FastQCFastQC Report
Thu 4 Apr 2024
H2G7GDRX5_n01_MTS_2.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH2G7GDRX5_n01_MTS_2.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length28
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAACTTCCAGGTCTCGTGGTGTCGAGGC16.666666666666667No Hit
TGCGGCAGTCTTGCTCCCACATATCGTA16.666666666666667No Hit
ACTGTCCAGACTCGAGATGCCGATACGA16.666666666666667No Hit
ACCAACAAGGCAGGGAGGGATTGGCGCC16.666666666666667No Hit
GCACGGTAGTTGGCTTGCATGGTGGTGC16.666666666666667No Hit
AGACTCAGTGAAGCGTATCTGGTCCGTA16.666666666666667No Hit
TCCTCCAAGTAACATAGAGGGAGCGTTC16.666666666666667No Hit
CACTTCGGTTTGGGTTGAGCGCCCGCAC16.666666666666667No Hit
CAGCCAGTCTGAGCATGAACTATATCTT16.666666666666667No Hit
TTCTTGACACACCTAAGCACGACTACTC16.666666666666667No Hit
AGGTTGTAGCACACAGGTCATCGAACAC16.666666666666667No Hit
TCCTAATAGAGGTTTATCAGCCCGGATC16.666666666666667No Hit
CACCGTTTCAAGCCCGCGAACGTGCACC16.666666666666667No Hit
ACTTCCGCGTTGGGACCGGTCTGGTTAG16.666666666666667No Hit
ACTATCTAGAACCCGACGCAATACCAGC16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)