333333No Hit
GGAACGCTCTGTGCTTTCTGCGAGAAACCAGCATCACATTCACACAGGGC12.083333333333333No Hit
AGCCCGGGCTTTCTTAAAATGTCGCTGTGTGTAGCCACAATTGGCTACCT12.083333333333333No Hit
TTGCTGCAGACCTTAAGAGCACACAAGAAGCTATAAACAAGATAACAAAA12.083333333333333No Hit
GCCCTTCTTTGGCTAATGTATTCGGTTTTTTGGACTTTCCCTCAGTCCTA12.083333333333333No Hit
GGATGTCTCTTGAAGAGAGAAAAGCAATTGGAGTAAAAATGATGAAAGTC12.083333333333333No Hit
CGGCAGAGTGGATAAGGACTGGGAGCCAGTGGTGTGTGTGCGTCATGTTC12.083333333333333No Hit
CCGATATATGTCCATTCTTTACCATCATGGCATGCGGACCCGCTCCAAGC12.083333333333333No Hit
AGCACGCACTTTCTTGTGTCCTTAGGATGTTTTTTGCATAGGAATGGTAT12.083333333333333No Hit
GATTCTCGCCTGATAGCGGTCGATGGCATTCGAGAACAGGTCCCTCCTAG12.083333333333333No Hit
GGGGATGAGGTGGGCGTATGGGGATAAGCCCCCCAGTGCTCCTAAGGGGA12.083333333333333No Hit
GGGTAATTCTGGACCTCATTATGCAGCACACGGTGTTTTAATTATGCTCC12.083333333333333No Hit
TTCTGGAGTGCTATGAAAGGCTTTCATGGCAAAGAGCCCTTGCCTATCCT12.083333333333333No Hit
GGCCATGAAATGGAGCGCTGATAAAATAAAAGAACAAATTGAAAGAATCT12.083333333333333No Hit
GCCTAGTCTGAAGTATCACTGATCAGGGACCATAAAGCAATGATGCTACC12.083333333333333No Hit
CGCCCGCACTTTCGTCACATGTAGCGGGTGGGCGCCCACCTGGCCGCCCT12.083333333333333No Hit
ATGCTAAACAGATCAGGACAAGGTATTTGAGCATTCAGGCTTTTTGTTTT12.083333333333333No Hit
ATTGAGATCTCTGGGGGCAAGCCAAAAGAATGTTGAAGGAATTGCAAAGG12.083333333333333No Hit
GTTTTATGATCAGTTCTTATAAACTTCATATTCCAAGCGTGCGATTACTT12.083333333333333No Hit
GACCAAATGATGGAAGCATAACAGGGCCTTGCGAATCTGATGGGGCAAAA12.083333333333333No Hit
GGGCGAAGGGTAGTAACATCCAATGCAGCTCGAATCTGCACTGGGATACC12.083333333333333No Hit
GAGAAGAAAGAAGAACTCCAGGATTGCAAAATTTCTCCTTTGATGGTTGC12.083333333333333No Hit
AAACTGACCAGTTCATAAAGGTGTTGCCCTTTTGTTTCTCCCCACCAACG12.083333333333333No Hit
CAACAAAAGTGAGCCTGAAAGTAAAAGGATGTCTATTCAAGAGAGAAAAG12.083333333333333No Hit
GTGCCGCAACACATACTTCATCATAACTGTAGAGGCTTTACAGTAGTTGC12.083333333333333No Hit
GTCTGGCGGTTAAAGGACAATCTCATCTGAGAGGAGATAATGATTTTGTA12.083333333333333No Hit
AAATGTGAGGCCCTATTGGCCTTAGGTCCTCCCATTTCACCTTCTTAGGT12.083333333333333No Hit
GTGTCCATCATATTTTACATACACTCCCGTCCCCATTCTGTTGGTTTTTG12.083333333333333No Hit
CTTGAGGAACACTGCTACGCTAAGTGTTGCAACCTTTTTGAGGCCTGTTT12.083333333333333No Hit
AGCCCGCACTTGAGAGAAAACTAAAGAAAATGCTGGGTCCCTCTGCTGTA12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)