FastQCFastQC Report
Mon 10 May 2021
HGJM2BGXJ_n02_ReSeq_Sp20_Neg_rep1.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGJM2BGXJ_n02_ReSeq_Sp20_Neg_rep1.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCACCAACCCACTAATCAGACATGAGAACAGAATGGTACTAGCCAGCACT11.0416666666666665No Hit
TGCCGGGAGCGGCCCCGAGGGGCCCTGTGGGGTCCGGCCCGGCCCGTCCG11.0416666666666665No Hit
AACTGAGCTAACAAGGCTCCTCACTTGTGTTAGGAACACACTTCAGAAGC11.0416666666666665No Hit
GTTTTCTTGGGAACAGGCTCGTTTAATAGGGTGCTCTAATAATGGACTTA11.0416666666666665No Hit
ATTTCACACAGTGTCTTATTTAACAGTGCGCCCTTTTAAAGGTCCACTGG11.0416666666666665No Hit
ATTCTGTATCCTCTGCAAAATCAGAAGAATTTTAAAGGCAAGGAATAAAG11.0416666666666665No Hit
ATCTATGATGAACATAAACATAAAAATCCTCACCCAAATATCTGCAAACC11.0416666666666665No Hit
GTCCAGAGAAGCACAGTAGTGCAGTGGGTGGGGGGAGGGGTAGGAGATTT11.0416666666666665No Hit
AATAGGTCTGGCTGTGTTGGGCATGTCTGCATAACCGAGAAGCAGCTCCC11.0416666666666665No Hit
AAGCTCAACTCTGAGCTAAGACACAGTAAAGGAGCATCACTCTGGCATTG11.0416666666666665No Hit
GTGCTTTATCTTTCCCTTTATCTACCAGTTTGCAGAATAATGAGCTGGTT11.0416666666666665No Hit
ATAAATAGCACTATGAATATGTTGAATCACGTATGTTCTAAATAGCGGAA11.0416666666666665No Hit
GTCTTAGGAAGGTGGGAGCAATCCCCAGCATCAGATGCTGCTTCAAAGGC11.0416666666666665No Hit
GTGGTGGGGCCTCCTGGCACCTTTCCCGGGATTTCATGTAAGCCGTAGTG11.0416666666666665No Hit
TTGGAGAAGTTCAGCTTTGGTTCATAGTTTAACAACCTGCTGAGTCTGTC11.0416666666666665No Hit
GTCTGGGTATTTTGTTACAGTAGTCCAAACAGAGAAAGACAATGCCAAAT11.0416666666666665No Hit
TCTCAGAGCCCAGGAAAGCCTTAAGTTTAATGACCTTTCATCAATCCATA11.0416666666666665No Hit
AACCCATACATGTTTTAGTTCAGAGGGCAGGGATGATCCCCACTGCTAAA11.0416666666666665No Hit
CTCATTATCTTACTTCTTATTTTTTCTGATTATTAATTAACTTTAGTTTT11.0416666666666665No Hit
CCAGCCGGCTGAGGTGTATTCCTGCAGGCCACGTCGTGACGTACATCAAA11.0416666666666665No Hit
ACCCAAGCATCAGGCAATATGGCTGTATTGGGTACAACGGAGCTCATGTA11.0416666666666665No Hit
ACTTTACCGATAGTCACGGCAGATTCGTCGATAGAGGCATATAATTCTGG11.0416666666666665No Hit
AATCAATCCAGGTAAGATTTTAAGACCTCAAACTACAGTCACATTTCTAG11.0416666666666665No Hit
CAGCGGGACCAGGGACCAGAACGTCTTCGAGCCAGGCTTTGACGAATGAA11.0416666666666665No Hit
CTGTGAGACCTTGGACAAGTCAGGTCCCTGCTCTAAACCTCAGGTCGCTC11.0416666666666665No Hit
GGGTCAGGGAGAACTCATCTCGGGGCAAGTTTCGTGCTTAGATGCTTTCA11.0416666666666665No Hit
AATTAGGTGCACATGTGTCTAAAACCACATCAACTCTACATTCTCACATA11.0416666666666665No Hit
GGTCTGAAATCAAATCAACCATCTTTTCCAACCACAGTGGTATAGAACTA11.0416666666666665No Hit
ATCACTGCTTTTGCAAATTTCACATCTTTGATAGTGGTGGTGGTAATGAC11.0416666666666665No Hit
AACATATGGCAGAAAATTGCACCGTGACAGCTAATGAGCCAATAGTATGG11.0416666666666665No Hit
GTAGGGACCGGCCACAGTGCTTTTCCACAGGAGCTGGCCCATTGAACATC11.0416666666666665No Hit
GTACATGAGGTTTAGGAAGGAAGTTATTTTGAGGAATGGAAAAATGAATC11.0416666666666665No Hit
AATGAATGACTGAATAAAAGTGGATATAATCATGTAGCCACAGACATTCT11.0416666666666665No Hit
AAGTGGTGATCTGATGCACATGGATCTGGTCTCACCCCAATCCCAATGTG11.0416666666666665No Hit
GATATTCCCTGAAACCATTGATAAGCAAAGGCTCTTAAGAAAGTACAATG11.0416666666666665No Hit
CCCCAGGATCATGACCTGAGCCAAAGGCAGACACTTAATGACAGAGCCGC11.0416666666666665No Hit
CCCGGAGTGTGAGGTTCCTTCTGCCCGGGGTGTGGGGCCTCCCGGTGGGG11.0416666666666665No Hit
CATGTCCACCCGCGGCCGGACCCGGCTGGGGCGGGAGCCCACGGAGGGGC11.0416666666666665No Hit
GGGCTTAGGTGGCCAAAGAATCTTGTGTAAGATCACACAGCATGCCAAGA11.0416666666666665No Hit
GTCAAGAACTGATCACACAAAGGACTCAGGTGGAGCGGTGGTGATCAGCG11.0416666666666665No Hit
GGACTAAAGGGAGGTGGTCATGGGGAGTTACAGAATTTCAGTTTTGCAAG11.0416666666666665No Hit
GTGAAGTACGAGAGGGTTATCAGGCTGGTTGAGGGTTAGAAAGATACACA11.0416666666666665No Hit
GACCAGTCCGTCGTCTTTGTGAGATGAAATCTTTCTTTTGCCATTGTTTA11.0416666666666665No Hit
CTCTTTCTGTCTCTACAATAAATACATATGTCTTTAAAAATCTTATCCTG11.0416666666666665No Hit
GGTCAAGATAAAAGATTCAGGGTGGTCAGCTCCGCGGGCGGCGTAGGGCT11.0416666666666665No Hit
TCATTAGGCTTCTCTCTCTCTCTAAATGTGGCCGTCCCGGTCTTTAGACA11.0416666666666665No Hit
CTTTTAAGCAATGACCTTTAAAAAAACACTATTTCTGAATTCTTTAAATG11.0416666666666665No Hit
CTTTAATCTCATCATGACTGAGGTAAAAATGAGACCCCAAGATTGAGGCA11.0416666666666665No Hit
GCCTTAGTCAATCTTGGATCATTATTATGATATTGAGTCATTTTGGTCAG11.0416666666666665No Hit
GTATTACCAACGCAATTGATAGTAGCCTCAATGTGACCTATTTGCAGCCT11.0416666666666665No Hit
GAGTTCGCACGGGGTTTAAGGGGAAGGAGTGGGGACAGTCCCCAAAAGCT11.0416666666666665No Hit
ATATATACTGTTTACTGACCTATTCTATCAGATGTGGCTGTAGGTCATTT11.0416666666666665No Hit
CTAGCAGCCTTTCTTCTGCACCTTCCTTACCTCTCTCAGCCTTCACAGAA11.0416666666666665No Hit
GGCCCCTGAGGCGCGAGGCTGTCTGAAGCAGTAAGGGATAGACAGGAGTC11.0416666666666665No Hit
TTGCATAACCTTCATCTCTTGAGGAGTGAATTGGTTTAACCTTGCCTGAT11.0416666666666665No Hit
GAGCTGAAGTGTAAAATGAAAACGGAAAAACAATACACTTCCATAGTCCA11.0416666666666665No Hit
CCCCACTTACAGCGTGAGAAAATCATCCTGTTCCTAGAAGAGGGATGTTA11.0416666666666665No Hit
CGCCAGTCCCACCAGCCAATGTGCACTGAACAAACACTGCAACTGAACGT11.0416666666666665No Hit
GTGCAGCACGGACACCCAGCCGAACACTGCGCGCTCACCCCGCAGAGGAG11.0416666666666665No Hit
ATCATGACCTGAGCTGAAGGCAGAGGCTTAACCCACTGAACCACCCAGGT11.0416666666666665No Hit
TAACGACAAAGCCACCCAGGCGCTTTATATATTTTTAAGTCGCGTGCTTG11.0416666666666665No Hit
GGTCATAGTGATCCGGTGGTTCTGAATGGAAGGGCCGTCGCTCACCGGAT11.0416666666666665No Hit
ACATTACACAATAAGTGATGTTTTATATTATCCATCCTGTTACTATTCTA11.0416666666666665No Hit
GATCTCATAATCGAATTTATGGATTAGTATTATCCAACTTTTATATATAT11.0416666666666665No Hit
CCTCTAGTGGATAGTTGTCATCTTGGGATCACTATAGTTCCTCTAATGAA11.0416666666666665No Hit
AACTTGCGCACACGCTTATCCGTGCATAATCTCCCAGGATGAGGAAGCAT11.0416666666666665No Hit
ATGCAAAGATGCATGGCTTGTCATCGTATTTGAGGCGATGCAAAGATGCA11.0416666666666665No Hit
GTTTATCCCTGTAGCAGAGTGAGCTGCTGAGGGTTAAAGAGGTAGATAGG11.0416666666666665No Hit
TTGCTGGTATATCCTTGAAAATAAAATTCTCAATAATACTTCAGTAATTA11.0416666666666665No Hit
AGTGAGACCAGCAGTTGCGTCTTCTCCATTGTTAGCTTGACGCCAAATTC11.0416666666666665No Hit
GAGTTAAGTGGTAGAGTATCAAACGTCTGGATTTCCGCCAGGGGGGGGCG11.0416666666666665No Hit
ACCCGAGAACATGCCCAGGGCTGAAGTCAGCTGCTTAACTGACTCAGCCC11.0416666666666665No Hit
TGCTGCCAGGATCCCGTGGCCGACACACCCACCCGTGGTCCTCCGAATAC11.0416666666666665No Hit
CAGCTGAGACGTGTTGAATGCACGCACCATGTTTTTGCACGTGCGTGTCT11.0416666666666665No Hit
TCTCTACACAGCAGCTTTAAAAATACAGAGTGCTAAGGTTGGCACAGGGG11.0416666666666665No Hit
CCTACAATATTGGTCCTTCTGTGTCTAGCTTATTTCCCTTAGCATAATGT11.0416666666666665No Hit
CTGCATACCTCCCCTGTAAAGCTCAAGGCAGGTGTTTTAGCCCCTGCCTG11.0416666666666665No Hit
GAACAGACTAATGACCAGTAGAGAGATTAAATAAGAAATCAAAAACTTCC11.0416666666666665No Hit
GAATTAAGGGAAAAGCTCAAGTTTCAATTCAGCAATCAGGTTTCAGAAAA11.0416666666666665No Hit
GTTGTATATGAGACCCATGCAACTGGCAAGCGCACCAGTTGAGTAACTGA11.0416666666666665No Hit
GGATTAGAGATTCCCTAAAAGAAATCTTCGAATTTAACAAGGTAAAATCT11.0416666666666665No Hit
GTAGCATGATGATGAGTCTCGGTCTTTATGAATTTCCAGTTTTAGTCATG11.0416666666666665No Hit
GATATATGCAGTGGCAATTACCAACTCACTTACGGAACAGCTGGCAAAGC11.0416666666666665No Hit
GTCCTCCTCTGCATCATACGTGCTGCATCCCACAAGTCAGCAAAAACAAC11.0416666666666665No Hit
CTGCAGGATTGCTAGAAGAAAGAACTTGTATACAATTCCTCTGAGACCTG11.0416666666666665No Hit
AATTTAGTCCTACCACAGACACCAGCAAAATTTAGGATGAACTGTCAGTA11.0416666666666665No Hit
GGTGAGGGAGAAGCATTGGGAGAAGCATGCTCCCGATACGGACCTCCCTC11.0416666666666665No Hit
GGGTGCTATGAGTATCGGTATAGGACTTACACGCAATCCTGCTTCAGAGT11.0416666666666665No Hit
ATATTTCGCTGTTACATATAACGTTGTATCAGCGACACTTTTCCCATAAG11.0416666666666665No Hit
ATGTGGGGCTGGATCCCAGGGCGCTGGGATCATGACCTGAGCCAAAGGCA11.0416666666666665No Hit
ACTGTGTTCTGGGCACTGTGGATTTCAAAATCCAGTCCCCTCAAGGAGCT11.0416666666666665No Hit
CATCAGGAACCATTATTTAGGGTGAGGTCAGAGGGCCTCACAGCCCGGGC11.0416666666666665No Hit
TGGATAAGCAGGTTGATTTGATTTCAGTCCTCATTTTTGAAAAATCTAGG11.0416666666666665No Hit
ATTCCAGTCCGCACGAGGGCTCTTGTTCTCTGGTATGTGGCTTCATTTAG11.0416666666666665No Hit
GTATTAGCGTGTTCCATCCTACTTCTCCATGAAATTAACGAGCCAACCAA11.0416666666666665No Hit
GGGTCGAAAGGTCAAGGAGCAACACACGTCTGAAGTCCAGACGCGCCAAT11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)