FastQCFastQC Report
Mon 10 May 2021
HGJM2BGXJ_n01_ReSeq_Sp20_Neg_rep1.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHGJM2BGXJ_n01_ReSeq_Sp20_Neg_rep1.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTGTGTAAGTGGCAGCTGGTACATTTAGTGAGTATTGGAGGTGCATGAG11.0416666666666665No Hit
GCGAGACCCCGCATTTTCGGCATGTTTAATTGGGGTTGGTATGGATACGG11.0416666666666665No Hit
GGCTCTATGACAAGCCCGGCACACTCAGAGAGGGGCTCCGAGGCCAAATC11.0416666666666665No Hit
GCATTTAGCTACCGGGCAGTGCCATTGGCATGACAACCCGAACACCAGTG11.0416666666666665No Hit
ATGCTAGCGGGAGGAATGGGATGATACAGGGAAAATGAAACTCTTCCTTC11.0416666666666665No Hit
CTCCCAAAGAAAGTTCATACCCACTAAGAAGTCACTCACCATTACCCTTC11.0416666666666665No Hit
CTCTAGGATATACTCCCTTCCTACAGTTTCAGCCTTTTCTGTCTTCAACC11.0416666666666665No Hit
GACAAAGCAAGCTTAAATATAACAACAAAAAATAATGAAAAAAAGAGAAT11.0416666666666665No Hit
GTATTGGCAGTAGTAATAACCTTGTTTTCCTTCATTATTTCCCTGAATTT11.0416666666666665No Hit
GATCTTGAGGCTCTCATGGAATGGCTAAAGACAAGACCAATCCTGTCACC11.0416666666666665No Hit
ACTCTTCCCTCATAGCCTCAGGCACTCCTTCCGTAGAAGGCCCTCTTTTC11.0416666666666665No Hit
GTAAAATGAGGCAAGGATTAAAAATATTTACTGCCCCAGCATGGAGGAAC11.0416666666666665No Hit
TAAGAGAGGCTAAGTAAGTTTCTCTAAGGACACAGAGTTGATTAAGTGTC11.0416666666666665No Hit
AAGCTATGTGTCCCGCTTTCCTTCCATAATCCCATCAGTTAGTTAGTGTT11.0416666666666665No Hit
GATAACATGCACTGATCAAAAATTAAAAAGCAAAAAAACCCTACCAGACC11.0416666666666665No Hit
GCACAGGCTGAAACCGGGAGGATATTACATATAACAAATGACTTACGACA11.0416666666666665No Hit
GGTCATGATGGTGTGGCAACTGTAGCTTGGCCAGGCGCTCCTCCGTGAAG11.0416666666666665No Hit
CAAGAGAGCCAGCTGTGCAGACATCAGGGTGAACGTGCTCTGAGCAGGGG11.0416666666666665No Hit
TTCTTGGAGGGTCTCTAAAGAAGAGAGTGAGAAGATCCTCTCTCTGGGGT11.0416666666666665No Hit
GTGCTAGGAAGAGCAGACAGTGGTAAAGAGAAAGGATAGAATGAGGTTGC11.0416666666666665No Hit
TGCTTGCACCCCTGAGCTGCTTTCTCTCTCCCTGGGGAGAAGGTGAAGAT11.0416666666666665No Hit
ACATAAACTATACTGAGATACTGGTTTTCACTCCTTACACGACAGATGAT11.0416666666666665No Hit
CTAAATCAAGAGCTATAAATGACTAAGCTTGGTGAGGAAAACATGTGGAA11.0416666666666665No Hit
GGACCTCGGATGCCAGGCTTCTGCCCTTGTAAAATACCCCCAGCACGGCC11.0416666666666665No Hit
GGCCCTGCCTGCGGTCTGATGAGCTGGTCGCCGCGGGAGGTCTACTGTAC11.0416666666666665No Hit
GAGAACAGGACTTGCTGTTTAGAAGTACTGACTAAACAGCAAAAGTTGTG11.0416666666666665No Hit
GGGTTATATGGCAACAGATAACACCGCAGCACTACGCGCAGATGACGTGC11.0416666666666665No Hit
GTCCATGACCTCAAAAAAGATCAAATGAACAACTGCATTATTTTGACCCA11.0416666666666665No Hit
GTTAGTCTCTGAGATATTTGTTATTTATCTTATACTTCTCAGCACACTGA11.0416666666666665No Hit
GCTCTGGAAGGGGAAGCTCACCGGGTGCTGTTTGGGTTTGTGCCCGAGAC11.0416666666666665No Hit
GATGGAAACTGGTGGAGAACGCCAGAATGCCACTGAGATCAGGGCATCTG11.0416666666666665No Hit
GTATAACAATAGAGAGAATGGTTCTCTCCGCATTTGATGAAAGGAGGAAC11.0416666666666665No Hit
GTTGGATTCGAACAACAGACCACTATCGACCAGGCTGAAGAGCTAGGACA11.0416666666666665No Hit
CAGTCAAACACTTAAAGAAAAATAGTATCACAAAAAATTTTTAAAACGGG11.0416666666666665No Hit
GCGCCAAAGCAGGGCAGAAGGTCAACACGGCTAACACTGCGAAGCAAAAG11.0416666666666665No Hit
GAGCAAAAGCAGGAGCAGAGGGAGAAGGAGAAGCAGGCTTTCCACTGAGC11.0416666666666665No Hit
ACATAATAGAGCCTGTATGATCCAAATACTCACATTTACTTTCCCAGTTA11.0416666666666665No Hit
GAATTATACAAAAAGAAAAGGAGAGACATTGAACAATAACTCAGAGAGGA11.0416666666666665No Hit
TTCCTATACTGAAATGCAAGAGAGTAAGAGTACCTGCCATGTAGAGGTTT11.0416666666666665No Hit
CTTGAAGGGTGGATTTCAAATCATTTTTAACAACACGGCACTTCTTTCAA11.0416666666666665No Hit
TGCATGTCATCTGGACTTAGCAGCTTACAAGCAGCTCCTCTGTCTTCAGA11.0416666666666665No Hit
CAGTTTATACACCTGTAAATGGCACAGTGTTTGCTGCTGTCTGAAGGCAT11.0416666666666665No Hit
ATATGGAAGCCGGAAGAATTCTTTCAGCGTTTCTGAAGAGAAACAGTGGA11.0416666666666665No Hit
TAATGGAACTAATTCGGATGATAAAGCGAGGCATTAATGACCGGAACTTC11.0416666666666665No Hit
TTCTACATCTGTTGACATGGTCCTATGATGTTGATCCTTCGTTTTGTGAA11.0416666666666665No Hit
CAGGGCTCTGACCAAGTTGAGTGCCTGAGCTTGAATAGCGTAAAGAAGGT11.0416666666666665No Hit
CTGGTCTCAAGCAAGCAGCAGCAGCCCGCAGAACATTTCTCTACGAATGC11.0416666666666665No Hit
GACCTTATTAATACCTGTATTCCTGTTGAATTTAGAAATGACCCGCGATT11.0416666666666665No Hit
GGCTCTGTAATGTAATAACAGTAAAGAGGGGCAGGAAATTAATTTTAAGA11.0416666666666665No Hit
TCCATAGCGTGTTCGCCATATTTTTCACGTCTGTCTATGGCAAACGTAGA11.0416666666666665No Hit
CAACACACCTGCCGGAGAACCCCTCGATTCCTATGCACTTTGCGGACGGT11.0416666666666665No Hit
GTTGAAGTGCACTTCATTGGCTCTTGTTACAGTGTTTGGATTTTTTTTCT11.0416666666666665No Hit
CAAGAAAGGGGGAACAGTAGGGAAAGAGAGGGAGAAGCAGAGCTCTCCCG11.0416666666666665No Hit
CACTCAGGATTACTCAGAAAGCAGCAGCCCCTGCACAACAGGCAGGCCTG11.0416666666666665No Hit
GTGTCAAATATTTAATTCTAACTTTTTTTCAAAGTAGATGATCAAGGACA11.0416666666666665No Hit
ACATTAGACGTTTGGTCCTGTTGGTTCTACGGGCTCTTGAGTGGAGTTTT11.0416666666666665No Hit
ATTATGACCTGAGCTGAAAGTAAGAGTCAATTGCATAAGCAACCCATTGC11.0416666666666665No Hit
GTATCTCTGGTTGGTGTATATTAAGTTGATTTGGGAGCAGTGATCATAAT11.0416666666666665No Hit
TCTTAATATTATCCCCACATGTAGAATGTGCTATTACCAATATCCAAACA11.0416666666666665No Hit
CATCACAGATACTTGGGATGTCTCGATAAGGGCCGTGCTGGCCTCATAAA11.0416666666666665No Hit
ATACTTATATAGCATTAAAAAATAATAACACTCCTAAGAATCTATGTATA11.0416666666666665No Hit
AAAATGAACCACAAGCAAGTCACAGGAGGAAAATTTTGTCCAGGGCATCC11.0416666666666665No Hit
TTTATGCCCTGCACTCCCCTCCGGAAGCAACCACTATATTGTTGTTCTTT11.0416666666666665No Hit
GTCTAAGGCCAGCTGAGCTCCATACTCTAATAATGAGACTGATGTAAGCT11.0416666666666665No Hit
ACCCAGCATCGAGCAACTAAATATGTAGAGCATAAATGAACAAAAATAAC11.0416666666666665No Hit
GTCTTCTTATTTAGGACACTAATCCTATCAGGGCTCCACCCTCGGGACCT11.0416666666666665No Hit
GAACAGCTCTCCCTTGGTCCCAGAATCAAAGTTAGAGGCCACCTTGCAGA11.0416666666666665No Hit
CAGCAGTCTGACAGGACTTATAGGAATAATTGCGCCCTCCTCTTGGTCTC11.0416666666666665No Hit
CTTAACCTGCTGAGCCACCCAGGTGCCCCAAAAACAAATTTCTTAAAAGC11.0416666666666665No Hit
TCCTACATACCACACAAGCAGCAACAGTTGTCAGAGTGCAGTCCAAGACC11.0416666666666665No Hit
GCTAGGGCTCGACTTCTTTTATATATGTGAATTTAAGTCCAGAAGTACAC11.0416666666666665No Hit
CCCTGTGATCATCCCCAGCAGCAGACTTCAAAGGAGCGCTTGTGAGGTGA11.0416666666666665No Hit
ATACAGCAGCTGATGAAAACACAAGTCTGCTCCTGTGGGGGCAGTCTCAT11.0416666666666665No Hit
GTTCCGGTGTCAGATTGCGTTCTCCCCAGAACTAGATCTAGGACTCCGTG11.0416666666666665No Hit
CCCACAAAACATATCCTCCACAGGTGGCAGACGTGCCCCTGAACACCGCC11.0416666666666665No Hit
GAGAGAGAGAGGAGGAAGCAGGCTCTCCGCTGAGCAAAGAGCCCGATGCG11.0416666666666665No Hit
CCACCTGCCCGCCTCCGGGCTCATGTTATCTCGCACTCTCTCCCAAATCA11.0416666666666665No Hit
GGCCGAGGGACAGGAGTCTCGGTTCCGCAGGGACCCGCTTCTGCATCACC11.0416666666666665No Hit
AATGATGTCTGTGCCAGCAGCTGTAAGCTTACTGAGAATACAGCAAATGT11.0416666666666665No Hit
GTTATTACTAATGCCAATACTTGAAACATTTTGTTTTATCTTCTTTCAGT11.0416666666666665No Hit
TCAGCAGGGAGCCTGTTTCTCTCTCTTCTCTGGCTGCTACTCTGCCTGCT11.0416666666666665No Hit
GGCTCCCTGTTGAGCAGGAGCTGGATGCGGGGCTTGATCCCAGGACCCCA11.0416666666666665No Hit
GTGCTGGCCTCATAAAATGAGGTGGGGAGCGTTTCTTCCTCTTGTGTGTC11.0416666666666665No Hit
GTGCCTGGGTGGCTCAGTGGGTTGAAGCCTCTGTCTTCGGCTTGGGTCAT11.0416666666666665No Hit
GCAGAATACACAAATGAAAATATTCTGGAGGCATTTTGAAATGTAGGACT11.0416666666666665No Hit
TGTCAGCACAGTTAAATTTATACTTCCTATGATTCATAAATCAGTTGACT11.0416666666666665No Hit
CATTCAGACTGTAAATCTACTTTGCTATGGGGAAAGAAAATCTTTAAAAC11.0416666666666665No Hit
GTCGGATAAAAGTCTGGATTTAGTAGAACCATGTACAAGAAGTTCTGTCG11.0416666666666665No Hit
GTCTAAGCATTCTTCAAAGCCATGATCTAAAAAGTTTCTGTGCCATCGAT11.0416666666666665No Hit
GCACATTCTACATGTGGGGATAATATTAAGACGTATAGATCAAATAACTA11.0416666666666665No Hit
TATCTGCCGTGGGCGCTGGAGAACTGAGGGGGGCTGCTCCTAGTACGAGA11.0416666666666665No Hit
GCAAAAGCAGGGATTCCAACAGACATCGTCCACTAATGTTCATTGCCACA11.0416666666666665No Hit
GCAAAAGCAGGGGCAACTCTGAGAGGGAGTGTTAAACCATGGGGGTTAAT11.0416666666666665No Hit
TACCAGGAGTGAAGAACGACCAAGATCATAATTCATGAAGAGAATACAAG11.0416666666666665No Hit
TCTAAAGTCAACAAAACCTAATATTACAATATACATAGAACTCCTGAAAA11.0416666666666665No Hit
CACTTACAGCGTGAGAAAATCATCCTGTTCCTAGAAGAGGGATGTTAGGA11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)