FastQCFastQC Report
Fri 14 Jul 2023
HGWL2AFX5_n01_daplib_C24AmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGWL2AFX5_n01_daplib_C24AmpPoolHm-input_ac6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length76
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGTTTCTTCATCAACCACATTTCTTGCCTTCATAATCATCTTCTTACTT12.083333333333333No Hit
GGCAAGGCCACACATAGTTTCCTTTCTAACATGGCCTACATGCACACTGC12.083333333333333No Hit
CAAGGAAGCCACATAGATCAGCAGTACCTGCCACATAAATGATCACATAT12.083333333333333No Hit
AGGCTTACAAGATCTGGTTGCGGTTTAAGTTGTTATACTCAATCATACAC12.083333333333333No Hit
ACAATAGTCATTAAAACCTTGAGATGTGAATTCACCAGCATTATCAAGAT12.083333333333333No Hit
ATAGCAACGCTGAGAAATCCGACAACTTTAATCTAAAAGACAAATACAAT12.083333333333333No Hit
CTCACATCGATCATTTGAATTGACAATGGAAGTGCCCGTTCAGATTGTAT12.083333333333333No Hit
AATATGGGCTTTATATGACAGAAATGAGGGGGTCATTCACTATTCTGGTT12.083333333333333No Hit
CAATATTGGTGCGACATATGTGAGGCGAAATTAGAGATCGGAAGAGCGTC12.083333333333333No Hit
ACGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGTTTTCAGATAAACCGTTCTTTAATTCA12.083333333333333No Hit
TAGATTGCATGACAATGTAGCCGTACAACTGCAAAGTTTCCATTGTGACT12.083333333333333No Hit
TGTAAGACTGAGGAGAATCGAGCTATGGGCTGTGGTCTCCCTAGTGATGT12.083333333333333No Hit
CAAACAATTCCATCGAATTGAGTATGATTGTATGTGTGATAGCATCTACT12.083333333333333No Hit
CTTCCTTGCCATAGCGAGAGATGTATCGACGGACACTATAGAGTGAACTC12.083333333333333No Hit
GATGGATGAAGATAACGCAGTGGAGTTCGACACTAGCATGTATCACTTTG12.083333333333333No Hit
CCCTCGATCTGACATGTCTCTTGAAAAGAGTAACATGAAGCTCAGAGATA12.083333333333333No Hit
AGACAGAGACGGAGATGGAGACGGAGACGAAGAAGAATCGTTGACAGAGG12.083333333333333No Hit
GCGTCTGAGAGGATGTGGCGGGGAATTGCCGTGATCGATGAATGCTACCT12.083333333333333No Hit
AGTTTCCTCATCCCAATTCCAAACGAGACACAAACATCTTGAGCACTCCA12.083333333333333No Hit
GGCTGTGACTTATACCAACGTGAGTGAATTGACCAAAAGGGTCGTGAATG12.083333333333333No Hit
GTCTTTGATTGGCATGGAAACTTCTGGTATTCATGAGACGACTTACAATT12.083333333333333No Hit
ACTTGTGTAGAATTGGGGATTGTTTTTTTTGGAGTGATTTAGGGGAGGGT12.083333333333333No Hit
GGACAAGCCGACCAATGCACACCAAAGGCGGACCGGCCGACCCATCCCAA12.083333333333333No Hit
ACCATCACTTCCACTAGAACTTCCAATGCTGGCATTAACATCAACATCAA12.083333333333333No Hit
GCTAAATATCAAGTTAAAGACATCCAAAAGATTTTGCAGTTCATATACAA12.083333333333333No Hit
TGTCTTATGTATTTGCAGCCTGGCTTAGCTGGGATAAACCTCGGAAAATT12.083333333333333No Hit
AAAAAAATCGATGATAATTTTTAGATCTCTCGTTCTCATCTTTTTTTGTT12.083333333333333No Hit
ACCGCACTATGAGATTTCGTTATCATTCGAAACCTAAGTTTAATTGATAT12.083333333333333No Hit
GAGGTTATAAATGTGAACAGCAAGGAGAAGTGCATTATCAAAATCCTCAA12.083333333333333No Hit
CCATTTTGGGCGGAACCGATCTACTTATTATTTGATTCCAGTTAGTATTA12.083333333333333No Hit
TACTTGGCTCAGTCGGATGGCAATTACAACGAGGATTATGACAGAAAGAT12.083333333333333No Hit
CTCCAAAACACTAACCAACCTTCTTCTTGCTTCTCAAAGCTTTCATGGTT12.083333333333333No Hit
GAATTCAAGGATTTTGATGAAAGCTTCACAAGCCGTGCTTGAGAAGCAGC12.083333333333333No Hit
GTTCAATCTTGGTTTTGGTTAGAAAATGGATCGATTTGGTACGGTTTATG12.083333333333333No Hit
ACACTAACCAACCTTCTTCTTGCTTCTCAAAGCTTTCATGGTGTAGCCAA12.083333333333333No Hit
ATCTCCACCCTGGGATTCTAGCTGCCTCACCAACTGTGAAAGAAACATTA12.083333333333333No Hit
TTGTTGGTAGAGAAATCGCCGGCTGAAATGGCAGATTCGCCGGCGACCGA12.083333333333333No Hit
AGGATTAGAAAGGGAACAAGTTACTTACGATTTCTCTCCCTCTTCAAATG12.083333333333333No Hit
TGTAGTGGAGATCAAGCGGTGGTTGCTCTAAGCAGCACACATCATGAATC12.083333333333333No Hit
AAGCCTAAGTAGTGTTTCCTTGTTAGAACATAAAAAGCCAGACTCATAAG12.083333333333333No Hit
AGAGTATTTATCTTCTTGATGTAACTGTAACTATGAATTGAGGATCCAAA12.083333333333333No Hit
ACAGTGATGCCACGGCAAGAAGAAGAAAACAATGGGATGGAGGACGCGAC12.083333333333333No Hit
ACTCAGCATAATCCTCAAAGAACAACTGCTCCGCTGCAGCTTCGCACGAA12.083333333333333No Hit
AGAGTATAAGAAAATAAAACGAAAGGAAAGTAAGCAAATAGCATGGTGGT12.083333333333333No Hit
GGCAGTTACTGTGTATCACTCCTTGAATCTAGCTGCACATCAAAGGTAGA12.083333333333333No Hit
CTTAAACCGCAAACGAATCTTAAAGGCGTAAGAATTGTATCCTTGTTAGA12.083333333333333No Hit
TATCTTTGACAATGGGCTAACTCTACTATCGCAGGTACCGATGCTAAGGA12.083333333333333No Hit
AGAGGATAATCGGATCGTGAGACAGAGAACTAAGATGCAGCATGAACAGA12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)