FastQCFastQC Report
Wed 6 May 2015
H23V3BCXX l02n01 kb2_3_81.3410000000ab06.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH23V3BCXX l02n01 kb2_3_81.3410000000ab06.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length51
%GC42

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AACGCAGAGTACGGGATCCTCATGACTAACGATGTTGCTGAAACCAATCCC11.6666666666666667No Hit
CTTCATCTCTATTCTTAGGCCACTTAATAGGAACCTTGTATCCCTGTCTCT11.6666666666666667No Hit
GTTAACTGCTGCCGTTTTGGTTATCTAGGTTGTTCCGATCAATGACTGTCT11.6666666666666667No Hit
GCACTGGGCAGAAATCACATTGCGTTAGCACTGTCTCTTATACACATCTCC11.6666666666666667No Hit
TGTCTGACCTTAAAAAGGCACAACTCATTTGAATGTCAGAACCTGTCTCTT11.6666666666666667No Hit
ATGTTCCATCGCTCCCGTTCACCTAAGACTCTGTCTCTTATACACATCTCC11.6666666666666667No Hit
GCATCTTTTGTGTTTCGTCTTCTCTCACGTCCCGTACTCTGCGTTGATACC11.6666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGACAATTTAGTAATCTAATGTTCTAGAAATGTA11.6666666666666667No Hit
ACTCCGAGAAACGTAAAGGATAAACCAAAACCAATGAGGCCCAACCCACCT11.6666666666666667No Hit
CGATTACGGGAAACAGAAGAGGAAATAAGGCGATTAAAATAGAAGATAGGT11.6666666666666667No Hit
TCAAGTAACAGAGCAAATCTCCTTGACCTAACACCAAGACCCTTGTCTTTA11.6666666666666667No Hit
CCGTAATGCTGCTAGAGATCTTTTGACTCTTGATGAGAAGAGTCCAAGAAG11.6666666666666667No Hit
CCTATGAACAACAGAAACAACATAGGAACAAAAAAAGAAACTCTCTAAGAG11.6666666666666667No Hit
CTTAAATACGACCAGAAACAAACTAGAGAGAAAGAAATTTCTTAATCTTGA11.6666666666666667No Hit
AGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATCAACTAGCCCCGAAAACTGTCTCTT11.6666666666666667No Hit
ATCTTAAACCAAGGAACGTTCTTCTGGTTAATTCTAGTGCAGACCACTTGA11.6666666666666667No Hit
TTGATAAGCTGTGAACATGGGTCAGGAGAGATACAAGTAGCTGTCTCTTAT11.6666666666666667No Hit
CTTCATTACTCGCACCATGACCAAACCCTCCGACCCAACCAGAGACTCCCA11.6666666666666667No Hit
TTACAATACCCCGTCGCGTATTTAAGTCGTCTGCAAAGGATTCTACCTGTC11.6666666666666667No Hit
AGTCCCATCTCATCAAATCTTTCGCTTGTGTTTCTACCAGTCACATGTATT11.6666666666666667No Hit
GATACGAACCAAGAACTGTAGATTGATACCAGCCAACAGTGTTGTTGTCAA11.6666666666666667No Hit
TTCCAGTTGTTTGCTACGTTCTTTCAATATCGGCGAGTAAGGGACTTACGT11.6666666666666667No Hit
ATATCAAGGTATTTCACGGATGTTTTCACTCCCTTGTATTCTACACCTGTC11.6666666666666667No Hit
ACAATGCTGTAAACAAGGGTGTTGCAACAATAATGGTGTCTTACTCTGCCT11.6666666666666667No Hit
CTAATGTCAACAGCAATGGAAGCATTTGCCTTGACATTTTGAAAGAACAAT11.6666666666666667No Hit
GTAGTGAACCAGAGATGTGTGGCAATGGAGTTCGATGCTTTGCTAGGTTCA11.6666666666666667No Hit
ATAAGGCTCTTACTGCTGATGGAGGATACGCTGAATACTCTGATCCATTTG11.6666666666666667No Hit
TAGTTAAGGATCGAACTTTTCTTATTGATCTAACCAGGGATTATAGTATCC11.6666666666666667No Hit
ATTAGAATGTTATCGTTTTCAATGTCAAACTTCTCTGCGTTTTCATTATGT11.6666666666666667No Hit
TCGTCTCTACTTACATACAACTCATAAACGATTTTTTCTCAGAGGATTAGA11.6666666666666667No Hit
CCGATTCCGTCGTCAGAAGAATCCTCGTAAACAATCATGGGTAAGGTACAC11.6666666666666667No Hit
GTAGGCATCAGAAGAAGTAAGGTGAGACTTTTATGCTGATAGGCAAGGAGA11.6666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACGGGGTGGTATCACTGTCTCTTATACACATCTCCGA11.6666666666666667No Hit
GTGGTATCAACGCAGAGTACGGGAGACAGGTTAGTTTCTGTCTCTTATACA11.6666666666666667No Hit
ATATGAAGTAGAGGAAGAGAGGGTTTTGTTTAGGAGTGTCGATAATGTCTG11.6666666666666667No Hit
GTCTAAGTGGGAAAGGAGGTGGATATTCACAGACAACCAGGAGCTGTCTCT11.6666666666666667No Hit
CGCCCCCACACACTGAACTGAAGTTTGTGTTTTCAGTGTTGGGTTGAGAAC11.6666666666666667No Hit
CACGGTAGCTTCGCGCCACTGGCTTTTCAACCAAGCGCGATGACCAATTGT11.6666666666666667No Hit
GCTTATGATATGGTAGATCTCACCTAAGATGGTCTGAAACGCTTTCTCGAC11.6666666666666667No Hit
CCCCAGGTCAGGCGGGATTACCCGCTGAGTTTAAGCATATCAATAAGCGGA11.6666666666666667No Hit
GTCCTCAATAATGCTTGCCAATGTTTGCAAGAACTGTGCAAGATCAGCACC11.6666666666666667No Hit
CAATCTTCAAGAAGTAAAAACCATGTTTCTGATGCGTATAAAGACTGTCTC11.6666666666666667No Hit
CTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACGACGCTATATCTCGTATGCCGTC11.6666666666666667No Hit
GTTTTCGTATTTGCCCAATGCATAAATCCAAAAACAAGAACATTATACAAA11.6666666666666667No Hit
GATACCACCCCGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGA11.6666666666666667No Hit
TGATTGTTCGCATCGGATCTCAGGTTCTCTATTGCACTCCTGTCTCTTATA11.6666666666666667No Hit
GTACTGGTTCACTATCGGTCTCTCAGGAGTATTTAGCCTTACCGGATCTGT11.6666666666666667No Hit
GTCCAACATCAAGAAGAGCACGGAAAGGTCTTCTGGAATCAGTTGGTTCCA11.6666666666666667No Hit
AAGCATTCTCCATCTGTGTTGCCATATTACATAACACGGAAGTCTCAGATA11.6666666666666667No Hit
CATGGGTATAAGGTCTTGTGGGTTGGATGTGAAGGAGAGTACGAAGTCTAT11.6666666666666667No Hit
GTCTAGCAATATGAAGACTGCGGAATCAAAGCATTGGAACCATAGAGGCTG11.6666666666666667No Hit
ATACAAAGGACTATGTCCTGGTTTCTCCCACCTATTCTTGATGTTAAAATC11.6666666666666667No Hit
ACACGGGGTAGTTCGATGGCCATTACAGAATCCTGTCTCTTATACACATCT11.6666666666666667No Hit
AAATGAGGCTTCATCAAGTGCATCTATAAACAATAAAGAAGAAGAAGCAGT11.6666666666666667No Hit
ACTTTACACTATCTCGATTTGAGAAGTGAGAAGAGAAATCGCCATGAACAT11.6666666666666667No Hit
TGTCCAAATTGAAAGACCAACCATGTATCAAGTGGTGAAGGAAATGGTGGA11.6666666666666667No Hit
ATTCTGGCCATTGAGCAGATCCTTTGCTACAACCGAAGCCAAGCGACCTAG11.6666666666666667No Hit
GTACAAATTGAATGCTGGTCCTGAAAAGGAAGTTCAGTTTGTTATTGTCGG11.6666666666666667No Hit
CATTAGTATATGGAGAGTATCCAAAGACAATGCAGAACATTGTGAAAGAGA11.6666666666666667No Hit
GTCACAGACATATCAACCTTCTGGTCCATGTATTTAAGGACCTCAACCTGT11.6666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
TTCACTA50.045.08
CCGGATC50.045.042
TGGTTCA50.045.05
ACCGGAT50.045.041
GCCTTAC50.045.036
TTACCGG50.045.039
GTACTGG50.045.01
TCAGGAG50.045.023
GGTCTCT50.045.017
TCGGTCT50.045.015
TAGCCTT50.045.034
TATCGGT50.045.013
GGATCTG50.045.044
GTATTTA50.045.029
CTCTCAG50.045.020
GGTTCAC50.045.06
GTTCACT50.045.07
CGGATCT50.045.043
AGTATTT50.045.028
CTGGTTC50.045.04