##FastQC 0.11.2 >>Basic Statistics pass #Measure Value Filename H23V3BCXX l02n01 kb2_2_91.3410000000a533.fastq.gz File type Conventional base calls Encoding Sanger / Illumina 1.9 Total Sequences 30 Sequences flagged as poor quality 0 Sequence length 51 %GC 39 >>END_MODULE >>Per base sequence quality fail #Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile 1 35.36666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2 36.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3 35.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4 35.166666666666664 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5 35.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6 35.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7 37.266666666666666 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8 37.266666666666666 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9 37.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10 36.833333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11 37.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12 35.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13 34.63333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14 37.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15 37.166666666666664 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16 37.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17 36.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18 35.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 19 36.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20 37.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 21 38.46666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22 37.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23 37.43333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24 37.36666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25 35.63333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 26 36.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 27 34.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28 34.03333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29 35.53333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30 36.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31 35.766666666666666 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32 36.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33 36.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 34 35.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 35 33.733333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 36 36.666666666666664 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 37 37.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 38 36.93333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 39 35.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 40 37.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 41 35.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 42 36.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 43 37.03333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 44 36.86666666666667 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 45 36.233333333333334 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 46 37.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 47 38.03333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 48 36.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 49 35.13333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 50 38.333333333333336 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 51 36.03333333333333 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Per tile sequence quality fail #Tile Base Mean 2216 1 0.0 2216 2 2.0 2216 3 8.333333333333332 2216 4 -14.666666666666668 2216 5 2.0 2216 6 0.0 2216 7 1.3333333333333357 2216 8 -4.0 2216 9 0.0 2216 10 1.3333333333333357 2216 11 0.0 2216 12 0.0 2216 13 2.0 2216 14 -4.0 2216 15 2.0 2216 16 0.0 2216 17 2.0 2216 18 11.666666666666668 2216 19 2.0 2216 20 0.0 2216 21 2.0 2216 22 0.0 2216 23 -0.6666666666666643 2216 24 -4.0 2216 25 1.3333333333333357 2216 26 0.0 2216 27 7.666666666666668 2216 28 7.666666666666668 2216 29 -0.6666666666666643 2216 30 0.0 2216 31 -0.6666666666666643 2216 32 3.6666666666666643 2216 33 0.0 2216 34 0.6666666666666643 2216 35 7.666666666666668 2216 36 8.333333333333332 2216 37 3.6666666666666643 2216 38 2.6666666666666643 2216 39 0.0 2216 40 2.0 2216 41 2.0 2216 42 2.0 2216 43 0.0 2216 44 0.0 2216 45 2.0 2216 46 -0.6666666666666643 2216 47 -4.0 2216 48 -4.666666666666664 2216 49 -16.666666666666668 2216 50 -4.0 2216 51 10.333333333333332 2112 1 0.0 2112 2 2.0 2112 3 8.333333333333332 2112 4 4.333333333333332 2112 5 -4.0 2112 6 0.0 2112 7 -4.666666666666664 2112 8 2.0 2112 9 0.0 2112 10 -4.666666666666664 2112 11 0.0 2112 12 0.0 2112 13 2.0 2112 14 2.0 2112 15 -4.0 2112 16 0.0 2112 17 2.0 2112 18 3.666666666666668 2112 19 -4.0 2112 20 0.0 2112 21 -4.0 2112 22 0.0 2112 23 -0.6666666666666643 2112 24 2.0 2112 25 -4.666666666666664 2112 26 0.0 2112 27 -17.333333333333332 2112 28 -17.333333333333332 2112 29 -0.6666666666666643 2112 30 0.0 2112 31 -0.6666666666666643 2112 32 -7.333333333333336 2112 33 0.0 2112 34 -1.3333333333333357 2112 35 -17.333333333333332 2112 36 -16.666666666666668 2112 37 -7.333333333333336 2112 38 -5.333333333333336 2112 39 0.0 2112 40 -4.0 2112 41 -4.0 2112 42 2.0 2112 43 0.0 2112 44 0.0 2112 45 -4.0 2112 46 -0.6666666666666643 2112 47 2.0 2112 48 3.3333333333333357 2112 49 8.333333333333332 2112 50 2.0 2112 51 -14.666666666666668 1209 1 0.0 1209 2 -4.0 1209 3 -16.666666666666668 1209 4 10.333333333333332 1209 5 2.0 1209 6 0.0 1209 7 3.3333333333333357 1209 8 2.0 1209 9 0.0 1209 10 3.3333333333333357 1209 11 0.0 1209 12 0.0 1209 13 -4.0 1209 14 2.0 1209 15 2.0 1209 16 0.0 1209 17 -4.0 1209 18 -15.333333333333332 1209 19 2.0 1209 20 0.0 1209 21 2.0 1209 22 0.0 1209 23 1.3333333333333357 1209 24 2.0 1209 25 3.3333333333333357 1209 26 0.0 1209 27 9.666666666666668 1209 28 9.666666666666668 1209 29 1.3333333333333357 1209 30 0.0 1209 31 1.3333333333333357 1209 32 3.6666666666666643 1209 33 0.0 1209 34 0.6666666666666643 1209 35 9.666666666666668 1209 36 8.333333333333332 1209 37 3.6666666666666643 1209 38 2.6666666666666643 1209 39 0.0 1209 40 2.0 1209 41 2.0 1209 42 -4.0 1209 43 0.0 1209 44 0.0 1209 45 2.0 1209 46 1.3333333333333357 1209 47 2.0 1209 48 1.3333333333333357 1209 49 8.333333333333332 1209 50 2.0 1209 51 4.333333333333332 >>END_MODULE >>Per sequence quality scores pass #Quality Count 25 1.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 1.0 30 1.0 31 1.0 32 0.0 33 1.0 34 2.0 35 4.0 36 2.0 37 4.0 38 7.0 39 6.0 >>END_MODULE >>Per base sequence content fail #Base G A T C 1 30.0 23.333333333333332 20.0 26.666666666666668 2 10.0 43.333333333333336 26.666666666666668 20.0 3 10.0 23.333333333333332 36.666666666666664 30.0 4 16.666666666666664 13.333333333333334 36.666666666666664 33.33333333333333 5 3.3333333333333335 46.666666666666664 43.333333333333336 6.666666666666667 6 30.0 46.666666666666664 20.0 3.3333333333333335 7 36.666666666666664 30.0 20.0 13.333333333333334 8 16.666666666666664 36.666666666666664 40.0 6.666666666666667 9 36.666666666666664 13.333333333333334 20.0 30.0 10 23.333333333333332 33.33333333333333 33.33333333333333 10.0 11 40.0 16.666666666666664 40.0 3.3333333333333335 12 20.0 20.0 43.333333333333336 16.666666666666664 13 23.333333333333332 20.0 30.0 26.666666666666668 14 20.0 13.333333333333334 46.666666666666664 20.0 15 10.0 30.0 43.333333333333336 16.666666666666664 16 10.0 33.33333333333333 30.0 26.666666666666668 17 16.666666666666664 40.0 23.333333333333332 20.0 18 23.333333333333332 30.0 33.33333333333333 13.333333333333334 19 23.333333333333332 20.0 23.333333333333332 33.33333333333333 20 26.666666666666668 30.0 36.666666666666664 6.666666666666667 21 26.666666666666668 16.666666666666664 40.0 16.666666666666664 22 20.0 36.666666666666664 26.666666666666668 16.666666666666664 23 26.666666666666668 13.333333333333334 46.666666666666664 13.333333333333334 24 26.666666666666668 26.666666666666668 33.33333333333333 13.333333333333334 25 16.666666666666664 33.33333333333333 23.333333333333332 26.666666666666668 26 20.0 30.0 43.333333333333336 6.666666666666667 27 30.0 10.0 30.0 30.0 28 13.333333333333334 23.333333333333332 43.333333333333336 20.0 29 33.33333333333333 23.333333333333332 33.33333333333333 10.0 30 26.666666666666668 16.666666666666664 23.333333333333332 33.33333333333333 31 10.0 13.333333333333334 53.333333333333336 23.333333333333332 32 16.666666666666664 23.333333333333332 46.666666666666664 13.333333333333334 33 30.0 13.333333333333334 30.0 26.666666666666668 34 13.333333333333334 33.33333333333333 36.666666666666664 16.666666666666664 35 10.0 26.666666666666668 43.333333333333336 20.0 36 33.33333333333333 16.666666666666664 23.333333333333332 26.666666666666668 37 23.333333333333332 33.33333333333333 23.333333333333332 20.0 38 30.0 13.333333333333334 40.0 16.666666666666664 39 16.666666666666664 16.666666666666664 43.333333333333336 23.333333333333332 40 23.333333333333332 16.666666666666664 43.333333333333336 16.666666666666664 41 26.666666666666668 23.333333333333332 40.0 10.0 42 3.3333333333333335 23.333333333333332 36.666666666666664 36.666666666666664 43 20.0 13.333333333333334 40.0 26.666666666666668 44 10.0 20.0 53.333333333333336 16.666666666666664 45 6.666666666666667 30.0 30.0 33.33333333333333 46 10.0 26.666666666666668 40.0 23.333333333333332 47 16.666666666666664 30.0 40.0 13.333333333333334 48 6.666666666666667 40.0 23.333333333333332 30.0 49 6.666666666666667 33.33333333333333 46.666666666666664 13.333333333333334 50 16.666666666666664 33.33333333333333 20.0 30.0 51 3.3333333333333335 26.666666666666668 33.33333333333333 36.666666666666664 >>END_MODULE >>Per sequence GC content fail #GC Content Count 0 0.0 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.5 31 1.0 32 1.5 33 2.0 34 3.0 35 4.0 36 4.5 37 5.0 38 5.0 39 5.0 40 7.0 41 9.0 42 5.5 43 2.0 44 1.0 45 0.0 46 0.5 47 1.0 48 0.5 49 0.0 50 0.0 51 0.0 52 0.0 53 0.0 54 0.0 55 0.0 56 0.0 57 0.0 58 0.0 59 0.0 60 0.0 61 0.0 62 0.0 63 0.0 64 0.5 65 1.0 66 0.5 67 0.0 68 0.0 69 0.0 70 0.0 71 0.0 72 0.0 73 0.0 74 0.0 75 0.0 76 0.0 77 0.0 78 0.0 79 0.0 80 0.0 81 0.0 82 0.0 83 0.0 84 0.0 85 0.0 86 0.0 87 0.0 88 0.0 89 0.0 90 0.0 91 0.0 92 0.0 93 0.0 94 0.0 95 0.0 96 0.0 97 0.0 98 0.0 99 0.0 100 0.0 >>END_MODULE >>Per base N content pass #Base N-Count 1 0.0 2 0.0 3 0.0 4 0.0 5 0.0 6 0.0 7 0.0 8 0.0 9 0.0 10 0.0 11 0.0 12 0.0 13 0.0 14 0.0 15 0.0 16 0.0 17 0.0 18 0.0 19 0.0 20 0.0 21 0.0 22 0.0 23 0.0 24 0.0 25 0.0 26 0.0 27 0.0 28 0.0 29 0.0 30 0.0 31 0.0 32 0.0 33 0.0 34 0.0 35 0.0 36 0.0 37 0.0 38 0.0 39 0.0 40 0.0 41 0.0 42 0.0 43 0.0 44 0.0 45 0.0 46 0.0 47 0.0 48 0.0 49 0.0 50 0.0 51 0.0 >>END_MODULE >>Sequence Length Distribution pass #Length Count 51 30.0 >>END_MODULE >>Sequence Duplication Levels pass #Total Deduplicated Percentage 100.0 #Duplication Level Percentage of deduplicated Percentage of total 1 100.0 100.0 2 0.0 0.0 3 0.0 0.0 4 0.0 0.0 5 0.0 0.0 6 0.0 0.0 7 0.0 0.0 8 0.0 0.0 9 0.0 0.0 >10 0.0 0.0 >50 0.0 0.0 >100 0.0 0.0 >500 0.0 0.0 >1k 0.0 0.0 >5k 0.0 0.0 >10k+ 0.0 0.0 >>END_MODULE >>Overrepresented sequences fail #Sequence Count Percentage Possible Source TCCTTGATGGGTAGTTTGGCCCTATATTTCTTGATGAGGAACTTCTTAAGC 1 3.3333333333333335 No Hit TACTAAGGGAATCCTTGTTAGTTTCTTTTCCTCCGCTTATTGATATGCTTA 1 3.3333333333333335 No Hit GAATTAAAGGAGACAAGAAAAAGGAAGTTGTTCTAGGACTAAAGGATTAAT 1 3.3333333333333335 No Hit GCATTGATGTTGTTATCGCGTAAATACTTGCTTATCATGTCCGTCTCATAC 1 3.3333333333333335 No Hit CACATATTCAGTTGCCTACTGATGCTTAGGTGGATTTCTCTACTCTTTTAT 1 3.3333333333333335 No Hit AAAGCACAGATTCCAATTGTTCCTCTTTACCATTAGAGCTGTCTCTTATAC 1 3.3333333333333335 No Hit AACCATGAGATTGAGAACGGTGTGTGGAAAAGTAACCTTTTCTCTGTCTCT 1 3.3333333333333335 No Hit CAGCAGACAATGAAAAAAATCAAATACCATTCCTTCTGTCTCTTATACACA 1 3.3333333333333335 No Hit CTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGACTGCTGGCGGAAAATGAGAAAATT 1 3.3333333333333335 No Hit GATTTCTTAGTCATAGACCTCTTAAACTGCTTCCTGTCTCTTATACACATC 1 3.3333333333333335 No Hit AGGTAGATTTGATGCATATGGTTTCTTTCTTGTTGAGAGAGAGAAAGGCTA 1 3.3333333333333335 No Hit GATTTAGACTGCATTTATCAAGCTATATGTGGCTGGCTGTTTTTAAACTGT 1 3.3333333333333335 No Hit AGTAAGGTTTGTCTCCAAGCTCAGATTCAAGAGTCTTGAGTATCTCAATGA 1 3.3333333333333335 No Hit GTAGTAGTTTGTTGTAAGCGTTGTAGCTCTCTCTACCTGTCTCTTATACAC 1 3.3333333333333335 No Hit GCCCTAGAGATAGTTGGAAAAAGGCTGAAGAAGAATAGTGTCTCTCTTGAT 1 3.3333333333333335 No Hit CTTGATGACTGGTTTCATGAGTTTGTCTTCTTCAAGAGCTGTCTCTTATAC 1 3.3333333333333335 No Hit GAGTAACATGTCCTACATCTTCGAAGCTACTATACGAACTGTCTCTTATAC 1 3.3333333333333335 No Hit CTAAAGAAGAACTTCACTTTCTTGGCTAGCTCTTCCTGTCTCTTATACACA 1 3.3333333333333335 No Hit AATCCATTCTGATTTCTTTTGATTGTCCCCGTACTCTGCGATGATCTGTCT 1 3.3333333333333335 No Hit CTCCATCCGGTTGCGCTGTGTGGCCGGAGCCCTGCAACCGATGGAGGTTCT 1 3.3333333333333335 No Hit CTTTTATTGTTTCGTTCATGTGTGTTCGTTTTTGTTATTGAAACCCCTGTC 1 3.3333333333333335 No Hit TCCCAAGAGGGTTCTTCGGTCCTCAACCTCTTATTAATCTGTCTCTTATAC 1 3.3333333333333335 No Hit GATATGGGTTTAGATGCTGTGACTTTGGGGAAAATCACTGGATGTTCACTA 1 3.3333333333333335 No Hit TTTTTTAGCAGAAACAGGAGAAAGATGAGATAGATACCTGTCTCTTATACA 1 3.3333333333333335 No Hit CACCGAATCCTTCTTCTGAATTTCAATAGGTCTTATGTTCTCTTTCCCAGC 1 3.3333333333333335 No Hit ACATATTGCAGGGGAACAAAGAGAGCATTTTGAGAAGTATACGAAAGCAGG 1 3.3333333333333335 No Hit TTTCAGAACTGTGCATGTCATGTAATGTGATACATGGTAAGCTTCAATACT 1 3.3333333333333335 No Hit TCTCTGCTTCTGCTTTAACTGGTTCAGGTGATGCTGGTTTCTCTTCAACAA 1 3.3333333333333335 No Hit AGCCAAGGAACCGTGTACCTTACCCATGATCTGTCTCTTATACACATCTCC 1 3.3333333333333335 No Hit GAAGAAGTACATCTTCACTATTGATGGCGATTGCTTCGTTGCTAAGGATCT 1 3.3333333333333335 No Hit >>END_MODULE >>Adapter Content fail #Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA Adapter Nextera Transposase Sequence 1 0.0 0.0 0.0 2 0.0 0.0 0.0 3 0.0 0.0 0.0 4 0.0 0.0 0.0 5 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 0.0 7 0.0 0.0 0.0 8 0.0 0.0 0.0 9 0.0 0.0 0.0 10 0.0 0.0 0.0 11 0.0 0.0 0.0 12 0.0 0.0 0.0 13 0.0 0.0 0.0 14 0.0 0.0 0.0 15 0.0 0.0 0.0 16 0.0 0.0 0.0 17 0.0 0.0 0.0 18 0.0 0.0 0.0 19 0.0 0.0 0.0 20 0.0 0.0 0.0 21 0.0 0.0 0.0 22 0.0 0.0 0.0 23 0.0 0.0 0.0 24 0.0 0.0 0.0 25 0.0 0.0 0.0 26 0.0 0.0 0.0 27 0.0 0.0 0.0 28 0.0 0.0 0.0 29 0.0 0.0 0.0 30 0.0 0.0 0.0 31 0.0 0.0 3.3333333333333335 32 0.0 0.0 3.3333333333333335 33 0.0 0.0 3.3333333333333335 34 0.0 0.0 6.666666666666667 35 0.0 0.0 6.666666666666667 36 0.0 0.0 13.333333333333334 37 0.0 0.0 16.666666666666668 38 0.0 0.0 20.0 39 0.0 0.0 33.333333333333336 >>END_MODULE >>Kmer Content pass >>END_MODULE