FastQCFastQC Report
Thu 4 Apr 2024
H2G7GDRX5_n02_MTS_2.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH2G7GDRX5_n02_MTS_2.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length150
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCTCGCAACCGGCGCCTCTGCTCGCCGCCCGCCCCGACCCACGTTAGGGC16.666666666666667No Hit
CCGACTTCCCTTGCCTACATTGTTCCATTGGCCAGAGGCTGTTCACCTTG16.666666666666667No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGCCTCCCTCTCGTTCCATTT16.666666666666667Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGCGGACCGCGACCCCAGGTCC16.666666666666667Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
GAATTCCCTTCTATATGGAACTGGATTCCATATCGACGGGAATTCTAGAT16.666666666666667No Hit
CTGGGGGAGCGACGCAGTGTACGTGGGGGAGGGCCGCGCGCCGGGCGAGT16.666666666666667No Hit
TTCAGTGAACAATTACAATAAGCCTCCTTATAGACCTTATAGAGGAGTCT16.666666666666667No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAGTGATCTGTGTGGTTGGCA16.666666666666667Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
GCCCCCGACGTCGCGAGAAGTCCATTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGA16.666666666666667No Hit
GGCTGCTCCAGGCAGGGGCGGCACGGGGAGGCACTAGAGCTATTTGCTGC16.666666666666667No Hit
AAGCAGTGGGATCAACGCGGAGTAGAGGGGCAACGGGGAACTTTGTGGGC16.666666666666667No Hit
GCAACAACCTGCTGGGGTGGATCCTCCTGGGGGTCTTCGGCCTCATCTGG16.666666666666667No Hit
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAG16.666666666666667Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGAGCAGCTCGATCTGGACGAA16.666666666666667Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (100% over 25bp)
GTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTACGTTGTTGCAGTTAAAAAGCT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)