FastQCFastQC Report
Mon 11 Dec 2023
H7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_A7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH7GWJBGXV_n01_CIVIR_Ferret_Flu_R1_A7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCCTGACTTATAAATACAAAAACTGCATACAATAGTAGTTTATGTCATA14.166666666666666No Hit
ACTATGATTTTATGTAATAATGTTGATGAACGACATGATCATAGTGAGAA14.166666666666666No Hit
CATCAAAAGCAGAAAGCACCATCCTCTCTATTGTTATGCTATTCTGGATC14.166666666666666No Hit
AATAAAGACGATCAGTAATCAACAATAACAAGTGGTAGATCAATAACATT14.166666666666666No Hit
CTATAACAGAGATTATTTTTTAAAGCAATTCTAACTGGGGCACCGGGGTG14.166666666666666No Hit
AGCATGATATGAATGGTTACCTTATGACAAACAAATAAACCTTGGAACCG14.166666666666666No Hit
CCATACTACTTCTGCATGATGTACAACAACAGATAAGAGCTAACTCCTTA14.166666666666666No Hit
GTTGCATGGGCCTCATATACAACAGGATGGGAACAGTGACCACAGACTGT14.166666666666666No Hit
GCGTAGACGCTTTGTCCAAAATGCCCTAAATTGGAATGGGCACCAGAAAA14.166666666666666No Hit
TCTCAGAAGAGTATCAAGAACAATTCAGAACATACAATATGTGTGTGATA14.166666666666666No Hit
TCAGGATGGTGCCCGGTAGACACTCAAAAGATCTGTTGAGCCAGTAAGAG14.166666666666666No Hit
ATCACATTCATTAATACATTCTTTGTATGTAAAGAGAATAAAATAGTCAA14.166666666666666No Hit
GGGTTTGAGATATTCACAAATACAAGTTCATGTCACAAAAATGACTCGAA14.166666666666666No Hit
GGTCTAGTGTGTGCCACTTGTGAACAGATTGCTGATTCACAGCATCGGTC14.166666666666666No Hit
CCATAGGGGAGACACACAAATTCAGAAGAGAAGATCATTTGAGTTAAAGA14.166666666666666No Hit
AATCTAGAGTTGTATGGAGAGCGACCATCAACAATACGACAGATAATTAG14.166666666666666No Hit
GTATAGGTGCCAACCTCAGGAAGATTCTGACCCACTCGCGTTGAGATCTT14.166666666666666No Hit
ACAGAGATCACAAGTAGGCAGAGAGGCAGGCAGAGAGAAAGAGAGAAAGA14.166666666666666No Hit
ATGTTACATTTACCCAAATGCAATGGGGCTACCCCTCTTAGTTTGCATAG14.166666666666666No Hit
GAGTTACACTGAATTTTACTCAGTTCCCACAGAAGTACTCTTAAAAAAAC14.166666666666666No Hit
GGTGCAAGATCCCAATGATATTTGCTGCAATGACGAGAGGATCACTTGAA14.166666666666666No Hit
GATGTCTATTCGTCAATGTGAGTATATGTTGTAGATCAAAATCTTTGTCC14.166666666666666No Hit
AATGTGAAGAACTTATAACAAAAGGTAAGAAGCCAGCTAAAAAACAATGC14.166666666666666No Hit
TGCAATAATTGTTTCAATTTGATTATCAAATGAGGAGTTAATGATCAATG14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)