FastQCFastQC Report
Sat 13 Apr 2019
H7J22BGXB_n02_ant10xantennae.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7J22BGXB_n02_ant10xantennae.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences652211018
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length99
%GC34

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGGATTATGACCTCGATGTT22542800.3456366019256669No Hit
CCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTA22087700.33865879892265177No Hit
GTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTT20938800.32104333447491684No Hit
ATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAG19915910.3053599134383222No Hit
AATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGA19256740.2952532151181782No Hit
GATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAA18073410.27710985403806837No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGGATAACAGCATAATTTAA17650840.2706308159915201No Hit
ATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAAT17393250.26668132736144606No Hit
GCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATG17124700.262563794958766No Hit
AATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGAT16813350.2577900332251057No Hit
ATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAA16767660.2570894930818234No Hit
GGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTT16645700.25521954613775016No Hit
ATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAA16330850.25039212079057516No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGATTATGACCTCGATGTTG15617670.23945731625159392No Hit
ATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCT15187750.23286558461666465No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGATGTTGAATTAAGATAAAT14579710.22354283502766586No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG13909450.2132660997149852No Hit
GTTTAAACCAATCCTTATTATTTATATATCGACCAGGACTTTACTTTGGT13235250.20292895450594794No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGATAACAGCATAATTTAAT13170790.20194062406961666No Hit
GGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTT12885220.19756213318064494No Hit
GATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTA12815030.19648594774275954No Hit
GAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACAT12356410.18945417447700952No Hit
GAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGA12072840.18510634851004618No Hit
ATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATA11487220.17612735269676172No Hit
GACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATT11184360.17148376355702719No Hit
ATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAA11178820.17139882172306387No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGACCTCGATGTTGAATTAAG11175060.17134117166968804No Hit
GGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATG10998910.16864035866379676No Hit
TAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAA10946880.1678426107177478No Hit
AAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATG10939560.167730377103197No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGTAGTATATATATAATTGGG10740290.16467507759888841No Hit
GTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAA10478820.16066609902011805No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAGAATTTTAAATATTTAATC10375020.15907458956788123No Hit
AAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATTT10304120.15798751808268285No Hit
TATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAA9940120.15240650227715105No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAATTAAGATAAATTTTGAA9823600.15061996392094068No Hit
CTTAGGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGAT9759810.14964190623348222No Hit
ATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAA9418420.14440755737125557No Hit
AAATTAATTACCTTAGGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATAT9311810.14277296370359693No Hit
ATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATT9225290.14144639917751284No Hit
AGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATT9121820.1398599494374074No Hit
GTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTT8773740.13452302641106256No Hit
CGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATC8456500.12965895648208753No Hit
ATTACCTTAGGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATT8388340.1286138959400407No Hit
ACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTT8254720.12656517250065835No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGACCAGCGCGCTTCGCGCG8139560.12479948629141374No Hit
TGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCG8078170.12385822651036539No Hit
AGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATTTG7982260.12238769017545177No Hit
GAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATTTGA7954930.12196865401620677No Hit
TTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTT7656170.11738792796658949No Hit
CTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAA7560770.11592521118678802No Hit
ATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATTTGAGTTTAGATCGG7396430.11340547454535643No Hit
AATTAATTACCTTAGGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATA7254890.11123531801482077No Hit
ATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATTTGAGT7221630.1107253603618208No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAAATAAGAATTTTAAATAT7193360.11029191168923184No Hit
AAGATAAATTTTGAAATAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATT7174420.11000151487781214No Hit
GATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGAC7150380.10963292251527097No Hit
CAGAGGTATACCTCGACGTTACTCAGATTATCCAGATTATTTTTTATCTT7058680.10822693584118506No Hit
TAAGAATTTTAAATATTTAATCTGTTCGATTATTAAAATCTTACATGATT7018360.10760873101349538No Hit
TTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGA6958680.10669368974076425No Hit
TATAATTGGGATTATGACCTCGATGTTGAATTAAGATAAATTTTGAAATA6901330.1058143731021729No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAAAATAATAATATTAATTA6744740.10341346303352392No Hit
CCTCGACGTTACTCAGATTATCCAGATTATTTTTTATCTTGAAATATTAT6714650.10295210928190728No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAATTTTAAATATTTAATCT6676190.10236242283168542No Hit
GAAAATAATAATATTAATTAAATTAAAATTAATTACCTTAGGGATAACAG6673610.10232286508229459No Hit
ACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATATATAATTGGGATTATGACCTCG6651980.10199122395077355No Hit
AAAATTAATTACCTTAGGGATAACAGCATAATTTAATTTTGTAGTATATA6615840.10143710881008146No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
AAGCAGT113353600.091.357531
AGCAGTG119636450.086.283322
GCAGTGG131020250.078.667853
CAGTGGT133768650.077.025594
AGTGGTA136658150.075.6160355
TGGTATC138300300.074.482657
GTGGTAT138952900.074.291356
GGTATCA138995350.074.2044148
GTATCAA139300400.074.0516369
ATCAACG138893450.039.60942510-11
GCAGAGT139369950.039.5407416-17
AGAGTAC139673250.039.52630618-19
CAACGCA139174900.039.50022512-13
TACATGG138722800.039.4427722-23
CATGGGG84618300.039.3750324-25
ACGCAGA139991100.039.35271514-15
AGTACAT140527800.039.17755520-21
CATGGGA34826000.039.02937724-25
CAGTGGG592300.037.607874
TGGGGAC5396850.037.5214926-27
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