FastQCFastQC Report
Sun 19 Jun 2022
HG57LDRX2_n02_br84.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHG57LDRX2_n02_br84.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTTCAGCTGTGTGCAACTTCTTCGCTCAAGGGCTCTGTGTGACCGGTGAG13.3333333333333335No Hit
ACTGAGCAGACCGTCGTGGAAGCCCTGGCGCCTCATCGCCACTCCCCTCG13.3333333333333335No Hit
CTCATAGGCAGACCGGCGGTACTCAGAGTAAGCGCGAGCCCGGGGGAACC13.3333333333333335No Hit
GGAGTCTGCATAGGGAAAGGCAGTGCTGCTGAGTCAGTAGTACATTGCAG13.3333333333333335No Hit
GGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAGCAGTGTTCCTCAT13.3333333333333335No Hit
CGCCGGGGCACCGCGTCGGGCGCGCGCGGGAGCTAGCAGGTGTCCTGGGC13.3333333333333335No Hit
GGGCCAGGCTGTCCCAGCAGCCTCTGGGTGGGTCCCTCACTGCATACTCG13.3333333333333335No Hit
CTCCCAAGTAGAGAGAAAGTCGCCCATAGTGGGTGTGCCTGTACATTTTG13.3333333333333335No Hit
AGCGGTGAGCGCGGAGGTGTCTTTGGAGCACCCTAGGACCGTGCAGTAGA13.3333333333333335No Hit
GCTCCTCTCTCCGCTGTCCGGGCGCGTCTGTGAGGCGCGGATCCTGGGCG13.3333333333333335No Hit
GCATGGTAATCAGGAATAGTGTAAGATATTTAATGAATCGATTGATGTTT13.3333333333333335No Hit
CCCCCACGCCATGCGGCTGCCAAGGCAGAGCCCCTACGAGATCCTCCTCC13.3333333333333335No Hit
ACGGCGGGCGGCGGGGGGGGGGCAAGGTTTGGCGGGTGGTGTGGGCGGGG13.3333333333333335No Hit
CCTCACAGGATGCAGGGATGCAGGACCCTGACCTCACAGGATGCCCTGGC13.3333333333333335No Hit
CCCGCGACGTCCTCCCATGCCCACATGCCCTCCTCCCGCGGGCCCGAGGC13.3333333333333335No Hit
GTAGGGCTCTAGACGACCCTGGCAGATGCGCGCATAACTGATTGGAAGAG13.3333333333333335No Hit
GAGCTGGGCCGCCGGCTCGCACGGCTCGCCCTGCTCGCACAGCCCGCCAC13.3333333333333335No Hit
CACACATAGAGCACTGAGATATTCACACACATACAGTTGTGCATTTATGG13.3333333333333335No Hit
AATAAATACTATCACAATAAAAGAACTATGACGATTTAATAGTTAAAAGA13.3333333333333335No Hit
TCCTATGGCCACACCTGTGCACTGGCTTTTCCTATTAACTTGAGTGATGC13.3333333333333335No Hit
CAGCTGGCGGTTGGGGGGTGTGGGCGGCGCCCGCCCTCGGCTGGGGCGTT13.3333333333333335No Hit
ACCTTGGACCAATTAACCGGTAGCTTTACACTTTCAGAGGGGAGAGGGGG13.3333333333333335No Hit
GTCCTAGCTAGACGTTGTTCTGGAGTAACACTGGAAGCGAATGTGAGGGA13.3333333333333335No Hit
CTTCTGTGCTGCAGGATCCGGATCATCCACATGTTCCCGCAGCTTGGCGA13.3333333333333335No Hit
GGGTGAGGTCTCCCTTGTATCGCGACTGCCGAACCTCCACCTGGTATCCT13.3333333333333335No Hit
GGTTAGGCACCTAATACTTAGGGAGGTTGTCACTCAACGACAATCATTCA13.3333333333333335No Hit
GACGGGGTGGCCTCCGGCCTCCGAGTCCGGTGCGGGAAGACCACTGCGTG13.3333333333333335No Hit
GCCGCTGCCCCGTCATGGCCTCGGGCCCCGCACAGCGCGGGGCGTTCTGT13.3333333333333335No Hit
GGTCGAGATAGCAAATAACCTCGCCGTTTGAGGAAATGGGGAGTCCTTCT13.3333333333333335No Hit
GCCTACACCGGCTTGTGGGACAGAGCTAGCTCGTGTTCATCTGCTTCCCT13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)