FastQCFastQC Report
Wed 8 Apr 2020
H5HNMAFX2_n01_No_index_control_water.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH5HNMAFX2_n01_No_index_control_water.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGTAGTGGTGTTTGGATAGGAAGGACCAAAAGTCACAGTTCCAGCCATG16.666666666666667No Hit
GACAGGAACAGGATACACCATGGATACTGTCAACAGGACACATCAGTACT16.666666666666667No Hit
GGGGGCGGGCCCCATGTGCCATCAGGACTCTGGCATGCGAATGTGGAGCA16.666666666666667No Hit
GCGTTGCCTCCTCCAGTCACTTCAACAAATTGAGAGTATGATTGAAGCTG16.666666666666667No Hit
TTCCCGGGCGGTGGTCTTGTATGTGAGGTCAATTGGTTCCTCTCAAATTT16.666666666666667No Hit
GTATGGTTTTGACTTCCAGTTTGAATTGAATGGCTAATCCATATTGAGAT16.666666666666667No Hit
ATTTGAGTCGGTTGCTTGGTCAGCAAGTGCATGTCATGATGGCATGGGCT16.666666666666667No Hit
CTCAATATGAGTGCAGACCGTGCTAGAAAAGTGAGATCTTCGAACTCAGC16.666666666666667No Hit
CCCATGGCCGGTTCGAACCATGCCAGTTGTCTCTGCACACACACATCACT16.666666666666667No Hit
GTAACATCCAATGCAGATCGAATCTGCACTGGGATAACATCGTCAAACTC16.666666666666667No Hit
CATTAAGGCCCTATAAGGGCTTCTGTCCTTAACAGTCCCATTTGAATGCT16.666666666666667No Hit
CTTCAACTTTTTTATTTAAATTTTCCATCCTTTTATCTAATTTGTTGAAT16.666666666666667No Hit
TCTCAATATGGATTAGCCATTCAATTCAAACTGGAAGTCAAAACCATACT16.666666666666667No Hit
GTCTAGCCCTGTTAGCTCAGGATGTTGAACGAAACTTCCGCTATACCCTG16.666666666666667No Hit
TTCCATGCATTCATTGTCACACTTGTGGTAGAACTCAAAACATCCATTTA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)