FastQCFastQC Report
Mon 21 Nov 2022
H3TJ5BGXN_n01_R11.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH3TJ5BGXN_n01_R11.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATAGCACCGTTCTACTGGAAAGGACGAAACAACGCCTTGCTCAGAGGGA13.3333333333333335No Hit
ATACACTAACTCTACACGAAAGGACGAAACACAGGCTTATTGCCATCCAT13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCTTGTGGAAAGGACGAAACAACGAATACATCGGCACGG13.3333333333333335No Hit
ATAAACCAACTCTACTCGAAAGGACGAAACACAGCGCAGGGACGGATTCC13.3333333333333335No Hit
ATAAACAAACTCTACACGAAAGGACGAAACACAAGAACAATGATAACCGT13.3333333333333335No Hit
GATAGCGCGGTTCTACTGGAAAGGACGAAACAACGCAACTGGGATAGGCC13.3333333333333335No Hit
TAAGTAGACTCTTCAGCAAAGGACGAAACACCGCAGGAAGGGCCTCAGCA13.3333333333333335No Hit
GATCGCTCGGTTCTTCTGGAAAGGACGAAACACCGCATGTATTAGAGCTC13.3333333333333335No Hit
ATACACGAACTCTAGTGGAAAGGACGAAACACAGATTTATGAATGTGCAC13.3333333333333335No Hit
GATCGCGCGGTTCTAGAGGAAAGGACGAAACACCGAACAAAGCAAATAGC13.3333333333333335No Hit
ATACACCATCTCTACACGAAAGGACGAAACACAGTGTATCCAAATTGGAC13.3333333333333335No Hit
TAAGTAGAGTCTTGACGAAAGGACGAAACACCTCATTAAAGAACAGATTC13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCAACAGGAAAGGACGAAACACCGGGATGCAAGTGGCCG13.3333333333333335No Hit
GGGTGGCGGGGGGGGCCGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGCC13.3333333333333335No Hit
ATAAACGATCTCTAGTGGAAAGGACGAAACACAGGCCTTCGGAGCCGCGA13.3333333333333335No Hit
ATAAACTAACTCTACACGAAAGGACGAAACACAGGAGACGGACGTCTCTC13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCTACAGGAAAGGACGAAACACCGGGCTCAGAGAGCCCA13.3333333333333335No Hit
ATACACGATCTCTACAGGAAAGGACGAAACACAGGAGAAGGACGTCTCTC13.3333333333333335No Hit
GATAGCACCGTTCAACAGGAAAGGACGAAACACCGCGAGCCGGGACCTCC13.3333333333333335No Hit
ATACACGATCTCTACACGAAAGGACGAAACACAGCGAATCGCGAGTAGAT13.3333333333333335No Hit
TAAGTACACTCTTGTGGAAAGGACGAAACACCGAGACTTCCCAGCCAGAA13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCTAGAGGAAAGGACGAAACACCGGTCGCCTTTCGAGAT13.3333333333333335No Hit
ATACACGATCTCTACACGAAAGGACGAAACACAGGGCAGGGCCTCCGGTC13.3333333333333335No Hit
TAACTAGAGTCTTCTCGAAAGGACGAAACACCGGCGTAAAGTCGCAGCGA13.3333333333333335No Hit
TAAGTAAAGTCTTCACGAAAGGACGAAACACCAGCTGATCCTCTGATTAA13.3333333333333335No Hit
TAATTAAACTCTTCTCCAAAGGACGAAACACCGGCGATCGAAGGGCGCCA13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCTAGAGGAAAGGACGAAACACCGGAGTGAGTTAGCCAG13.3333333333333335No Hit
GATAGCTCCGTTCTAGAGGAAAGGACGAAACAACGAAAAAACATCTTTAA13.3333333333333335No Hit
ATAAACAAACTCTACTCGAAAGGACGAAACACAGCATACTCCTGGCATAA13.3333333333333335No Hit
GATAGCACCGTTCTAGTGGAAAGGACGAAACACCGCTTTGCGCTCTCTAT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)