FastQCFastQC Report
Fri 14 Jul 2023
HGWL2AFX5_n02_daplib_ColAmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGWL2AFX5_n02_daplib_ColAmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length76
%GC36

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAAGTGCAAGCTAGCTCACCGGTGGCCATTGTAGGCTAGCTCGCGTCCCA13.3333333333333335No Hit
AGACGAGGATACCTAGCGATTGGAGAAGACGATGACGGAAAATATTGAGT13.3333333333333335No Hit
TTTCTCTTGCCAATCTTGGTGCAAGCTAAGCAACATTGTACTCCATGTCA13.3333333333333335No Hit
TATGTACTACGTTGCTAGAGCAATACTGATGGCTCCAAAATTCGGTTTGG13.3333333333333335No Hit
TTATGGCTAAATAAAATATATATAAAGACAAGAATATTCAATCAGATAAG13.3333333333333335No Hit
ACTAACCTCTCTGGTTTTGAACAACCTGATTATTCACGTAGAAAAAAACT13.3333333333333335No Hit
CTCACATAAACACATGGATAAAATCTTAGAACAAAATACGGACTTTGCAA13.3333333333333335No Hit
CATAGAATTAACCTCATTTGACTCAGATTTATATTTGATTATCTAATTTT13.3333333333333335No Hit
AAGGACGATCAAACCAACATCATAATATTAGTATCGAAAACAATATATAT13.3333333333333335No Hit
ATCTTTGGATTGGTCAAGACGTCGATTGGTTCTCTGCTTTTTTCTCTTTT13.3333333333333335No Hit
CAAAATCAACTCCTTCTTGTTGCGTGTAGCCTTTTGCTACTAAACGAGCC13.3333333333333335No Hit
CTCTAGATGTAAGAACATACCCAAAATCTGATCTTGAAATAAGACCTCTG13.3333333333333335No Hit
TAGAAGACAGAAAGCCAAAGACTCATATGTATTCGGCTACACCATGAAAG13.3333333333333335No Hit
TAAATCAGTTAAAGTTTGTTTGATGGTAACTACTACTCGGATAACCGTAG13.3333333333333335No Hit
GTATAGAAGTTATAGAGTCATAAAGTTTTAACCAAAAAAAAAAAAAAAAA13.3333333333333335No Hit
TTACTGCTTAGTCTTCCACAAGTAGACATTTATGAAGGCACAACAATCCA13.3333333333333335No Hit
AACCTTTTTGAATTCCGAAGTAAATCAATGGAAAAACTGGTTACGAAGTC13.3333333333333335No Hit
GAAGATGATTCAGTCATGAGTCGTCCTCCTGGTGTGAAGTCAGCCAAAGC13.3333333333333335No Hit
AATATAGAAAAGATAAGCTATGCTAGCTATACTTACGATTCAAGTGTTCA13.3333333333333335No Hit
CCTGCATCTCTTAGACTCCTAACGGCAGAAGATTGTGAATCACTGGAGAG13.3333333333333335No Hit
CCATGTAAGCTTTGAGAAGCTAGAAGAAGGGTGGTTAGTGTTTTGGAGTC13.3333333333333335No Hit
AACAAGATCCAACAAAAAGTAGTAAACTGACTGATGATTTAGATTTAAAT13.3333333333333335No Hit
ACGTACTAAATAACCAATATTCACATCATGATGCTTATCAGATAGCAGAG13.3333333333333335No Hit
TGATTTACATGTTAATTTTGGACCGAAGAGGCAATTGGTTTCCGACTAGC13.3333333333333335No Hit
ATGACTGGTTGTCGTATGTATCTCTAAGAATAAATTCATTTGTGTGTTGA13.3333333333333335No Hit
ATCGTAAGTGCTCATGTAATATGTTTATGAGTAATCAATTGCAAACGGAT13.3333333333333335No Hit
AAGTTCTAATACTCAATCATACACATGACATCAAGTCATATTTGACTCCA13.3333333333333335No Hit
TTATGTTATCCGCTATGTCATGTTTCAAATTATGATAAGGCTTCTACTAT13.3333333333333335No Hit
GAATTCTAATCGCTCAGGCCAAGTCAAATAAGAACCTCTATTTAGACGAA13.3333333333333335No Hit
ATAGGATGTGGCCATCGGAGCTGCTGCTAAACAGTACAGTGGCTATGAAC13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)