FastQCFastQC Report
Fri 14 Jul 2023
HGWL2AFX5_n02_daplib_C24AmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGWL2AFX5_n02_daplib_C24AmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length76
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTTAATTTTGCCAATGCATTGTTCTAATTCATTAGTTCATCAAACTTCAA12.083333333333333No Hit
AGATGTATTCTAGGTTCCTTAGCATCGGTACCTGAGAAAGTAGAGTTAGC12.083333333333333No Hit
ATTATGGGGCTGGGTGGAGTCTTTTTCTGTCCGGGTGGATGCCACCGGGG12.083333333333333No Hit
TGAAACCAAACAGCATAAGAGTTTGAAATAGTTTGGTACTGGAAGAGTTT12.083333333333333No Hit
TGACAACACTTTCCTAATCTAAGCCCATTGACAACTCTTCTCCTGGAGTT12.083333333333333No Hit
TTATAATTATGAAATACAAAAAGTCAAGTTTTTGATTTTCTAGTAAAAAA12.083333333333333No Hit
ATACCAGGAATATCAATGAACACGATTATTGCGATTGCACAGGATACCCG12.083333333333333No Hit
ATCCAACGGAGATTAGGGTAAAAGACTAAAAGGCGTGGTTCTTCTATAAA12.083333333333333No Hit
TCATGGTGTAGCCAAAGTCCATATGAGTCTTTGGCTTTGTGTCTTCTAAC12.083333333333333No Hit
TTCTTTTTTCGGACAAAAAATAAATAAAATTAAAGACTACTTAGCCTAGC12.083333333333333No Hit
AAGTAGTGTATCCTTGTTAGAAGACACAAAGCCAAAGACTCATATGGACT12.083333333333333No Hit
GAGCAGGAGGCTTATACTCGGACGAGTAACGTTCTGCAGGCCGTGGATGG12.083333333333333No Hit
AAAAGAGAGTCGCCGAGAAGAGATGAAAGTCGATTGATGAATCGTCTTAC12.083333333333333No Hit
TGATGTCATGTGTATGATTGAGTATAACAACTTAAACTGCAACCCTATCT12.083333333333333No Hit
AGAAGCTAAAAAGGGTATCCGGAGCAGACGCTAGAATCGGGTTCTTTGAT12.083333333333333No Hit
AGATTCAAGAAACAACCCCAATCATCCAAAACAATGTAAAACAATTCACC12.083333333333333No Hit
CAAAGTCTTCACACGTTATCATCTAGCTAAAGAAAGTTTTTTGCAATTGT12.083333333333333No Hit
TGATAATGCTGGTGAATTCACATCTCAAGGTTTTAATGACTATTGTAGAT12.083333333333333No Hit
CTGAGCTTCATGTTACTCTTTTCAAGAGACATGTCAGATCGAGGGAGATC12.083333333333333No Hit
TAACAAAAAAATCAAGCTATTCTCCATCTACCTTTGATGTGCAGCTAGAT12.083333333333333No Hit
TCATGGCTCAGACACTCATATTCTGGGCTCGTCAGCCGTTCTTGACCAGC12.083333333333333No Hit
CTAAGGATATAATTGATAAAACTCCAACCAGAACCGAACATAAACCTTAC12.083333333333333No Hit
ATAAGACTACTCGCAGGATCCACCAGGTAGCATTCAACGATCACGGCAAA12.083333333333333No Hit
TCATTAAGTTAGCTCTGTCTTCGCCTTGTCTCGCATCTCGTGGACATTTT12.083333333333333No Hit
GTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGATGGGTCGGCCGGTCCGCCTTT12.083333333333333No Hit
AAACTTTTAGACCTGTAACAAGATTTGAATACAAATTAGTCAAAGTACTC12.083333333333333No Hit
ATCCGACCCGGCCCATACACTTTGGTTTGCTATTCCACTCATACACTGAC12.083333333333333No Hit
ACAATAATACAAAGTTTGGATCCTCAATTCATAGTTACAGTTACATCAAG12.083333333333333No Hit
CAATGCAGGTTGAATATGTATTAATGGAGAGAAAGCAGGAAGATGCATAT12.083333333333333No Hit
GCTCTTCTTCATCTGCTTCTGCTTCTCCCTCTACAGAACTTCTGGTTATC12.083333333333333No Hit
TTCTGTCATAATCCTCGTTGTAATTGCCATCCGACTGAGCCAAGTTAGAT12.083333333333333No Hit
TTACACGACCTCCTTGTGTACCAACCTTAGGCGTTAGACGATAATTATTC12.083333333333333No Hit
ATACTAGGCGGTGCAAGCGCATTGATCTCTTTGTTCATCCTATCTGCAAT12.083333333333333No Hit
CACTAACCGACCTTCTTCTTGCTTCTCAAAGCTTTCATGGTGTAGCCAAA12.083333333333333No Hit
TATTTGTTTCTCGACGAAGCTTGAAGGATGAGAACCAGCGACGGCGTTGA12.083333333333333No Hit
TGTTAGACTTATGAGATACAGTCAATCTAATGATGTTACTCGCTCGAGGA12.083333333333333No Hit
TTTGTCGCTAAGATTCGACCCTCCCCTAAATCACTCCAAAAAAAACAATC12.083333333333333No Hit
CTTTTGTATTACTCAAAGTAGAAAACGAGTGTCGCGGCACTGTCAAGCAG12.083333333333333No Hit
TTAAAACAAATAAATTAAAGTTATCGATTCACCAAAAATGTACAATTAAG12.083333333333333No Hit
TATATCAGTAGAAAATCTATAAGGAGTAATGTGTTTCGTTGGCGTTTATA12.083333333333333No Hit
CCTAGTTATTCCTAAATCAACTAATCATTTGTTTCCTGAGAATACCCAAA12.083333333333333No Hit
TTAAACCGCAACAAGATCGTAAAGGAGTAAGAATTGTATCCTTGTTAGAA12.083333333333333No Hit
GATTGTTGTTGAGTGATATTGATTGTTGTGTCTGTGAAATTGGAATATGT12.083333333333333No Hit
CTCTTCGTTTTCTGATTCATGATGTGTGCTGCTTAGAGCAACCACCGCTT12.083333333333333No Hit
AAAATTGACAGGATTCAAGCGTAGCACCTGAACTAGTGTAAAGCTCCCAA12.083333333333333No Hit
AAAGTCAGGATTCGAATAGAATAGTAACTCTCACAGTGATCTTTGAATAC12.083333333333333No Hit
TTATGACAGGAGGACCTCGACGCTTGCCTTTTACTGTTCCCCCACTTGGT12.083333333333333No Hit
AAGATGTTCTTTGGATGTCAAGTCTCGACTAAGAAGTTTTTAACTCTATG12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)