FastQCFastQC Report
Sun 19 Jun 2022
HG57LDRX2_n01_br81.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHG57LDRX2_n01_br81.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC59

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACCCTACACCCTGTTTCTCCATGACTTAGAACCTACAAGCCAAGGATGCT14.166666666666666No Hit
ACCCAGCCTAGGGCGCTTCCTCTATCTCTAGCTCCACTCTGATCGAGAGG14.166666666666666No Hit
CTGTTGGGCAACTTTTCTGGACCACGATCCTGCAGCCCGGAGTCCGTGAC14.166666666666666No Hit
GGGAAAGGGAGCATGGAGTGGAGGCCTTTGACTGAGAAGCCATGAAGTCT14.166666666666666No Hit
GAACTGGCTTTGCAGCCCAGGACTCGAAGCCCCAGCTGTTGCATACCCGC14.166666666666666No Hit
CCTCTGAGCGCCCCCCAAGCGCGGAGGAACGGGTGCCCAAGGAGGACAGT14.166666666666666No Hit
CAGCTAGAGTCAAGAGCTCCCGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCC14.166666666666666No Hit
GCCCAAGACTGGCGGTTAGTTCAGTCTTTTAGCTGCACTTCACCATAACG14.166666666666666No Hit
GACATATCTCAGGGGAATATCCGAACAGGACTGTCATCGATTTAAAAAGC14.166666666666666No Hit
AGGCTGAGCCGGCCTTTCCGCTTCCCTACCATGTGCGCTTCCGCCCTCGC14.166666666666666No Hit
GCCCCGGAGAGGGGAGGAGGTACCGTCAAGCCAAAACCCTAGCCCAGCCG14.166666666666666No Hit
GGTTCCTTCCTGCAAGCTGCACAGAGGAGGCGTGGCTCGAATCCACAAAG14.166666666666666No Hit
CACACACACAGACACACACACACAGACACACACACACACACAGACAGACA14.166666666666666No Hit
GGACTTATCTGATGTCCTCCTGCTGAGGCCCACAGTAGAGCTAAGGGCCT14.166666666666666No Hit
GGACAGTGCTGGGTGCCGCAGAGGGCGGCCCGGAGGAGTCCGTGGACAAG14.166666666666666No Hit
CTGCTACACCATGTGGACTCCATCTGCTAGCACCTGCCATAATCTCCCGC14.166666666666666No Hit
CCCAAAATCCCAGTATTCAGCAAAGAACTCCAAACACCGGGACGTGCCCC14.166666666666666No Hit
GGGTGGGAGTGCTGTGTGATAGCAAGTGTCCAGGAGGATGTGGGAGCGCT14.166666666666666No Hit
TGGTGCAGCAGGCCGAGAGCTCGGAAGCCGAGAGCAACCTGCCCCGGGAC14.166666666666666No Hit
ACCCAGGGGTGCTGGTCCTTAGGAGGCAGAGGCTAAAGGTAGAGGGCCTG14.166666666666666No Hit
GGACAGCACATTGGGGGTGTTAATACATCAAAACACTCAAATCTACCATC14.166666666666666No Hit
CTCCACCACCGCGCCAAGCACTCCACCCCAAACCCAGGGAGTCAGGTGTC14.166666666666666No Hit
GGACAAGATTAACCAATGATGGGAACTAAACACTCATAGTTTGGTTTGGT14.166666666666666No Hit
GGCTTCTTCTTCACAGAGCGAAGGCGCATCCAAACGGCCCCCGTCCCCCA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)