FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_3_93.3410000000abdd.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_3_93.3410000000abdd.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC41

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGAATTGGGATTCCTATTGGAAAGCTCGACATGTATGTCGCTGCTGCAGG14.166666666666666No Hit
TACTGAGATGTTTCAGTTCCCTGAGTTCCCATCCTTGCGGATACCTCTTAC14.166666666666666No Hit
GGTTTTTGGATATGGCGTCGAAGCGGATCTTGAAGGAATTGAAGCTGTCTC14.166666666666666No Hit
ATGGAAGAAGAAGCAGTCTTTCTTTTAATCTCCGCCAGCTTCCTACCCGCT14.166666666666666No Hit
GTACGAAAACCTCGTATCTATTTCTCCCCACATATCTCCTGAGAAGGATCC14.166666666666666No Hit
TCGTACCAGTCTTTCTTAGAAAATGGATCGACCACTTTCTTCTTAGCCTGT14.166666666666666No Hit
CACTTGTGTTATCGTCTCAAACAGTTTCAGATACTTGGATTTTGGTTCTCA14.166666666666666No Hit
ATCTAAATATTTGAATCCCGAGATACGTCTCGCCAATGACGTCTTCTTTAC14.166666666666666No Hit
GGTTTGGATAGAACCACTGCATATCATATAAGTATGATGGCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
CTCTCGCTTGTTATGCTTCTACTTGGTTTTGTGTGTTCTCTATTTTGTTCT14.166666666666666No Hit
TTCTTGTATAAACCTAAAGTTGCATGACTGCATTGAGCTGCAATCTTCCCT14.166666666666666No Hit
GCATAAACGTAGTAACGGATTGGTTGCTCTTATTGAAATCAAGTATAGATA14.166666666666666No Hit
GTATGATCCCGAGCTGCAACAAAGATCTCTTCTGTTCCAGATTGAATATCC14.166666666666666No Hit
GTCTATTGGGCATAGTCCTGAGGGAAAGAAGGGTATGTACTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
GAAAGGATCAATCCCTTCAACTCCAAATATCATATGTTCTGCTGAGAAGTC14.166666666666666No Hit
CTTATGAAGGTAAAAAAAAGAGGAAAACGTAATAGAGCGTTTCTAATTTCT14.166666666666666No Hit
GTCTGTACCAGTCTCAAAGACCTGAGAAGCAGAGGCAATTCTAAGGGTGGC14.166666666666666No Hit
CTATAACTCTGGTCTACTATATTCTTCTTGGCCTTTGAATTGGTCCCTTCA14.166666666666666No Hit
GTAGAATAATCTCCTTCGTTTCTTCTACATTGGTGTTTAATTCTCAGCAGA14.166666666666666No Hit
CATCAAGGAACTGTTTGCTGAAGTTGGAGAACTTAAACGCTACACAGCCTG14.166666666666666No Hit
GAAGAAAGAGCTTGCACCAAACTATGCTGCATATAATCCATTTGGTGTCGA14.166666666666666No Hit
TTACTACACAGTGTAGTGACTGGGAGTTTCAATGTCCAAGCCCTTTAGCTT14.166666666666666No Hit
ATTGTTAACCTTGTGTTTCGCTGTTTTTTGCTTGGTGCTATGATCTTCAAC14.166666666666666No Hit
CCTCAGGAGCAGCAGCAGCACCAGCAATTATAGCATCTCCACCGGTAGGCA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)