FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_4_84.3410000000b24f.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_4_84.3410000000b24f.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences120
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGTTATACATCTCGTATGCCGTC86.666666666666667RNA PCR Primer, Index 39 (95% over 21bp)
TTCCGCTAACACCCCTACTTGCTTTGTGTACCTAGAAGAGAAGAGGGTGAT10.8333333333333334No Hit
CTCATGTCTCGTGATCAAGGATTTCGGTGAGGAGACAACTGCACTAAACAT10.8333333333333334No Hit
CCCGCCATCTTTTGCTGGCTCTGTGGGGGTAGTTGTAGACCTGTCTCTTAT10.8333333333333334No Hit
CTTAGACACACTGTATTGAGGTTAGGCAATTGAGGGATAGAACATTAGCTG10.8333333333333334No Hit
GATATATCTATTGTTTGGTTTTGGGGATCAGCATACAACCTCAATCAATCT10.8333333333333334No Hit
GAGATAGACCTTCATCCACAAGGAAATGGCAAAGCCTTTTTTCTCTTTTAA10.8333333333333334No Hit
AGTCTAATCTGAGGAAAAACAAAAATCAAATTGACAAGAAAATTGACACAA10.8333333333333334No Hit
TCCCAGACAATACATTTTGGAAACTACTTCCTTGAAATAACAGTCCTGGAG10.8333333333333334No Hit
ATGAGGAATTGTTACTATGTAGTCACAGATAAGGGAGGATGAGGAATTGTT10.8333333333333334No Hit
TTTGAAGAGGACAAAAGCAGCAATATGGTTTTTGTTCTGCATCACTCCTTC10.8333333333333334No Hit
TTAGAAGATAGTGTGTACAACAAAAAGAGACTTCAAAATTGTTGGTGGCAA10.8333333333333334No Hit
GTGTGACTGTTTTGGACTCGTTTTTGATGGATGATCTTTATTGTTTATCTG10.8333333333333334No Hit
TTTCAATATCCACCTTTCCAATTCGAAGTCACACCATAGCTATGCTTATAC10.8333333333333334No Hit
CCTTGTTAGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGATATGCTTAAACTCCTGTCTC10.8333333333333334No Hit
GTTTTTCTTCCATATCTTGAAGAATTGCATCAAGCCGTTTCAATTCAGCAG10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACAGGATGTGATCTCGTATGCCGTC10.8333333333333334No Hit
CACCTGAATGGCCCGGGCCAGCTTGATCGGCATGCCGACTTCGCCGGCAAT10.8333333333333334No Hit
GGTTATATGCTTTCCCACATTACTGAAGAATTGAGAAGATGCAGTTTTAAA10.8333333333333334No Hit
CACTATAAGATGACCTTCTTTACATACCAAACTCTCAATGATGGCTCTGAG10.8333333333333334No Hit
GTACGGGCAGAAATCACATTGCGTTAGCACTGTCTCTTATACACATCTCCG10.8333333333333334No Hit
GGGCTGAATGGCGTACTGACGGCCATCATGGTGCCGGTGCTGGCGGCCTGG10.8333333333333334No Hit
GTGTAAGAGCTCGAGCATACACTGTTTCAAGATCTGGTCTTGAACTTTCTT10.8333333333333334No Hit
CTGAAACATGCGTTTTCTGTAAAATACATGAAAAGCATTATTTTACATTCC10.8333333333333334No Hit
TCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTAAGCATGATCTCGTATGCCGT10.8333333333333334No Hit
GTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT10.8333333333333334No Hit
CACCCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGGTGCTTATTC10.8333333333333334No Hit
AGTTATTGTTCCTCGTCTATTCTGGAGAAATCACGATAAAGAGCTTTCCGT10.8333333333333334No Hit
CAACAAATCCTCAAGTGTTATTTCACCGAGTGTAGGCTGCTTATGAGTAGT10.8333333333333334No Hit
GAGTTATGGTTTCTTGTTGCAAAATCGTTATTATGATTCCTAAGCTTCTCG10.8333333333333334No Hit
GTGTCTGGTAGAGGTAGTGTAGATACTGAGAATCTTTCTGAGCTTTTTAAA10.8333333333333334No Hit
CCTTTGGCTCGCCTCCTAGAGCCCCTTATTTCTTTCTCATCATGGAAGTCC10.8333333333333334No Hit
ATGTTAAGTTGATACCAGCGACAGCAAAGGGGTATTCCCACACAGACCGAT10.8333333333333334No Hit
NCATTGGCTTTACCCGATAGAACTCGCGTCCGAGCTCCAGCTATCCTGAGG10.8333333333333334No Hit
GTCTAATATTGACAGTGGGGTGGTAAAATCTCCCACTATTATTGTGTGGGA10.8333333333333334No Hit
ATGGATAACAGGTTTATATTCCTGTACCGCTTAAAGTCGCTAATAGAGAAG10.8333333333333334No Hit
CACATTGCGTTAGCATCCGCAGGGACCATCGCAATGCTTTGTTTTAATTAA10.8333333333333334No Hit
TCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGTTCTACATCTCGTATGCCGT10.8333333333333334No Hit
GTTCTATCCTATTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAACC10.8333333333333334RNA PCR Primer, Index 44 (96% over 28bp)
CATATAACCAGGTAATCTCATAGCCTGTTCCCAATTAGGAATCGCAAGCTG10.8333333333333334No Hit
TAGTTACAATGCCAGGGTGAACGTAAAAATCACCTTTTCCATACATATCCT10.8333333333333334No Hit
AGCCTCAATTGTCTGTCTCTTACCTTCAGCTTTTCTCAAGTTAGCTTCTGC10.8333333333333334No Hit
GGGTAGGGGAGCGTCCTGCATGAGGTGAAGCTGCCACGGGAGTGTGTGGTG10.8333333333333334No Hit
CCTTAGATGATTTCCAACCCAAGTTTGATCTCTGTTCCTGGGTGCTACACT10.8333333333333334No Hit
ATCCTTATCAGCAACTACAGTTGGCTTTGACGCTCCAACAGCCATAATAGC10.8333333333333334No Hit
CAATGTAGCTATCATTCTCTGTCATCCCAGTTTCCTTATCTTTTAAACCTG10.8333333333333334No Hit
TTGTACTATTGTATGCATTAGCCAACTCCTCTAGGAAATCCTCCATAACCC10.8333333333333334No Hit
CTTTAAGTATCAGATTTCTGGAGCTGGAGCCCTGAGCAGACCTTGGGCACT10.8333333333333334No Hit
CCATCAAAATGTAAATCTTGGTAAGACTTTTGAAAGAGAATTGGGATATGG10.8333333333333334No Hit
AAGCATATCATTCGTTTCTTCGCGGCGTTGCAAGTAATCTTGATCTGTCTC10.8333333333333334No Hit
TATATTAACTCTCCTGCCCTGTGTCATAATTTAGTTAGAAGGGATCTTGAT10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCTCCGAGCCCACGGGACTGTTATACATCTCGTATGCCGTC10.8333333333333334No Hit
ATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGTA10.8333333333333334No Hit
GGCGAGGACCGATAGCGAACAAGTACAGTGATGGAACTGTCTCTTATACAC10.8333333333333334No Hit
ACATGGGGCAATGAAATGCATATTCAATGGAGTGGTTCAACAACATGACGT10.8333333333333334No Hit
CTTATACACATCTCCGAGCCCATGAGACCATCAGACATCTCGTATGCCGTC10.8333333333333334No Hit
TTGCATTGTTGGTCGCAACTTTGGTTCTTATGTAACGCATGAGACAAACCA10.8333333333333334No Hit
GCTAGAATATCATCACTTTGCATATAGAAACGAATCTGAACATCTGTTCTC10.8333333333333334No Hit
AGACTACTTACGACACAAGACTGAGATTCTGTCTCAATCGCATACTATGAT10.8333333333333334No Hit
CTCCAATTCCTTGGTCTCAGGATCTTCAGAAGAACTTGCTTTCTCCTTTTC10.8333333333333334No Hit
AAGGAGAACTAATAGCAAGTTCAATGGTGTGATATTGAAGAGGCTTTTCAT10.8333333333333334No Hit
CCCACCGAGAGCGTGTGCACCGGCCGCCGCGGATCGATCTCCAGCCCGTAC10.8333333333333334No Hit
ACCTCGCGGTACTTGTTCGCTATCGGTCTCTCGCCCGTATTTAGCCTTGGA10.8333333333333334No Hit
GTATTCAAAAACCGATGCTTTTCCATCTTCTGCAAAAGAGGCTGCTGCTGC10.8333333333333334No Hit
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACATG10.8333333333333334No Hit
CAGTACCTATTTAGACCTAGAGTCCAATCTCTCATTTCTTCTTTGCTCCTT10.8333333333333334No Hit
ATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCTTAGTAACTGT10.8333333333333334No Hit
GATTCTAAGTGATAAGCCTTCTAAAAGAGTCTTCTTTATCTGTTTGGTTTA10.8333333333333334No Hit
GTTGTAATACTGTAACATCTAGGTACATATGGTGGCTGTCTCTTATACACA10.8333333333333334No Hit
GTCCAGGCATTAAACATGGAGAAATTAAGGTTGTACTTATCTGGACTCTTC10.8333333333333334No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGAGTTTGTGGTGGTGATTGACCCTGGCCGCT10.8333333333333334No Hit
GGGTAGAAGTTTTGAATGTGATGAGTTTGCGTGTGAAATTGACAAAAATTT10.8333333333333334No Hit
GTATGCATGTCTGTGTATCTATGTGTGTATACATGTCTGTGTGAATGTATA10.8333333333333334No Hit
GCTAAGAGGGGAATATGAGTATTCATTCTTCCTCTACGATCTTGCTTCTGT10.8333333333333334No Hit
CCATTTTCTCAGTGATTGAAACAAATTATCGAAGACAGAGATCTCTAGTAA10.8333333333333334No Hit
CATCTAAGGGTCTTAAGAGAAACAAGTGAGAAGAAAAAAACAGTTACGGTT10.8333333333333334No Hit
ACGTGCGGTGCTCTTCCAGCCGCTGGACCCTACCTCCGGCTGAGCCGTTTC10.8333333333333334No Hit
ATCTGAGAGAGTCTATGGTTTTAGTGTTTTATTGTAGAAAGGCAGGTAGAA10.8333333333333334No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGTAGCCTGGAGCTCTATGGGACAGCAGGTGGGC10.8333333333333334No Hit
GGGTGAGAGCCCCGTCGTGCCCGGACCCTGTCGCACCACGAGGCGCTGTCT10.8333333333333334No Hit
TTATTTAATTGGCAACATTTTATGGCAAGTACAAAGACTGTCTCTTATACA10.8333333333333334No Hit
ATAATAAAAAGTCTCAGAGATATCCAAACAGGAGGGAGAGAGAAAGTCACA10.8333333333333334No Hit
TTCAATACCAGTGTGTGATCCTTTCCATAGAGCAGAAGGAACAGCAACTGT10.8333333333333334No Hit
GTACATATATATCATGGAATACCACTCACCAATGCATAGGAATGAACCTGT10.8333333333333334No Hit
ATGTACACTCACACAACCTTATCTTTAGATGAAACGACGAAACGAAAAGAC10.8333333333333334No Hit
GTCTTTGTGTATGTCCCTGTGTTTTTGTTTGTCTGTGCCTATGTGTCTGTG10.8333333333333334No Hit
CTTCTTAGGATCTTGTTGCTCTTTTTTTCTTCTCCTTTTCTCTATTGTTGG10.8333333333333334No Hit
GAGTAATCCAGGTCGGTTTCTATCTACTTCAAATTCCTCCCTGTACGAAAG10.8333333333333334No Hit
GGCAACGTATCCTCTCTTAAGATCCTTGACAGCAACATTCTTGACATTGAA10.8333333333333334No Hit
GTACGGGGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA10.8333333333333334No Hit
TTTCTCAGCCATCTTGGCGAATAGCATTGGCCAGTATGACTCAATGGTAAC10.8333333333333334No Hit
GTGATATTTTGTATGCTTTTAAGTTGCATGATACACTGAACTACTCTCTTG10.8333333333333334No Hit
CAATTGAGAACTTCGAGGTCTGTATGTAAAATTTCTAAATGCGATTTTCGC10.8333333333333334No Hit
TCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGCCTGTTATACATCTCGTATGCCGT10.8333333333333334No Hit
TATACATCCATTCTGGAAGTCAGTCCGGAGGTTCTTCAGAAAACAGAACAT10.8333333333333334No Hit
GTGGAGTATGTGTCTTTCTTACTAGTTGGAACATCTTCTGGGTATATGCCC10.8333333333333334No Hit
GTACCATTAGATTATGATTCATTTATCGCCTAGAGTCTGTCTCTTATACTC10.8333333333333334No Hit
TCGTTAAGAACACTGATTCTTACCATCTTGCCTTAAGCTCAATCCTCTAAC10.8333333333333334No Hit
GGTACCACCCCGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATTTCCGA10.8333333333333334No Hit
CGGATTAGGTGTACGTCCACATCGATACTCCTCAATAATGTAGGAAACAAC10.8333333333333334No Hit
ACTTAAGCTAAACTGAGCGTACAAAAAGCCTCTATATGTCCTGTCTCTTAT10.8333333333333334No Hit
GCATAGACGAACGTTTAATTATTGGCTCTTATTGTGCTGTCTCTTATACAC10.8333333333333334No Hit
GTTATAACAAGCACCGTATTTGGTAGACAAAACTTGAAGTTTAAAAAGCAC10.8333333333333334No Hit
ATATCAACGAGAAGGGTGAGAAGGTTTACACAACTAAGAAGGAATCACCGC10.8333333333333334No Hit
CACCCTCTCTGGCGCCCCTTTCCAGGGATCTTAGGCCCGGACCGTCGCTGA10.8333333333333334No Hit
CTCGACTACGGAGCTTATCCCCCGCAGTCTCACTGCCGCGCTCTCACTTCC10.8333333333333334No Hit
CAGCATAAATATGTGTGCCATCTCATGTGCAATTCCTTATAGACCTGTCTC10.8333333333333334No Hit
GTGTGGATATTAATTACAAAGAGTGGCAGGGAGTAATGTATCTGTCTCTTA10.8333333333333334No Hit
AAATTGAATAGGTGTGTACAACAAAGAGGAAACTGATATGACTGGAACAAC10.8333333333333334No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGCCACAGGGGGGACAAAGGTCCTCCCTGTGGC10.8333333333333334No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTAAAACCC10.8333333333333334No Hit
ATCAACGCAGAGTACGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTGCACCTAT10.8333333333333334No Hit
GTGCAGGAATCTTGACCTGCTGTCCATCGGCTGCGCCGTTCGGCCTCACCT10.8333333333333334No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers