FastQCFastQC Report
Sun 19 Jun 2022
HG57LDRX2_n02_br81.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHG57LDRX2_n02_br81.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC69

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCCAGCCCGGCTCCCTTCCCCGGCCTCTGGTGCTCTCTGAAACGGAGCC14.166666666666666No Hit
GGGGTGGGGGGGCGGCTGGGAGGGTGGGGGGGCGGGGGTGCTGGGCGGGG14.166666666666666No Hit
TCTCGAGGGAGGAGGGGCGGGGTCCCGGCGGGCGGAGATCGAGGAACCCC14.166666666666666No Hit
GCCCCGGTGCGTTCGCCGCCGACTTGAGGATGGGGAGGCGGGCTGGGCTC14.166666666666666No Hit
GACCGTGGCCACGGTGTTGCGCCTCAGCTGCTGAGGGGGCTGCGGCTGCG14.166666666666666No Hit
GAGCTCGTCTCCGAGCCCAGTCCCTGTGCCGGGGGTTCAAAGCACAGAGT14.166666666666666No Hit
CTGTAAGCCAGTCCCACTTAACTGTTGTCCTAAGAGTTGTCTTGGTCATG14.166666666666666No Hit
CATGAAGCCTGGGGGTGGGGGTGGAGGTTGGGGTGGAGGGGGCGGTGTTA14.166666666666666No Hit
GGCCGGGTCGTGGAGGGCGGTCGCGCGGGTGGGGTGGGGGCCGGGGGGGT14.166666666666666No Hit
GCCTTTGACAGCCGAGTGGTGCGGGGCGTGTTAAAGGGTGGGGAGGGGGG14.166666666666666No Hit
GGGCGGGGCGGGCGGCGGGGGGCGGGCCCCCGGGGTGGGGGAGCGTTGTT14.166666666666666No Hit
GGAGTAAAGAGGAGGCGGCGGCCTGGTCTGGGAGCAACAGATCCGGGCGA14.166666666666666No Hit
ATCCTGAGCCATCCGCCTAGCCCTGGGCACCCAAAGAGTGCCCAAATCTC14.166666666666666No Hit
GCTCTGCCCCAGACCTGCCGGCGAAGGGGTAAGGGCACCTCTGCTTTGGG14.166666666666666No Hit
GGCCTATATCCTAACTCGTAGGTCAGTCAGGAGGCCGGTCATAAGGACCA14.166666666666666No Hit
AGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGCGGCGGGGGTGGGGAGGGTGGGGGGGGGC14.166666666666666No Hit
CCCATGACCTGAGAGAGAGGGAACCTCAGAAAGAAAGGAGGGTGGGTGGG14.166666666666666No Hit
CTGCGGGTGCGGCCTCGTGTTGCCTTGCTGGGGCGGGCTGCCTCGTGGCC14.166666666666666No Hit
GGCTGAGCCCGCCCCCAAGGGGCGACAGAAGGGGCGGGGTCCTTACGGTG14.166666666666666No Hit
GGTCGGGGGGGGCCGGGGCGGGGCCTGTTGAGCGGGTCGCGGACACGGAT14.166666666666666No Hit
GCCGGTCCCGCTCTAGCTCGAGCTCCCGCACTCGCGCGTCGACGCCTCCC14.166666666666666No Hit
GGGCAGAGCCTGTACTGGAAACGGAGAGGGGGAACGGGCCTTTAGCTGTG14.166666666666666No Hit
GAGCGGCGGACGGCGAGAGGGGGGGGAGGCCGTAGGGAGCCAGGGCGGGG14.166666666666666No Hit
CGGCTAGGGTGGGCGCCGACGCCCTGGAGGAGGAGGACAACGTCCTGGTG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)