FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_3_91.3410000000abb3.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_3_91.3410000000abb3.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC40

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCTCAGGGGAGCTTCATGATCAATGGTGATAACTGGAGTTCAACAGATCCT14.166666666666666No Hit
GTTCTGATTATTATGTTTTGGGTGGAATTTCTTTTCTGGTCCAGTCTATTT14.166666666666666No Hit
GTGATAATCATCTTCTTCGTTTATGAATGTGTTTTGGTTTTTAATTTCGTC14.166666666666666No Hit
GTGTTATTATTTCCTGCGACTATTTGTACTCTTCTTTTCCTGTCTCTTTAC14.166666666666666No Hit
CCTTTAGACTCCTTACTCTCTCTTTCAATGGAAACTCAGGAGATGTCACGA14.166666666666666No Hit
GTATCCTCATGAACTACACTTCTCCTTCTCCCCATGATTCTACTAAACAAG14.166666666666666No Hit
TAATAGCGTAGCATTCTCTTTATTCTCAACAGCATATGCTGCTGAACAAGA14.166666666666666No Hit
ATTCCATTCCATTCCATTCCATTCAATTCCATTCCATTACAATTCGTTCCA14.166666666666666No Hit
TTCAAAATACTGAGAATTCGAATCAATTTCTGACTTTCTTCTTGGATTGAG14.166666666666666No Hit
GCTTGAAATCTAATCAGAGAAAATACCCCAAGGATAAACCATGCAGCTGCT14.166666666666666No Hit
TTGGTTAACCGTATTCTGAAACACGGAAAAAAATCATTGGCTTATCAAATT14.166666666666666No Hit
GATTCCTTGCTTCATTTTTCGTCACCCTAGCCGCTTTACTCTCTTGCGATA14.166666666666666No Hit
CAACACTCTTGTTTTCATTGTTGACATTCGTGCTGACAAGAAGAAGATTAA14.166666666666666No Hit
ATTGAAGATTGTGGTGAGCTCAAGAACCCAAGTTCATAAGTTTCTTAAAAC14.166666666666666No Hit
GTTTATATCTCCCCTGTTTATATCTCCCTTGTTTATATCTCCCCCTGTCTC14.166666666666666No Hit
GCCCAAGGCTGTTAAGGCTCTTAAAGAGAGTAACGGAGATATTGTTTCCGC14.166666666666666No Hit
CGCCCAGGCGGAACGATACGGCAGCGCCGAAGGAGCCTCGGTTGGCCCCGG14.166666666666666No Hit
TTATTACCACGAGATTGATGGTGAAAGTGGTGGTGATTCGGATATTGACTG14.166666666666666No Hit
GGAATTATTGGGTAAGTAAGCTTCTGATTAAAGCAGCTTGTGCAGTGTCTG14.166666666666666No Hit
CTTTCTCTCTTGATCTCTCTCTATTTATCTCCCTTTTTGACCATTCACAAT14.166666666666666No Hit
ATACAGAGAGAAGTATCTTCAGGAGTGTTGGCCTAGAGCTGTCTCTTATAC14.166666666666666No Hit
AGCCTGAAGATCCCTTTGTTGAGCAAGAAGCTTCATCTCAACAACTTTATA14.166666666666666No Hit
CCCTTATAGACCACCGGGAAAAGTTCGCCTTTATAATGTAGTGATATGCCT14.166666666666666No Hit
CTTCTTGATCCATCAACTGCTCAATCTGAAGTGGTTCTGTCTCTTATACAC14.166666666666666No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.2)