FastQCFastQC Report
Fri 5 Mar 2021
H273YDRXY_l02_n01_Fluc_bc_2546.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH273YDRXY_l02_n01_Fluc_bc_2546.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences9958
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length101
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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TACGTGTCTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC190.19080136573609158No Hit
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CACTCCCATTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC190.19080136573609158No Hit
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CCTAAGACTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC180.18075918859208676No Hit
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GTTTAAAGTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC170.17071701144808193No Hit
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GATCCCCCTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC160.1606748343040771No Hit
TCAAATAATTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC160.1606748343040771No Hit
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TGTTATAATTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC160.1606748343040771No Hit
CCGAACATTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC160.1606748343040771No Hit
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TTTATACATTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC150.1506326571600723No Hit
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GACGACTTTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC140.14059048001606747No Hit
GGTACATGTTCGGTTTAATATGGACTAAAGGAGGCTTTTGTCGACGGATC140.14059048001606747No Hit
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