FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_E7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_E7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATTAAATAAGCTGAAACGAGAAAGCTCTTATCTCGTGATCTACATCAAGC16.666666666666667No Hit
GGAGCAAAAAGCTTCTACAAAAATTTAATATGGCTAGTTAAAAAAGGAAA16.666666666666667No Hit
CTTTCAAAAGGGAGATTCCGCTGCACTGAGAATGTAGGCTGCACACTGAT16.666666666666667No Hit
GAGACACTTAGAATGACAATTGCATCTGTACCTACTTCGCGCTACCTTTC16.666666666666667No Hit
CATTAAATAAGCTGAAACGAGAAAGCTCTTATCTCTTGTTCTACTTCAAG16.666666666666667No Hit
TCACACTCTGGCTTTCCCAGGATCCAGCCAGCAATGTTACATTTACCCAA16.666666666666667No Hit
GTATATTGTCTTGGTGTATTTCTTTTGTCCAAGATTCAGTATCGAGACTC16.666666666666667No Hit
GTTCTTCTCTTGCCTTCCTGATGTGTACTCTTTGATCTGTCTCTTATACA16.666666666666667No Hit
TTTTCCAATAGAACCAACAGTTCGGCATTGTAAGTCCAAATGTCCAGGAA16.666666666666667No Hit
GCTGCAAGGGGACGTAGTGTTGGTAATGAAACGAAAACGGGACTCTAGCA16.666666666666667No Hit
GCCCAGTATCTGCTTCTCAGTTCCAGGGTATTGGAGTCCATTGTTTCCAC16.666666666666667No Hit
TTACCTTCTCTTCCAGGACATACTTATGAGGATGTCAAATATGCAGTTGG16.666666666666667No Hit
GCTCTTATCTCTTGTTCTACTTCAAGCAGTAGTTGTAAGGCTTGCATAAA16.666666666666667No Hit
GCAGCGTAGACGCTTTGTCCAAAATGCCCTAAATGGGAATGGGGAACCGA16.666666666666667No Hit
GCAAATAGTAGCATTGCCACAACTACTTCAGTGCATGTGTGAGGAAGGAG16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)