FastQCFastQC Report
Sun 19 Jun 2022
HG57LDRX2_n01_br84.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHG57LDRX2_n01_br84.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCCATCCATTCCTCCTCTGTTTCTCTTCAGAAAAGGTCCAACTACTATG13.3333333333333335No Hit
ATATACACTCAGACCCAAACATCAATCGATTCATTAAATATCTTACACTA13.3333333333333335No Hit
GCTTTAGGTAATTACGGAACTCTGAAGACTTGGGATAGACTAGGAGCCAG13.3333333333333335No Hit
GGGCGGGTTTGTGACCTGTATCCCCTCTCCCACACAGGGTGGTATGAAGG13.3333333333333335No Hit
CGTCTCACCCACCTGCTTAAGCGTCAGGTTAAAGAAGGAGTCATGGAAAT13.3333333333333335No Hit
CAATATGGCGGCGCGGCGGCCGGCAAACACCGCGAGATCTGAGGCGGCGG13.3333333333333335No Hit
CTGATAAACACAAGATCCAAGAGAAGCTAAGTGAGTGGTATAAGTGAATT13.3333333333333335No Hit
CTTCACGAGTCTCCGCAGCATGGAAAGATTTTCACACAGCATGCCACGGT13.3333333333333335No Hit
GAAGTGTTCAAGGCTGATGGCAACCTGGACACCCTTGCCCTTTCTGAACG13.3333333333333335No Hit
CTTCCAACGTAAGTGGACTCCAAGGGCAGCTAACCTGCTAGGGGGTCTGA13.3333333333333335No Hit
CCCTTTGGCAAGGCTTAGGGAGAAGCTCATGAAGGATTTCATTCAGTGCG13.3333333333333335No Hit
CAGTAGTTCTGATTGATTTGGCCTGGAGGTGACACTCATCAATTCTTTCC13.3333333333333335No Hit
GAGCAGGATTCCAGATACTGGAAGGCATAAATACAGTACTAAGGCACTCA13.3333333333333335No Hit
GAGCTGCACCTCTCGAGCAATCGCCTGCAGGCGCTGTCTCCCGAGTTGCT13.3333333333333335No Hit
GATTAAAGGCGTGCGCCACCACGTCCGGCTTTTTAGTAATCCAATTTTTA13.3333333333333335No Hit
CAGTGAGCGCGGTTGAGTGGGACCCGGGAGTACCTGAACGCTGTTCTCCT13.3333333333333335No Hit
GCTGAGACCTGTGCCCTGGGGGAGGGGTGGGGTGGGGTGGGTGAGGCAGG13.3333333333333335No Hit
CTGGAGTTCAGTCGAAAAGTTTCGAGAATTTCTTCAGAAGCAGGAAAAAA13.3333333333333335No Hit
AACACTAAAAGATTTATCAAAATCAACACTATAAAACCAGATTAAATATA13.3333333333333335No Hit
GCGCGGGCCTGCCTTCCCCGGCCTACCGGCCTCGCCTTAGGGACCCTGGA13.3333333333333335No Hit
CCTTAAGACTCTCTTCACCTGAGTCCATAGCCGGGCTTCAGGGTGAATGA13.3333333333333335No Hit
GTGTGTGGACAAGTCCTGGATTCCGGAGGGAGTGGTACGGTCCAACGGCC13.3333333333333335No Hit
GGTTTTACCTGCTGCTTCTGAGCGTCAGCCCTGGCCCTGAGAAGGTTCAT13.3333333333333335No Hit
GGCTAGCCCAAGAGGCACGCACTGCACTGCCCTTGCCCTCCCTCCAGAGC13.3333333333333335No Hit
CTGGAAGGCAGTGTCCTTCCCATCTTTGTAAGTTTGGCTATTCCAGGGAT13.3333333333333335No Hit
AGACCCAGCTGCTGGAGGAAACAGTCTTTTCAACCTACACCCTATGCCTC13.3333333333333335No Hit
CTCTAGCTCTTACCAGCTCAAAAGGAAGAAAATGGTTCATATGTCCTAGA13.3333333333333335No Hit
GTCCTAGGCCGCGCGCAAGCTCCCGGCCGAGACTTCGCGGGACGCTCTCA13.3333333333333335No Hit
ATTAAGACCTGCCTCCATTAAATGATTGTCTTCATCAAACCCCCTGGAAG13.3333333333333335No Hit
CAGACGTACTGCGTGCTTGGTGGCTGAACAGCAAGCGCTGAAGGTGGCAG13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)