FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_F9.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_F9.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAGCAAAATAAAGAAGAAATTAAAAGAATACTAAACTAACACAAGACGAA13.3333333333333335No Hit
GAGGCAACACCCTTGGCCTCGATATCGAACCAGCCACTCTTGTTGGGAAA13.3333333333333335No Hit
AATACGAATAGCTCCTGGCTACAGGACTTCAGTGACATCCACTTAGAGCA13.3333333333333335No Hit
GCAGGAAGCCCAATGCGGGGCTCTGTTCTAGGACTCGGAGTTCATAACTC13.3333333333333335No Hit
AGCATGTATAGACAAATTTAAGTTGATGTCACCATTTCAATCACTACTTT13.3333333333333335No Hit
TTCCATGCATGTTCCCAGGCAAGTCTCTTGTGGTCAGGGAAGTCAAGTAA13.3333333333333335No Hit
TACGAATAGCTCCTGGCTACAGGACTTCAGTGACATCCACTTAGAGCACT13.3333333333333335No Hit
GTCCTCATCGGAGGACTTGAATGGAATGGTAACACGGTTCGAGTCTCTGA13.3333333333333335No Hit
CCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA13.3333333333333335No Hit
GTTCCTTGCAGACTCCTGAATTCAATGAAAATGCAATCTCAAAGAACATG13.3333333333333335No Hit
GAAGGGGGGTGGACAGGGATGGTAGATGGATGGTACGGTTATCACCATCA13.3333333333333335No Hit
CAGTAATACGAATAGCTCCTGGCTACAGGACTTCAGTGACATCCACTTAG13.3333333333333335No Hit
ACAAATGCTTGAGAAAGAAGATTTTTAGGCATAGAAAGATAAGAAAGAAA13.3333333333333335No Hit
GAATAAGAGAGGCTATCTAATAAGAGCACTGACATTAAATACGATGACCA13.3333333333333335No Hit
ACCCATCCACTAACAGGGCAGAGAGAGGAATTGCCCGCTAATTTCACGGA13.3333333333333335No Hit
GGACTCAGGTGTCTGGACTGAGGAAAATCCCTCTGGTACCCACTGTCCTT13.3333333333333335No Hit
GTGTGCAGGGATAACTGGCATGGCTCGAATCGACCGTGGGTGTCTTTCAA13.3333333333333335No Hit
GTTCCATGCAGTCTCCTCAATTCCATGGAAATGCCATCTCAACGAACACG13.3333333333333335No Hit
AGTGAAGGGCATCGGAGTACGAGGCTTGAAGACGCTCATGCCGCGCCTGT13.3333333333333335No Hit
ATCCTGGACGGGAGCAAGACTGTGGTGGAAGCTGAGATGGTCGTGACACC13.3333333333333335No Hit
ATGTATAGGAGTTTATGTAGTTCCAGAAGAGAATTGCTGGATCATATTGC13.3333333333333335No Hit
GTTGAGTATGTGGTATGCAATATGATCCAGCAATTCTCTTCTGGAACTAC13.3333333333333335No Hit
TCTACACACAGAGCACCTGTGACCCATGTTCCTCCCTGCCCCATCCGCAG13.3333333333333335No Hit
ATATTGCATACCACATACTCAACTTTAGGAGTTTTCCAAAGTGGTAACAA13.3333333333333335No Hit
GTTTCATTCATCCATGTTCAACAACTACTCTGTGCCTGTCTCTTATACAC13.3333333333333335No Hit
ATGGTACATGCAATGAGAACTATTGGGACTCATCCTAGCTCCAGTGCCTG13.3333333333333335No Hit
GGCTAGGAACCTAGGTCTCTGCACTCCAGAGCATGGGCTGTGCCCAGCAC13.3333333333333335No Hit
CTCCAGCTATGACCAAAAGAAAGTGTCTTAACATGCGTGCTGTGAGTCCT13.3333333333333335No Hit
TGTTTGTTGTCACAGAGCCTGTGCAGCTGTGAACAGTGGGCTCCACCTGA13.3333333333333335No Hit
TTGCACATTCTTTCATAAGCAACCCTTGTCCTTCGTCCATTTTCACCCCT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)