FastQCFastQC Report
Wed 8 Apr 2020
H5HNMAFX2_n02_No_index_control_water.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH5HNMAFX2_n02_No_index_control_water.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGTAAAGAATTCAACAAATTAGAAAAAAGGATGGAAAATTTAAATAAAA16.666666666666667No Hit
TTGTGGCGGGGCGGGGGGGTGGGGGTTGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGG16.666666666666667No Hit
TGACTGGGCCTTGGTAAGACCCGGAGACCCAATAATAGTTGAGGCAAATG16.666666666666667No Hit
CAGGCCAAGTAAAAACATAAAAGAAAGGGCGCTCATATTACACCGGCGGC16.666666666666667No Hit
GCTGGCAGTGGCCTGTCGAGCTGGATGTGTTGCTAGGCTCCGGGGGGGGT16.666666666666667No Hit
TTAAAATACAACGGCATAATAACTGAAACCATAAAAAGTTGGAGGAAGAA16.666666666666667No Hit
GAGCTAAGTCGGTGCTGGTGTAGGGTAGGTGTNGNNNNNNGTTGGNNNNN16.666666666666667No Hit
CTACAGTATCACTATTCACGCCACAAAAAGAAATGCTGATCTCACTAGTC16.666666666666667No Hit
CCCTAGGAGGTCTGGAGCCGCAGGTGCTGCAGTCAAAGGAGTTGGAACAA16.666666666666667No Hit
GTTCGGGGGTCTCGCTCTGCGCCTGCACGATAAGCAGCAGGTTTCTTGAT16.666666666666667No Hit
CCGGGGGGTGCGTCATGGTGCGGTGGAGGGGGCGTCGGGGCGATGGGGGT16.666666666666667No Hit
TTATAGGAAAGCACCCAGATGTAACAGGTCTGACTACATGGAGTATTGAA16.666666666666667No Hit
GTGTCAGCTTGTCTACTCGTGTTTGCTGAACAACCTCCATCGTTTCAACA16.666666666666667No Hit
ATATCAACATGTGGATCTATCTGACGGGATGTCGGAATAATAAGACTCAT16.666666666666667No Hit
ATACTGGAATATGCAACCAAAACATCATTACCTATAAAACTAGCACCTGG16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)