FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_A7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n02_CIVIR_Ferret_Flu_R1_A7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC39

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGAAGATCCTTAAGCTCTCGTGGGGAAAAAAGGTACGCAAGGAAAGGGG14.166666666666666No Hit
GTGTAAGAATCGGTTACAATGTGTATGTTTATGTCATAAGGGAAACATTC14.166666666666666No Hit
CCTATGTTCGAGTCATGATTGGGAAATGAAATTGTCTTGGGGAATATCTA14.166666666666666No Hit
GTTATCAACAACTACTTGATGAATATGTTGAGTAAACTAGATTGACTCAC14.166666666666666No Hit
TCTGTGGTCACTGTTCCCATCCTGTTGTATATCAGGCCCATGAAACATGT14.166666666666666No Hit
GTTTTTGTCATAAGGGAACCATTCATAAAATGATCCCCATTGGAATGCAC14.166666666666666No Hit
TCCACAGACTGATAACCCCCATCCAGACAACCAGTACCAATGAAAAGGCG14.166666666666666No Hit
ACCCTAGGTGGAATGAAAATCAAAATCCTAGAATGTTCATTGCGATTATT14.166666666666666No Hit
CTCTGAAACCTCACCATCGCTAAATTTATCATCACAACCATAACCTAATG14.166666666666666No Hit
AGTTTGGTCCTCCATCTGATACTAAAAGCCCTACCTTTGATTGAGTTTGA14.166666666666666No Hit
ATGTATAGGTTATCATGCGAACAATTCAACAGACACTGTAGACACAGTAC14.166666666666666No Hit
AATGTAAAGAGATTGTTAAAGATATCTTCATGCTAAAGGGAACTACCTGC14.166666666666666No Hit
AATCAAGGGAGTTATTTTACTTAAATAAATGTCAAACGACAATGATCCTA14.166666666666666No Hit
TTAAGGAAAATAATTTATCAATAAAACTTAAAAATAGTTAAATCATAAAT14.166666666666666No Hit
TCAGTGGTAACATTATTCTGTAAAATAGTTCCTACTCATTATTGCTATAT14.166666666666666No Hit
ATACAGCATTTCTTCCCTTCTTATCTGTCCTTGAATTACTTAGTGCTGAG14.166666666666666No Hit
AAAGAGGAGACTTGATTTCCTAAAAAGTAGTAACTAAAATCATAGTTTCT14.166666666666666No Hit
CACAATACAAAAAGCAGCATCTGTGGTCAATCTTCCCAAAGTGATCTATA14.166666666666666No Hit
ATCACAATGATAATTGCTGCAATAACGAGAGTATCACTATAATCTCTGCA14.166666666666666No Hit
GGATATGATTGCATAATTAAGGAAGTTTGGGTTTTTTTAAGAGTACTTCT14.166666666666666No Hit
ATAAAGGCTCATATTGAGAACTGATACCTTAGCCACTTGATGATTTTTAC14.166666666666666No Hit
ATCCAGAATAGAATAACAATAGAGAGGATGGTGCTTTCTGCTTTTGATGC14.166666666666666No Hit
CTTAACAAATGAGACACCCAGGTGCCCCAGTTAGCATTGCTTTAAAAAAT14.166666666666666No Hit
ATGTGAACATGTAGTGAATCCAGCATAACTTAATGGGCTCTTGACACACA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)