FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_E7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_E7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCAGTAGGTAAAGAGTTCAACCACCTGGAAAAAAGAATAGAGAATTTAAA16.666666666666667No Hit
CCTTACAACTACTGCTTGAAGTAGAACAAGAGATAAGAGCTTTCTCGTTT16.666666666666667No Hit
AGGCATGAGCATGAACCAGTCTCGTGACATTTCCTCGAGGGTCATGTCAG16.666666666666667No Hit
GTCTCCACAACTTGAGGGGTTTTCGGCTGAATCTAGAAAATTGCTTCTCA16.666666666666667No Hit
GATCATTAAATATACAGAGATTCTCAAGTAGAAACTGAGATGAGAATGGC16.666666666666667No Hit
GGGTAGCCCCATTGCATTTGGGTAAATGTAACATTGCTGGCTGGATCCTG16.666666666666667No Hit
AGTAGGTGGATGGTGAATGCCCCATAGCACGAGGACTTCTTTCCCTTTAT16.666666666666667No Hit
GTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGTTTCATTACCAACACTACGT16.666666666666667No Hit
CTTCACTACCTCCAGAGCAGAAATGAAAAGTGGCGAGAGCAATTGGGACA16.666666666666667No Hit
AAATTGAGAAAATAAGGCCTCTTCTAATAGATGGCACAGCATCACTGAGT16.666666666666667No Hit
GTCCAGATTGCTTCAAATGAGAATGTGGAAACCATGGACTCCAATACCCT16.666666666666667No Hit
GGTGTGGATGGCATGCCACTCTGCTGCATTTGAAGATTTAAGAGTATCAA16.666666666666667No Hit
TCTCTGTATATTTTCAGAGACTCGAACCGTGTTACCATTCCATTCAAGTC16.666666666666667No Hit
ATCAAAGAGTACACATCAGGAAGGCAAGAGAAGAACCTGTCTCTTATACA16.666666666666667No Hit
GACCAAAAGCAGCTTCTGTGCTCACTCTTCCCAACCTGTTGTATATGAGG16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)