FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_F9.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_F9.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC51

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATAGATCTCTTAAGATGGAAGTGCCAGCAGCTACAGATCCTTCCAAGG26.666666666666667No Hit
AACTTGCCTCTCTCTGCATCTTTGGTCATCGTATTTAATGTCAGTGCTCT13.3333333333333335No Hit
CCCCACAGATACTGCTGGGAGCCGAGGGAAGGCAATGCTGAGGTCCCTCC13.3333333333333335No Hit
AGCTAGTTGTCTTCTCTGAGCCTTCTTTTTCCCTTCTGCGGGGATAATCT13.3333333333333335No Hit
CTCTAATGCAAGGTTCAACACTTCCCAGAAGGTCTGGTGCCGCAGGTGCT13.3333333333333335No Hit
CTGGACAGTCAGTGGTTTCCGTGAAATTAGCGGGCAATTCCTCTCTCTGC13.3333333333333335No Hit
AGTTTATGTAGTTCCAGAAGAGAATTGCTGGATCATATTGCATACCACAT13.3333333333333335No Hit
GCACAGAGTAGTTGTTGAACATGGATGAATGAAACCTGTCTCTTATACAC13.3333333333333335No Hit
TCGTATTACTGTCCCTACTTTGCGGAGGACTCACAGCACGCATGTTAAGA13.3333333333333335No Hit
GTGCGGCATGAGCTTCTTCAAGCCTCGTACTCCGCTGACCTTCACTCTGT13.3333333333333335No Hit
CCCAGCAGTATCTGTGGGGTGATGCCACAGTGGGCTCTGCTCTTTCTCCA13.3333333333333335No Hit
GTATAAAGTATTAGGATACGGATCTGCAGATTCTCCAGTACACTGTTGTA13.3333333333333335No Hit
CTCAGCAGCAGGGCAGAGACCGACTTTTACTCACAGCCTGAAGATCTGCA13.3333333333333335No Hit
CAGCTACAGATCCTTCCAAGGTGCCAGGCAGTGCTCTAAGTGGATGTCAC13.3333333333333335No Hit
GCACTGGAGCTAGGATGAGTCCCAATAGTTCTCATTGCATGTACCATCTG13.3333333333333335No Hit
GGGTGTTTCCCAACAAGAGTGGCTGTTTCGATATCGAGGCCAAGGGGGTT13.3333333333333335No Hit
GGGTTTCATCATCTCAGCCAGGCTGGTCTGGAACTGCTGACCTCGTGATC13.3333333333333335No Hit
AACTAAAGTAGGGATTGAAATGGTGACATCAACTAAAATGAGGCTATCCA13.3333333333333335No Hit
GGTTTAGGGGCCGTACTCAGCTGGTTGAGTGTCATAGAGGAAAGGACAGT13.3333333333333335No Hit
GGATACGGATCTGCAGATTCTCCAGTACACTGTTGTTGGTACTATAAATT13.3333333333333335No Hit
GCCAGGAGCTATTCGTATTACTGTCCCTACTTTGCGGAGGACTCACAGCA13.3333333333333335No Hit
GGTATAATCTGGAAAATTCCCTCAGGTGTAACGCCCCTCTGCCCAGCCTT13.3333333333333335No Hit
GCATATCCTGACCCCTGCTCATTTTGATGGTGATAACCGTACCATCCATC13.3333333333333335No Hit
ATCCAGCCCTGTTAGTTCTGGATGCTGAACAAAACTCCCGCTATATCCTG13.3333333333333335No Hit
GGATGATAGAAAGAACGTACGTTTCGACCTCGGTTAGAAGACTCATCTTT13.3333333333333335No Hit
CCTTTGGTTTGAGTTATGAACTCCGAGTCCTAGAACAGAGCCCCGCATTG13.3333333333333335No Hit
GTTCGTTGAGATGGCATTTCCTTGGAATTCAGGAGACTGCATGGAACCTG13.3333333333333335No Hit
GCATAAATGTTATTTGTTCGAAACTATTCTCTGTCGCTTTCAATCTGCGC13.3333333333333335No Hit
GGATAGTGGTAAGGGGAGTGAAGGGAAGAGAGAAATTCAGTTTCCTGGAA13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)