FastQCFastQC Report
Fri 14 Jul 2023
HGWL2AFX5_n01_daplib_ColAmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGWL2AFX5_n01_daplib_ColAmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length76
%GC38

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCGTGGTCAACCAAAAGGGATGTAAGTTGACTTATGTATAAAATTTGTT13.3333333333333335No Hit
TTAGGCTTTCAAGATCGGTTTGCGGTTTAAGTTATTATACTCAATCATAC13.3333333333333335No Hit
CTTCCCCTGAATATACAACTCGATTTCGATGAACGTAGGGCTCCAGGGAT13.3333333333333335No Hit
AATTCTTAAAATGTTCAACATACTGGCCTGAATCATCTTTACCAGTGGCT13.3333333333333335No Hit
ATAAGATCGGGTTGAGGTTTAAGTTGTAATACTCACTCATACACATGACA13.3333333333333335No Hit
AGGCCGTGATCCTACTTGCTCGGCAGCATGGCCACCTGTGGAGTTTGCTG13.3333333333333335No Hit
GCTAGATCCTCCATTGTTGCCTCCCTTGGTTTCGTCCGTCATCTGATCGA13.3333333333333335No Hit
CCTGTTGGATAATTACTCTCTGTGCTTCTTCACCAAGTTTCAAGCAGTTG13.3333333333333335No Hit
TAAACCCCGGTATTTAATTAATACCTTACAAACTTACATTATTGATAAAG13.3333333333333335No Hit
CTATTATTATAAAGATTCTAAGAGAATGATGTTTATTGCAAGTCGGAAAA13.3333333333333335No Hit
TACGGGAACTAAATATCATATGCGAATTTGTCTGAAAAATAATCAGAAGA13.3333333333333335No Hit
AGGTTCGATTCAGAGACTCTACACGTTTTGTTTTTATGTTTCACTTGAAG13.3333333333333335No Hit
AGATCCTGTTTCCGACTATTTGGAGCTCATGGAGGTAATAATTTTCTCAC13.3333333333333335No Hit
CCACAGAGGCCATGCGATCCGACGAGTTATCATGAATCATCAGAGCAACG13.3333333333333335No Hit
AAGCAGACAAAACGAAAGAGGGACGGTTACATACAGTGGGAAAGAAGAGA13.3333333333333335No Hit
ATATAAAGTTAGCAAAAGATGTGATATAGTTTTTTTCTTACCACAGCTGG13.3333333333333335No Hit
TTTTTCATCTTCTGTGAATGGTTATTTAAATGAGCTATAAAGTATCGTGC13.3333333333333335No Hit
TGGGCGTTTCAACTAGCGAACGTTGGAATTGTGTTTTTGGCTATCGATCG13.3333333333333335No Hit
CCAAAACCCAGTTGAAATAAACACTGGTGTCAAACGGTTGCTTCGTCTAA13.3333333333333335No Hit
TAGAGAATCTTTATTTATTTTATTTTTCCAATTTTGGGTTACTAATCTAG13.3333333333333335No Hit
AATCCAAAGATTACGGAAACGATCTTCTGGGAATCATGTTAACAGCTGCA13.3333333333333335No Hit
TGATGATTGGATTAAGGCTATGAATGCAGAGTTGCAGGCTCTAGAAGGCA13.3333333333333335No Hit
AATGCACAGGATCCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGA13.3333333333333335No Hit
TTCCACTGTCTGTGGTCCTTTGAGTATATGCACAAAAGATACTCAAACTC13.3333333333333335No Hit
AAGCTTCTGTACCTAGGATCTTATATAAAGACTGTGTCGAACTGCTCATA13.3333333333333335No Hit
GAGGAGGCTTTTAAACATTATATTTAAACCCAAGGAGGACTTTTCATTTT13.3333333333333335No Hit
CATCACTGTATCTGTTTTTCTCAACATTGACACTGTTCATAGCCACTGTA13.3333333333333335No Hit
ACTCAACACACAAATGAATTTATTCTTAGAGATACATACGACAACCAGTC13.3333333333333335No Hit
TAAAGAGGACTCAGGCGAAGAAGCAACAAGAACCTCCAACAAAAACCAAG13.3333333333333335No Hit
TAGAACATACAAACCCAAAGACTCATATGGACTTAGGCTAAACCATGAAA13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)